fa تشخیص ویروس‌ها و ویروئیدهای گیاهی به کمک فناوری توالی یابی با توان بالا ژنتیک گیاهی Subject 01 تخصصی (مروری) review <h1 dir="RTL" style="text-align: justify;"><span style="font-size:12px;"><span style="font-family:Tahoma;">ویروس‌های گیاهی باعث بسیاری از بیماری‌های مهم می‌شوند و مسئول کاهش عملکرد و کیفیت محصول در سراسر جهان هستند. شناسایی سریع و دقیق ویروس‌ها در یک نمونه برای سرویس‌های بازرسی، &nbsp;قرنطینه و مدیریت بیماری مطلوب است. به‌تازگی، تکنیک‌های تعیین توالی نسل بعد (<span dir="LTR">NGS</span>) که نمایانگر یک رویکرد انعطاف‌پذیر در ردیابی پاتوژن گیاهی است، توسعه یافته است. از سال 2009، تکنیک‌های <span dir="LTR">NGS</span> در برخی نواحی ویروس شناسی گیاهی متشکل از توالی‌یابی ژنوم ویروس یا ویروئید، ردیابی و شناسایی، اکولوژی و اپیدمیولوژی آغاز به‌کار کرده است. تکنیک‌های <span dir="LTR">NGS</span> سریع، بسیار کارآمد و کم هزینه هستند و امکان توالی‌یابی چندین گیگابایت داده را در چند ساعت فراهم می‌سازند. در واقع، یک رویکرد عمومی برای شناسایی ویروس یا ویروئید است که نیازی به شناخت قبلی از میزبان یا ویروس ندارد. تنها با تعیین توالی کل آر.ان.ای‌های کوچک در یک اجرای <span dir="LTR">NGS</span>، شناسایی ویروس‌های دارای دی.ان.ای یا آر.ان.ای و ویروئیدها امکان‌پذیر می‌شود. در این مقاله، به پیشرفت‌های اخیر در به‌کارگیری تکنیک‌های <span dir="LTR">NGS</span> برای تشخیص ویروس‌ها و ویروئیدها در میزبانان آن‌ها پرداخته شده است.</span></span></h1> Plant viruses cause many important diseases and are responsible for reducing crop yield and quality throughout the world. Fast and accurate identification of viruses in a sample is desirable for inspection, quarantine services and disease management. Recently, Next-generation sequencing (NGS) techniques have been developed that represent a flexible approach to plant pathogen detection. Since 2009, NGS techniques have begun to apply in some areas of plant virology consisting of virus/viroid genome sequencing, detection, and discovery, ecology, and epidemiology. The NGS techniques are rapid, highly efficient, and low cost, and allow the sequencing of many data gigabases in a few hours. It&rsquo;s a generic approach to virus/viroid identification that requires no prior knowledge of the host or virus. Only by sequencing of total small RNAs in an NGS run, identification of DNA/RNA containing viruses and viroids are possible. This article reviews the rapid and recent achievement in the applying of NGS techniques for the diagnosis of viruses and viroids in their hosts. توالی یابی نسل بعد شناسایی, ویروس, ویروئید, پلت فرم , آسیب شناسی گیاهی next generation sequencing, identification, virus, viroid, platform, plant pathology 401 419 http://mg.genetics.ir/browse.php?a_code=A-10-111-1&slc_lang=fa&sid=1 arghavan alisoltani ارغوان علی سلطانی Arghavana85@gmail.com 10031947532846006233 10031947532846006233 No دانشگاه افریقای جنوبی farideh farahbakhsh فریده فرح بخش farideh.farahbakhsh63@gmail.com 10031947532846006234 10031947532846006234 Yes دانشگاه صنعتی اصفهان reza lotfi رضا لطفی reza.lotfi@modares.ac.ir 10031947532846006235 10031947532846006235 No دانشگاه تربیت مدرس majid talebi مجید طالبی mtalebi@cc.iut.ac.ir 10031947532846006236 10031947532846006236 No دانشگاه صنعتی اصفهان