مقادیر بالای اسیدهای چرب غیراشباع امگا 6 و نسبت بسیار بالای امگا 6 به امگا 3 باعث بیماری­های بسیاری از جمله بیماری­های قلبی عروقی، سرطان و بیماری­های التهابی و خودایمنی می شود. برای انتقال موفق یک ژن به گیاه، به بهینه‌سازی انتقال ژن نیاز است. کنجد یک گیاه دانه روغنی قدیمی است که به‌دلیل داشتن لیگنان‌های مهم دارویی و همچنین روغن خوراکی با کیفیت شهرت دارد. افزایش امگا 3 در این گیاه تا اندازه زیادی به بهبود کیفیت روغن آن کمک می‌کند. در این پژوهش جهت بهینه‌سازی شرایط انتقال ژن FAD3 جدا شده از گیاه کتان به گیاه کنجد اثرات رقم (داراب و دشتستان)، مدت زمان پیش کشتی (5، 6 و 7 روزه)، غلظت اگروباکتریوم (1 و 5/0، 25/0 =OD600)، مدت زمان تلقیح (10، 20 و 30 دقیقه)، مدت زمان هم­کشتی (صفر، 24، 48 و 72 ساعت) و شرایط نوری (تاریکی و 16 ساعت روشنایی) وغلظت استوسیرینگون (0، 50 و 100 میکرومولار) هر کدام به‌صورت جداگانه در قالب طرح کاملاً تصادفی در 4 تکرار بررسی شد. نتایج نشان داد که ریزنمونه‌های 7 روزه در رقم دشتستان و ریزنمونه‌های 5 روزه در رقم داراب، غلظت اگروباکتریوم OD₆₀₀=1، مدت زمان تلقیح 30 دقیقه، مدت زمان همکشتی 24 ساعت در تاریکی و غلطت استوسیرنگون 100 میکرومولار نقش مهمی در کارایی انتقال ژن دارند. در این پژوهش رقم دشتستان درصد باززایی بهتری را نسبت به رقم داراب نشان داد. در نهایت گیاهچه‌های باززا شده به محیط ریشه‌زایی منتقل شدند. بررسی اولیه گیاهان باززا شده در محیط انتخابی انجام شد و آزمایشPCR  با استفاده از پرایمرهای اختصاصی انجام گشت و گیاهان تراریخته انتخاب شدند.