Khodadadi Z, Omidi M, Etminan A, Ebrahimi A. Analysis of genetic Diversity and relationships among different genotypes of Triticum aestivum and Aegilops tauschii using SSR markers. MGj 2021; 15 (4) :287-296
URL:
http://mg.genetics.ir/article-1-1656-fa.html
خدادادی زهرا، امیدی منصور، اطمینان علیرضا، ابراهیمی آسا. تجزیه و تحلیل تنوع و روابط ژنتیکی در ژنوتیپهای مختلف دو گونه Triticum aestivum و Aegilops tauschii با استفاده از نشانگرهای SSR. فصلنامه علمی ژنتیک نوین. 1399; 15 (4) :287-296
URL: http://mg.genetics.ir/article-1-1656-fa.html
دانشگاه آزاد اسلامی،تهران،ایران؛کرج،ایران
چکیده: (2054 مشاهده)
جنسهای تریتیکوم و آژیلوپس بواسطه پتانسیل اصلاحی خود همچون تحمل به انواع تنشهای غیر زنده و زنده به عنوان اصلیترین خزانه ژنی گندم در نظر گرفته شدهاند. هدف اصلی این پژوهش ارزیابی تنوع ژنتیکی موجود در 95 توده بومی و وحشی متعلق به دو گونه T. aestivum و Ae. tauschii با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره (SSR) بود. تعداد 25 آغازگر SSR استفاده شده در این ارزیابی در مجموع 48 قطعه چندشکل تکثیر نمودند. متوسط تعداد آللهای شناسایی شده، شاخص محتوای اطلاعات چندشکل (PIC)، تنوع ژنی (H)، شاخص نشانگر (MI) و قدرت تفکیک (Rp) به ترتیب برابر با 96/1، 32/0، 41/0، 80/0 و 27/1 بود. نتایج حاصل از تجزیه واریانس مولکولی (AMOVA) نشان داد بیشترین سهم تنوع ژنتیکی مربوط به تنوع درون گونهای (86 %) بود. بر اساس پارامترهای ژنتیکی مشخص شد که گونه Ae. tauschii نسبت به T. aestivum از تنوع ژنتیکی بیشتری برخوردار است. تجزیه خوشهای بر اساس ضریب جاکارد و الگوریتم Neighbor-joining کلیه تودههای مورد بررسی را در دو گروه اصلی تفکیک نمود، به طوریکه برخی از تودههای مربوط به هر گونه در زیر گروه یکسانی قرار گرفتند. نتایج تجزیه به مختصات اصلی (PCoA) نشان داد دو مؤلفه نخست 38/50 درصد تغییرات مولکولی را توجیه نمودند و بای پلات ترسیم شده بر اساس دو مؤلفه نخست منطبق با الگوی گروهبندی مشاهده شده توسط تجزیه خوشهای بود. تجزیه ساختار جمعیت نیز جمعیتهای ارزیابی شده را در چهار زیر جمعیت واقعی تفکیک نمود و متوسط شاخص FST در آنها 50/0 برآورد گردید. به طور کلی نتایج این پژوهش نشان داد سطح بالایی از تنوع ژنتیکی درون گونههای T. aestivum و Ae. tauschii وجود دارد و آغازگرهای SSR استفاده شده در این پژوهش به خوبی قادر به نشان دادن این میزان تنوع بودند.
نوع مطالعه:
پژوهشی کامل |
موضوع مقاله:
ژنتیک گیاهی دریافت: 1399/4/9 | پذیرش: 1399/9/23 | انتشار: 1399/11/14