fa بررسی بیوانفورماتیکی و شناسایی نقش osa-miR164 در پاسخ به تنش غیر زیستی در برنج ژنتیک گیاهی Subject 01 پژوهشی کامل Applicable <h1 dir="RTL" style="text-align:justify"><span style="font-family:Tahoma;"><span style="font-size:9pt"><span style="direction:rtl"><span style="unicode-bidi:embed">MicroRNA<span style="font-size:10.0pt"> (</span>miRNA<span lang="FA" style="font-size:10.0pt">)</span> <span lang="FA" style="font-size:10.0pt">گروه بزرگی از </span>RNA<span lang="FA" style="font-size:10.0pt">‌های کوچک و غیر‌‌کد‌کننده (~ 22 نوکلئوتید) هستند که در تنظیم پسا‌رونویسی بیان ژن به‌</span><span lang="FA" style="font-size:10.0pt">‌</span><span lang="FA" style="font-size:10.0pt">صورت برش </span>mRNA<span lang="FA" style="font-size:10.0pt"> هدف و یا مهار ترجمه نقش دارند. مطالعات نشان داده‌</span><span lang="FA" style="font-size:10.0pt">‌</span><span lang="FA" style="font-size:10.0pt">اند که </span>miRNA<span lang="FA" style="font-size:10.0pt">‌ها نقش مهمی در افزایش تحمل گیاهان به شرایط نامطلوب محیطی دارند. در این مطالعه خانواده </span>miR164<span lang="FA" style="font-size:10.0pt"> در برنج (</span><i>Oryza</i> <i>sativa</i><span lang="FA" style="font-size:10.0pt">)، مورد بررسی قرار گرفت.</span> <span lang="FA" style="font-size:10.0pt">با استفاده از روش‌های بیوانفورماتیک، توالی‌ کلیه </span>osa-miR164<span lang="FA" style="font-size:10.0pt"> متعلق به خانواده </span>miR164<span lang="FA" style="font-size:10.0pt"> برنج تجزیه و تحلیل شده، و پروفایل بیانی </span>osa-miR164<span lang="FA" style="font-size:10.0pt"> تحت شرایط تنش‌های غیر‌زیستی مختلف ارزیابی شد. سپس عناصر تنظیمی سیس بر روی پیشبر‌های ژن </span>osa-miR164<span lang="FA" style="font-size:10.0pt"> پیش‌بینی شده و به‌طور همزمان ژن‌های هدف </span>miR164<span lang="FA" style="font-size:10.0pt"> و عملکرد آن‌ها شناسایی شد. نتایج این مطالعه نشان‌ می‌دهد نقاط حفاظتی زیادی در توالی‌های </span>osa-miR164<span lang="FA" style="font-size:10.0pt"> بالغ وجود دارد که در توالی‌های پیش‌ساز دیده نمی‌شود. بنابراین الگوهای بیانی متفاوت اعضای خانواده ژنی </span>osa-miR164<span lang="FA" style="font-size:10.0pt"> تحت شرایط تنش و عناصر تنظیمی متعدد سیس موجود در پیشبرهای ژن </span>osa-miR164<span lang="FA" style="font-size:10.0pt"> ممکن است توضیحی برای الگوی بیانی متنوع </span>osa-miR164<span lang="FA" style="font-size:10.0pt"> باشد. در این تحقیق</span> <span lang="FA" style="font-size:10.0pt">برخی از ژن‌های هدف بالقوه </span>osa-miR164<span lang="FA" style="font-size:10.0pt"> شناسایی و بیان آن‌ها در شرایط تنش‌های مختلف مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت. در مجموع یافته‌های این پژوهش منبع با ارزشی برای شناسایی و ارزیابی بیشتر میان کنش بین ژن‌های هدف خانواده </span>osa-miR164<span lang="FA" style="font-size:10.0pt"> در پاسخ به تنش‌های غیر زیستی فراهم می‌کند. </span></span></span></span></span></h1> <span style="font-family:Tahoma;"><span style="font-size:10pt"><span style="line-height:150%"><span style="direction:rtl"><span style="unicode-bidi:embed"><span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span style="line-height:150%"><span style="font-family:"B Lotus""></span></span></span></span></span></span></span></span><br> &nbsp; <span style="font-size:11pt"><span style="line-height:107%"><span calibri="" style="font-family:"><span style="font-size:12.0pt"><span style="line-height:107%"><span new="" roman="" style="font-family:" times="">MicroRNAs (miRNA) are small (22 nucleotide) non-coding RNA molecules that post-transcriptionally regulate gene expression. Previous research has shown that miRNA plays an essential role in plant tolerance to adverse environmental conditions. In our study, we focused on the miR164 family in rice (<i>Oryza</i> <i>sativa</i>), an important food crop. We used a bioinformatics approach to analyze the sequences of all osa-miR164 of the miR164 family of rice, evaluate the expression profile of osa-miR164 under different stress conditions, predict cis-regulatory elements at the promoters of osa-miR164 genes, and simultaneously predict the miR164-targeted genes and their expressions. The results showed that the mature osa-miR164 sequences are highly conserved, but the precursor sequences are highly variable. The variation in the precursor sequences of osa-miR164 genes resulted in different expressions under stress conditions. In addition, different cis-regulatory elements in the promoter sequences of osa-miR164 genes could explain the different expression patterns of osa-miR164 genes. Some possible osa-miR164 target genes were discovered and their expression were studied under different stress conditions. Overall, the results of this study provided a valuable resource for further identification and evaluation of the interaction between osa-miR164 family target genes in response to abiotic stress.</span></span></span></span></span></span><br> &nbsp; miR164, RNA غیر کد کننده, برنج, پاسخ به تنش غیر زیستی miR164, microRNA, non-coding RNA, rice, Oryza sativa 295 306 http://mg.genetics.ir/browse.php?a_code=A-10-374-1&slc_lang=fa&sid=1 Zahra Ghorbanzadej زهرا قربانزاده ghorbanzadezahra@yahoo.com 10031947532846007231 10031947532846007231 No Agricultural Biotechnology Research Institute of Iran (ABRII), Agricultural Research Education and Extension Organization (AREEO), Karaj, Iran پژوهشگاه پژوهشگاه بیوتکنولوژی کشاورزی (ABRII)، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج Rasmieh Hamid رسمیه حمید r.hamid@areeo.ac.ir 10031947532846007232 10031947532846007232 No Department of Plant Breeding, Cotton Research Institutes of Iran (CRII), Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Gorgan, Iran. 2- موسسه تحقیقات پنبه کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، گرگان، ایران MohammadReza Ghaffari محمدرضا غفاری mrghaffari52@gmail.com 10031947532846007233 10031947532846007233 Yes Agricultural Biotechnology Research Institute of Iran (ABRII), Agricultural Research Education and Extension Organization (AREEO), Karaj, Iran پژوهشگاه پژوهشگاه بیوتکنولوژی کشاورزی (ABRII)، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج Ghasem Hosseini Salekdeh قاسم حسینی سالکده h. salekdeh@abrii.ac.ir 10031947532846007234 10031947532846007234 No Agricultural Biotechnology Research Institute of Iran (ABRII), Agricultural Research Education and Extension Organization (AREEO), Karaj, Iran پژوهشگاه پژوهشگاه بیوتکنولوژی کشاورزی (ABRII)، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج