fa توالی‌یابی بخشی از ژن فنیل‌آلانین آمونیالیاز (pal2) دخیل درمسیر سنتز آنتی اکسیدان‌ها و استفاده از آن‌ در فیلوژنی جنس‌های مهم زیرخانواده بومادران، درمنه، بابونه، داوودی و مخلصه از جمله مهم‌ترین جنس‌هایی زیرخانواده Anthemideae هستند که به دلیل داشتن ترکیبات فلاونوئیدها و آنتی‌اکسیدانی کاربردهای قابل توجهی در داروسازی دارند. فلاونوئیدها ترکیبات فنلی هستند که جزو آنتی‌اکسیدان‌های غیرآنزیمی طبقه‌بندی می‌شوند. فنیل‌آلانین آمونیا لیاز (PAL) آنزیم کلیدی در مسیر سنتز فلاونوئیدها می‌باشد. برای شناسایی و تعیین توالی ژن pal2 ابتدا براساس همردیف‌سازی چندتایی توالی‌های جستجو شده برای گیاه مدل آرابیدوپسیس و سایر گیاهان در پایگاه داده‌های بانک ژن (NCBI)، انجام شد. آغازگرهای اختصاصی به صورت هرز براساس نواحی حفاظت شده در ناحیه ژنی و همچنین ناحیه فعال دومین پروتئین PAL2 طراحی شد. آغازگرها در جنس‌های مذکور ناحیه‌ای به طول 700 جفت نوکلئوتید را تکثیر و سپس محصول PCR کلون و در ادامه تعیین توالی و در بانک ژن (NCBI) ثبت شدند. به منظور بررسی تنوع ژن pal2 بر اساس توالی نوکلئوتید‌ها (جایگزینی‌های همجنس Transition و ناهمجنس Transversion نوکلئوتید‌ها) در بین جنس‌های ذکر شده از نرم افزار Mega ver 5.0 استفاده و درصد تنوع محاسبه شد. نتایج بیوانفورماتیک بررسی تنوع نشان دادند جنس‌های مذکور از نظر ژن pal2 به خوبی حفاظت شده می‌باشند و Matricaria sp. و Achillea sp. نزدیکترین جنس‌ها به یکدیگر و جنس‌های Artemisia sp. و Chrysanthemum sp. دورترین جنس‌ها از یکدیگر محسوب می‌شوند. Achillea sp., Artemisia sp., Matricaria sp., Santolina sp. and Tanacetum sp. are the most important genera of Anthemideae subfamily that due to having flavonoids and antioxidant compounds have significant applications in pharmacology. Flavonoids are phenolic compounds that are classified in non-enzymatic antioxidants. Phenylalanine ammonia lyase (PAL) is a key enzyme in the flavonoid biosynthetic pathway. To identify and sequencing of pal2 gene, multiple alignment was done for pal2 sequences of the model plant Arabidopsis and other plants registered in the gene bank database (NCBI). Specific degenerative primer was designed based on conserved regions on gene and also active site domain of PAL2 protein. Primers amplified a 700 bp fragment in all studied genera and then the PCR productions were cloned and sequenced. To investigate the pal2 gene diversity among important genera of Anthemideae, average pairwise distance using K2P and P-distance model and genetic diversity based on transition and transversion were calculated. The bioinformatics data showed that mentioned genera have well conserved for pal2 gene. Matricaria sp. and Achillea sp. have more similarity and also Artemisia sp. and Chrysanthemum sp. have more distance to each other. تنوع,ژن pal2,Anthemideae,DNA Anthemideae,diversity,DNA,pal2 gene 293 298 http://mg.genetics.ir/browse.php?a_code=A-10-109-364&slc_lang=fa&sid=1