دوره 18، شماره 1 - ( 3-1402 )
جلد 18 شماره 1 صفحات 32-21 |
برگشت به فهرست نسخه ها
Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
Danaeipour Z, Garoosi G, Tohidfar M, Bakhtiari Zadeh M R, Mirjalili M H. Data mining of flax transcriptome profile under stress aluminum toxicity and zinc deficiency. MGj 2023; 18 (1) : 3
URL: http://mg.genetics.ir/article-1-1782-fa.html
URL: http://mg.genetics.ir/article-1-1782-fa.html
دانایی پور زهرا، گروسی قاسمعلی، توحیدفر مسعود، بختیاری زاده محمدرضا، میرجلیلی محمد حسین. داده کاوی پروفایل ترانسکریپتومی کتان تحت تنش سمیت آلومینیوم و کمبود روی. فصلنامه علمی ژنتیک نوین. 1402; 18 (1) :21-32
دانشکده علوم و فناوری زیستی ، دانشگاه شهید بهشتی، تهران
چکیده: (799 مشاهده)
گیاه کتان (Linum usitatissimum L.) در سراسر جهان به‌دلیل کاربرد گسترده در صنایع غذایی، نساجی و دارویی در مقیاس وسیع کشت می‌شود. یکی از عواملی که کشت و کار این گیاه را تحت تاثیر قرار می‌دهد تنشهای غیر زیستی از جمله pH نامناسب و خاک دارای کمبود یا سمیت عناصر غذایی است که منجر به کاهش کمیت و کیفیت آن می‌شود. بنابراین شناسایی ژن‌های پاسخگو به تنشهای مختلف ضروری است. در مطالعه حاضر، با استفاده از دادههای RNA-Seq به‌دست آمده از ریشه گیاه کتان تحت تنش سمیت آلومینیوم و کمبود روی به بررسی DEGها به‌منظور شناسایی تغییرات پاسخگو به تنش در دو کلتیوار مقاوم و حساس پرداخته شد. در مجموع 30 تا DEG مشترک بین کلتیوارهای مقاوم و ۹۷ تا DEG مشترک بین کلتیوارهای حساس در هر دو تنش شناسایی شد که در آن تعداد DEGها در رقم حساس بیشتر بوده و چهار ژن مشترک بین حساس و مقاوم بود. بیشترین تغییرات کلی DEGهای مشترک مربوط به فرآیندهای زیستی اختصاصی کتان، فرآیندهای متابولیکی و فرآیندهای سلولی بود که نشان‌دهنده وضعیت فعال متابولیکی سلول گیاهی است. کلتیوارهای مقاوم به‌طور اختصاصی‌تر پاسخ داده و بیشتر ژن‌ها در GO مرتبط پاسخ به محرک‌ها قرار گرفتند. در شبکه برهمکنش پروتئین-پروتئین کلتیوارهای حساس، کیتینازها و ژن PR4 بیشترین ارتباط را با سایر پروتئین‌ها داشتند، در حالی‌که در کلتیوارهای مقاوم استراتژی مقاومت متفاوت بود و بیان ژن‌های تغییر دهنده دیواره سلولی بیشترین ارتباط را با سایر پروتئین‌ها نشان دادند. به‌طور کلی پروفایل بیانی ژن‌های پاسخگو به تنش نشان داد که در هر دو کلتیوار ژن PR1 بیشترین تغییرات را داشت و میتوان به‌عنوان مارکر مقاومت برای اهداف به‌نژاد گیاهی استفاده نمود. همچنین بیوسنتز متابولیتهای ثانویه که به نوعی پاسخ به تنش است به‌طور معنیداری افزایش یافت. نتایج به‌دست آمده بینشهای جدیدی در مورد مکانیسم تحمل به تنشهای غیرزیستی کتان ارائه می‌دهد که میتوان جهت بهبود عملکرد کمی و کیفی گیاهان مورد استفاده قرار داد.
شماره‌ی مقاله: 3
نوع مطالعه: پژوهشی کامل |
موضوع مقاله:
ژنتیک گیاهی
دریافت: 1401/5/9 | پذیرش: 1401/10/5 | انتشار: 1402/2/17
دریافت: 1401/5/9 | پذیرش: 1401/10/5 | انتشار: 1402/2/17
ارسال پیام به نویسنده مسئول
| بازنشر اطلاعات | |
 |
این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است. |
