miRNAها (میرناها) دستهای از مولکولهای RNA کوتاه غیر کدکننده، با طولی حدود 24-18 نوکلئوتید هستند که ژنهای هدف را در سطح پس از رونویسی کنترل میکنند. هیچگونه گزارشی از شناسایی میرناها در گیاه ریواس ثبت نشده است. لذا در مطالعه حاضر بهمنظور پیشبینی میرناهای حفاظت شده بالقوه و ژنهای هدفشان در ریشه گیاه ریواس، RNA کل از بافت ریشه استخراج شد و مورد توالییابی قرار گرفت. سپس رونوشتهای غیرکننده پروتئین شناسایی شدند و بهعنوان توالیهای نامزد پیشساز میرنا در نظر گرفته شدند. در این مطالعه 82047 رونوشت از گیاه ریواس بهروش سرهمبندی نوپدید ایجاد شد. با جستجوی همولوژی این رونوشتها با پایگاه داده mirbasو پیشبینی ساختار ثانویه، 4 میرنا محافظت شده متعلق به خانوادههای mir396، mir164، mir319 و mir168 شناسایی شدند. 574 رونوشت از ترانسکریپتوم ریشه ریواس توسط این میرناها مورد هدف قرار گرفتند. در مجموع با توجه به نقش تنظیمی میرناهای شناسایی شده بر طیف وسیعی از ژنها، میتوان از این میرناها در شناسایی ژنهای مرتبط با متابولیتهای ثانویه بهره برد.
بازنشر اطلاعات | |
![]() |
این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است. |