محمدی نژاد فاطمه، محمدابادی محمدرضا، رودباری زهرا، سادکووسکی توماس. شناسایی ژنهای مؤثر در رشد و نمو ماهیچه اسکلتی در دوران آبستنی گوسفند. فصلنامه علمی ژنتیک نوین. 1402; 18 (2) :125-137
URL: http://mg.genetics.ir/article-1-1814-fa.html
استاد گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان، کرمان، ایران
چکیده: (799 مشاهده)
برنامه رشد و نمو جنینی، پاسخ ارگانیسم پستانداران در زمان رشد بحرانی است که بر روی رشد و نمو از نظر کیفی تأثیر میگذارد. مطالعه ژنها راهی برای بهبود برنامه رشد و نمو جنینی و افزایش تولید گوشت ماهیچه اسکلتی است. در این تحقیق دادهها از پایگاه دادهGEO با شماره دسترسیGSE23563 دانلود شدند. برای کنترل کیفیت دادههای خام و آنالیز تفاوت بیان ژنها از بسته LIMMA استفاده شد. آنالیز ژن آنتولوژی و مسیرهای زیستی با استفاده از سرور آنلاین Enrichr صورت گرفت. از نرمافزار STRING برای یافتن تعاملات بین ژنها و از نرمافزارCytoscape برای آنالیز بیشتر تعاملات و نمایش شبکه آنها استفاده شد. نتایج نشان داد که در بازه زمانی 70 تا 120 روز در دوران آبستنی در مجموع 445 ژن و در بازه زمانی 120 تا 135 روز در دوران آبستنی در مجموع 84 ژن تفاوت بیان داشتند. با استفاده از نمودار مجموعه 34 ژن مشترک بین این بازههای زمانی مشخص شد. نتایج ژن آنتولوژی و مسیر نشان داد که در بازه زمانی 70 تا 120 روز تنظیم تکثیر جمعیت سلولی، رشد و نمو بافت ماهیچهای سلولی، تمایز میوبلاست، تنظیم منفی رشد توسعهای، تنظیم منفی فرآیند رشد و نمو، تنظیم مثبت رشد و نمو سلول، تنظیم تکثیر فیبروبلاست، مسیرهای سیگنالینگ (PI3K-Akt، HIF-1، Rap1، PPAR، MAPK) تعامل گیرنده ECM، مقاومت به انسولین و در بازه زمانی 120 تا 135 روز تنظیم تمایز سلولی، تنظیم تمایز سلولهای عضلانی، تنظیم مثبت تمایز سلولی، تنظیم مثبت فرآیند رشد و نمو، تنظیم تکثیر جمعیت سلولی، تنظیم منفی رشد، تنظیم منفی تکثیر جمعیت سلولی، رشد و نمو اندام جنینی، مسیرهای سیگنالینگ (MAPK، p53) فعالیتهای عملکردی و مسیرهای زیستی مهم مربوط به رشد و نمو ماهیچه اسکلتی در دوران آبستنی گوسفند بودند. ژنهای هاب ESR1، PTK7، TNFSF11و CEBPB در بین ژنهای مشترک بین دو بازده زمانی مشخص شدند. از این ژنها میتوان در برنامههای اصلاح نژادی برای رفع مشکلات تولد دامها با وزن کم، کاهش تولید گوشت، بیماریهای ناشی از کم وزنی دام و افزایش مرگ و میر در زمان تولد استفاده کرد.
شمارهی مقاله: 2
نوع مطالعه:
پژوهشی کامل |
موضوع مقاله:
ژنتیک جانوری دریافت: 1402/1/27 | پذیرش: 1402/3/3 | انتشار: 1402/7/2