TY - JOUR T1 - Sequencing part of phenylalanin ammonia lyase (pal2) gene involved in antioxidant synthesis pathway to use in phylogeny of important genera belong to Anthemideae subfamily TT - توالی‌یابی بخشی از ژن فنیل‌آلانین آمونیالیاز (pal2) دخیل درمسیر سنتز آنتی اکسیدان‌ها و استفاده از آن‌ در فیلوژنی جنس‌های مهم زیرخانواده JF - MGJ JO - MGJ VL - 10 IS - 2 UR - http://mg.genetics.ir/article-1-1364-fa.html Y1 - 2015 SP - 293 EP - 298 KW - Anthemideae KW - diversity KW - DNA KW - pal2 gene N2 - بومادران، درمنه، بابونه، داوودی و مخلصه از جمله مهم‌ترین جنس‌هایی زیرخانواده Anthemideae هستند که به دلیل داشتن ترکیبات فلاونوئیدها و آنتی‌اکسیدانی کاربردهای قابل توجهی در داروسازی دارند. فلاونوئیدها ترکیبات فنلی هستند که جزو آنتی‌اکسیدان‌های غیرآنزیمی طبقه‌بندی می‌شوند. فنیل‌آلانین آمونیا لیاز (PAL) آنزیم کلیدی در مسیر سنتز فلاونوئیدها می‌باشد. برای شناسایی و تعیین توالی ژن pal2 ابتدا براساس همردیف‌سازی چندتایی توالی‌های جستجو شده برای گیاه مدل آرابیدوپسیس و سایر گیاهان در پایگاه داده‌های بانک ژن (NCBI)، انجام شد. آغازگرهای اختصاصی به صورت هرز براساس نواحی حفاظت شده در ناحیه ژنی و همچنین ناحیه فعال دومین پروتئین PAL2 طراحی شد. آغازگرها در جنس‌های مذکور ناحیه‌ای به طول 700 جفت نوکلئوتید را تکثیر و سپس محصول PCR کلون و در ادامه تعیین توالی و در بانک ژن (NCBI) ثبت شدند. به منظور بررسی تنوع ژن pal2 بر اساس توالی نوکلئوتید‌ها (جایگزینی‌های همجنس Transition و ناهمجنس Transversion نوکلئوتید‌ها) در بین جنس‌های ذکر شده از نرم افزار Mega ver 5.0 استفاده و درصد تنوع محاسبه شد. نتایج بیوانفورماتیک بررسی تنوع نشان دادند جنس‌های مذکور از نظر ژن pal2 به خوبی حفاظت شده می‌باشند و Matricaria sp. و Achillea sp. نزدیکترین جنس‌ها به یکدیگر و جنس‌های Artemisia sp. و Chrysanthemum sp. دورترین جنس‌ها از یکدیگر محسوب می‌شوند. M3 ER -