دوره 19، شماره 1 - ( 3-1403 )
جلد 19 شماره 1 صفحات 73-61 |
برگشت به فهرست نسخه ها
Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
Mohammadi H, Shamsollahi M. Genomic wide association study of body conformation traits in crossbred dairy cattle using Bayesian approaches. MGj 2024; 19 (1) : 6
URL: http://mg.genetics.ir/article-1-1827-fa.html
URL: http://mg.genetics.ir/article-1-1827-fa.html
محمدی حسین، شمس اللهی محمد. بررسی کارایی روش های آماری بیزی برای پویش ژنومی صفات ساختاری بدن در گاوهای شیری آمیخته. فصلنامه علمی ژنتیک نوین. 1403; 19 (1) :61-73
دانشگاه ایلام
چکیده: (442 مشاهده)
بکارگیری روش آماری مناسب در مطالعات پویش ژنومی یکی از عوامل اصلی برای شناسایی مناطق ژنومی مرتبط با صفات مهم اقتصادی است. لذا هدف از انجام پژوهش حاضر، محاسبه میزان واریانس ژنتیکی توجیه شده روشهای چند مرحلهای بیزی شامل BayesA، BayesB و BayesCπ برای صفات مرتبط با ساختار بدن در گاوهای شیری آمیخته بود که با تراشههای 50K گاو تعیین ژنوتیپ شده بودند. برای هر دام، پنج صفت شامل ارتفاع قد از جدوگاه، دور سینه، طول بدن، عمق سینه و فاصله دو هیپ رکورد جمع آوری شده بود و با استفاده از بسته نرم افزاری hibayes در محیط R میزان اثر هر یک SNPها برآورد گردید. میزان واریانس ژنتیکی توجیه شده در روش BayesA نسبت به سایر روشها بیشتر برآورد گردید. کمترین و بیشترین میزان واریانس توجیه شده به ترتیب مربوط به صفات دور سینه (5/12%) و طول بدن (7/21%) بهدست آمد. پنجرههای ژنومی با بیشترین واریانس ژنتیکی روی کروموزومهای 4، 5، 6، 7، 10، 11، 16 و 23 قرار داشتند و شامل ژنهای کاندیدای PRDX6، ATF3، ARAP2، PDE1B،CHCHD3 ، TBPL2، SYN3 و PTBP1 بودند. ژنهای شناسایی شده عملکرد‌های مهمی را در ارتباط با سنتز کلاژن، فرآیند استخوانسازی، رشد عضلات اسکلتی و تنظیم یون کلسیم بر عهده داشتند. نتایج تحقیق حاضر نشان میدهد هنگامی که معماری صفات بررسی شده از مدل تعداد زیاد جایگاه ژنی پیروی کند، معمولاً روش BayesA بر بیزهای با انتخاب متغیر ارجحیت دارند. علاوه بر این، با توجه به شناسایی مناطق ژنومی جدید و نقش کلیدی ژنهای ذکر شده در ایجاد صفات ساختاری بدن میتوان کارآیی روش بیز A برای پویش ژنومی در صفات ساختاری بدن را تأیید کرد.
شماره‌ی مقاله: 6
نوع مطالعه: پژوهشی کامل |
موضوع مقاله:
ژنتیک جانوری
دریافت: 1402/4/1 | پذیرش: 1403/3/18 | انتشار: 1403/6/4
دریافت: 1402/4/1 | پذیرش: 1403/3/18 | انتشار: 1403/6/4
ارسال پیام به نویسنده مسئول
| بازنشر اطلاعات | |
 |
این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است. |
