خانواده ژن‌های موتیف AT-hook بسیار حفاظت شده هستند و نقش بسیار مهمی در فرآیندهای بیولوژیکی گیاهان ایفا می‌کنند. با وجود این تاکنون هیچ‌گونه بررسی این خانواده ژنی در گیاه کاردامینه هیرسوتا انجام نشده است. در این مطالعه با توجه به یافته‌های خانواده ژن موتیف AT-hook در آرابیدوپسیس تالیانا، خانواده ژن‌های موتیف AT-hook در ژنوم کاردامینه هیرسوتا شناسایی، بررسی و تفسیر شد. با استفاده از بررسی‌های In Silico، ویژگی‌های ساختار پروتئین‌ها و ژن‌ها، مکان‌های کروموزومی، رویدادهای تکراری ژن و روابط فیلوژنتیکی ارزیابی شد. در ابتدا 29 ژن AHL در کاردامینه هیرسوتا شناسایی شد تجزیه و تحلیل فیلوژنتیک نشان داد که AHLها در کاردامینه هیرسوتا به 2 کلاد، کلاد A بدون اینترون و کلاد B با 5-4 اینترون مشابه ارابیدوپسیس تالیانا تکامل یافته‌اند. بر اساس ترکیب موتیف(های) AT-hook و دامنهPPC ، پروتئین‌های AHL به سه نوع (Type-I/-II/-III) طبقه‌بندی شدند به‌طوری که کلاد A نوع یک و کلاد B نوع دو و سه را تشکیل دادند. همچنین بررسی موتیف‌ها نشان داد که سه ژن AHL1، AHL10 و AHL11 اگرچه دارای موتیف AT-hook هستند اما بدون دومین PCC بوده و بر این اساس، تعداد واقعی ژن‌های خانواده AHL در گیاه کاردامینه هیرسوتا 26 می‌باشد. بررسی وضعیت مضاعف شدن در خانواده ژن‌های AHL در کاردامینه هیرسوتا نشان داد 16 ژن همولوگ ناشی از دوبرابر شدن قطعه‌ای می‌باشند و توالی تاندمی در هیچکدام از ژن‌ها مشاهده نشد. بررسی نسبت نرخ جانشینی غیر مترادف به نرخ جانشینی مترادف، یعنی Ka/Ks در 5 جفت ژن همولوگ نشان داد که آن‌ها با Ka/Ks <1 در معرض انتخاب منفی قرار گرفته‌اند. این نتایج و تجزیه و تحلیل آن، یک ارتباط تکاملی احتمالی را برای خانواده ژن‌های AHL در گیاه کاردامینه هیرسوتا نشان می‌دهد و امکان مطالعات جدید برای بررسی عملکرد بیولوژیکی آن‌ها را تسهیل می‌کند.