Modern Genetics Journal
فصلنامه علمی ژنتیک نوین
MGj
General
http://mg.genetics.ir
1
admin
2008-4439
2008-4439
8
14
8888
13
fa
jalali
1394
10
1
gregorian
2016
1
1
10
3
online
1
fulltext
fa
بررسی قرابت ژنتیکی توس (Betula pendula) ایران با استفاده از نشانگر کلروپلاستی trnH-psbA
Genetic affinity of Betula pendula from Iran using trnH-psbA chloroplast marker
توس یکی از قدیمیترین درختان به جای مانده در جنگلهای هیرکانی است و از نظر حفاظت ذخایر ژنتیکی در گروه گیاهان کمگسترده، کمیاب و در معرض خطر انقراض قرار دارد. دورگهای شدن و پلیپلوییدی در جنس توس سبب ایجاد شباهت و اختلاف نظر در شناسایی دقیق تعدادگونههای این جنس در دنیا شد. این تحقیق با بکارگیری نشانگر بین ژنی trnH-psbA به بررسی جایگاه ردهبندی و قرابت ژنتیکی توس ایران با سایرگونههای توس در دنیا پرداخته است. برای این منظور ناحیه بینژنی trnH-psbA به روش PCR تکثیر شد. تحلیل مقایسهای از تعیین توالی محصولات PCR پنج رویشگاه با 17 توالی ثبت شده این ناحیه از دیگر گونههای توس در بانک ژنی صورت گرفت. نتایج درخت فیلوژنی به روش حداکثرشباهت، نشان داد توسها در سه کلاد A، B و C تقسیم شدند که نمونههای ایران همگی در کلاد A قرار گرفتند. نمونه توس شهرستانک در زیرکلاد Aa و چهار نمونه دیگر توسهای مورد مطالعه در ایران واقع در سیاهمرزکوه، سنگده، نوشهر و مارمیشو در زیرکلاد Ab قرار گرفتند. بر اساس روش ABGD گونههای توس موجود در ایران در سه گروه مجزا قرار گرفتند. بر اساس روش K2P گونه توس موجود در شهرستانک به عنوان اولین گروه مجزا شده در درخت فیلوژنی، بیشترین شباهت را با گونه B. pendula داشت. به طور کلی، این تحقیق هم راستا با مطالعه ریخت شناسی، از قرارگیری توسهای ایران در زیر جنس Betula حمایت میکند
Birch is one of the oldest remaining tree species in the Hyrcanian forest which categorized in plants with limited distribution, rare and critically endangered. Hybridization and polyploidy are two main reasons for uncertainty in taxonomy of the genus Betula in the world. The taxonomic status and genetic affinity of Iranian population of Betula with other species from this genus were investigated. Leaf samples were collected from four Birch populations form North and North west of Iran and after DNA extraction, trnH-psbA region amplified. Comparative sequence analysis of PCR product from five populations in iran with 17 sequences of other species of the genus Betula recorded in NCBI were done. Phylogenetic analysis indicated that birches were in three clades A, B and C which all Iranian samples located in clade A. Sharestanak population formed the subclade Aa, whereas the Siahmarzkouh, Sangedeh, Nohshar and Marmisho comprised subclade Ab. Based on ABGD method, the birches of Iran comprised three separated groups. Sharestanak sample showed the greatest similarity with Betula pendula based on K2P methods. Finally, this study support the belong of Iranian populations to subgenus Betula.
DNA بارکدینگ,پلیپلوییدی,تنوع هاپلوتیپی,فیلوژنی,trnH-psbA
DNA barcoding,Haplotype diversity,Phylogeny,Polyploidy,trnH-psbA
437
446
http://mg.genetics.ir/browse.php?a_code=A-10-109-379&slc_lang=fa&sid=1
حمید بینا
حمید بینا
10031947532846002352
10031947532846002352
No
حامد یوسف زاده
حامد یوسف زاده
10031947532846002353
10031947532846002353
No
محمد اسماعیل پور
محمد اسماعیل پور
10031947532846002354
10031947532846002354
No
امید اسماعیل زاده
امید اسماعیل زاده
10031947532846002355
10031947532846002355
No