دوره 18، شماره 1 - ( 3-1402 )
جلد 18 شماره 1 صفحات 95-85 |
برگشت به فهرست نسخه ها
Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
aghaei jeshvaghani Z, Hosseini R. Isolation, Molecular Cloning and Bioinformatics Evaluation of htrB Serine Protease Gene Extracted from Bacillus licheniformis. MGj 2023; 18 (1) : 8
URL: http://mg.genetics.ir/article-1-1638-fa.html
URL: http://mg.genetics.ir/article-1-1638-fa.html
آقایی جشوقانی زهرا، حسینی رامین. جداسازی، همسانه سازی مولکولی و بررسی بیوانفورماتیکی ژن سرین پروتئاز htrB استخراج شده از Bacillus licheniformis. فصلنامه علمی ژنتیک نوین. 1402; 18 (1) :85-95
دانشگاه بین المللی امام خمینی (ره)
چکیده: (675 مشاهده)
پروتئازها از مهمترین آنزیمهای صنعتی محسوب میشوند. معمولاً برای تولید این آنزیمها برای مصارف صنعتی از باکتریهای متعلق به جنس باسیلوس استفاده میشود. هدف از این پژوهش جداسازی، همسانهسازی، تعیین توالی و بررسی بیوانفورماتیکی ژن سرین پروتئاز htrB استخراج شده از باکتری باسیلوس لیکنیفورمیس بود. در این مطالعه، پس از استخراج DNA باکتریایی، یکی از ژنهای سرین پروتئاز با نام htrB از باکتری Bacillus licheniformis با استفاده از تکنیک واکنش زنجیره‌ای پلی‌مراز جداسازی شد. قطعه تکثیر شده به طول 1371 نوکلئوتید در ناقلpTG19-T همسانهسازی شد و درستی همسانهسازی به‌وسیله توالی‌یابی تأیید شد. سپس ژن همسانهسازی شده موجود در پلاسمید نوترکیب pTG19-T-htrB، در ناقل (+) pET41a همسانهسازی شد. ساختار مولکولی، ویژگی‌های بیوشیمیایی و فیلوژنتیکی پروتئین کد شده توسط این ژن مورد بررسی قرار گرفت. این ژن پروتئینی با 456 آمینواسید را کد می‌کند که وزن مولکولی محاسبه شده و نقطه ایزوالکتریک پیش‌بینی شده آن به‌ترتیب برابر 66/48 کیلو دالتون و 85/4 می‌باشد. بررسی‌ها نشان داد که آنزیم مذکور در دسته آنزیمهای پایدار قرار گرفته و در باکتری اشرشیاکلای به‌صورت محلول بیان خواهد شد. بر اساس نتایج حاصل از بررسی‌های فیلوژنتیکی، توالی پروتئینی به‌دست آمده شباهت زیادی را با توالی‌های سایر باسیلوسها از قبیل B. subtilis، B. gobiensis وB. pumilus نشان داد. ساختار سه بعدی آنزیم کلون شده با استفاده از ابزارهای PyMOL، PHYRE2، I-TASSER، RAPTORX و Modeller پیش‌بینی شد. پس از ارزیابی مدلهای ترسیم شده مشخص شد که مدلهای ارائه شده توسط دو نرم‌افزار PHYRE2 و RAPTORX مدلهای مطلوبی برای پیش‌بینی ساختار سه بعدی این پروتئاز هستند.
شماره‌ی مقاله: 8
نوع مطالعه: پژوهشی کامل |
موضوع مقاله:
ژنتیک ریزسازواره
دریافت: 1399/2/9 | پذیرش: 1402/3/17 | انتشار: 1402/2/17
دریافت: 1399/2/9 | پذیرش: 1402/3/17 | انتشار: 1402/2/17
ارسال پیام به نویسنده مسئول
| بازنشر اطلاعات | |
 |
این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است. |
