Modern Genetics Journal
فصلنامه علمی ژنتیک نوین
MGj
General
http://mg.genetics.ir
1
admin
2008-4439
2008-4439
8
14
8888
13
fa
jalali
1395
5
1
gregorian
2016
8
1
11
2
online
1
fulltext
fa
تاثیر تنش شوری بر الگوی بیان miR160 و miR167 و ژنهای هدف آنها درگیاه آفتابگردان
Effect of salt stress on expression pattern of miR160 and miR167 and their target genes in sunflower
شوری یکی از تنشهای محیطی متداول است که رشد و نمو گیاه را محدود میکند. مطالعات مولکولی در پاسخ به تنشهای محیطی مختلف نشان داده است که گیاه در مواجهه با تنشها، الگوی بیان ژنهای بروز یافته و تنظیمکننده خود را تغییر میدهد. miRNAها دسته مهمی از تنظیم کنندههای بیان ژنی میباشند که نسبت به تنشهای محیطی پاسخهای متنوعی میدهند و نقش کلیدی در تنظیم بیان ژنها در مراحل پس از رونویسی ایفا میکنند. در این مطالعه بیان miR160 و miR167 و ژنهای هدف آنها، بهترتیب ژن BU026935 و ژن ARF6 در دو بافت برگ و ریشه و دو سطح تنش شوری 75 و 150 میلیمولار نمک کلرید سدیم و شرایط غیرتنش (شاهد) بهصورت آزمایش فاکتوریل در قالب طرح کاملاً تصادفی با سه تکرار بیولوژیکی بررسی شد. تنش شوری در مرحله شش برگی و مدت زمان 24 ساعت اعمال شد. پس از سنتز cDNA با روش stem-loop RT-PCR، میزان بیان miR160 و miR167 به روش qRT-PCR اندازهگیری شد. نتایج نشان داد که در غلظتهای مورد بررسی شوری، بیان miR160 در بافت برگ ابتدا افزایش و سپس کاهش مییابد. در حالیکه مقادیر تغییرات بیان، نشاندهندهی کاهش بیان معنیدار miR160 در بافت ریشه تحت تنش 75 میلیمولار بود، بیان آن در تنش 150 میلیمولار با شرایط کنترل تفاوت معنیداری از نظر آماری نداشت. بیان ژن BU026935 نسبت به شاهد در هر دو سطح شوری و هر دو بافت افزایش بیان نشان داد. miR167 تنها در بافت برگ تحت تنش شوری 75 میلیمولار کاهش بیان معنیدار نشان داده است. نتایج مطالعات و رسم شبکه مشخص کرد که یکی از دلایل اصلی کاهش اکسین در شرایط تنش شوری، افزایش miR167 میباشد. ژن ARF6 در بافت برگ و ریشه در شوری 75 میلیمولار و ریشه در شوری 150 میلیمولار کاهش بیان نشان داد.
Salinity is a common environmental stress that seriously affects plant growth. The results of molecular researches in relation to environmental stresses showed that expression pattern of genes and their regulators were changed in response to stresses. miRNA's are an important class of gene expression regulators that diversely responds to environmental stresses and have a key role in post transcriptional regulation. In this study, the expression of miR160 and miR167 were studied by qRT-PCR at two salinity levels, (75 and 150 mM NaCl) and control condition in both root and leaf tissues. A factorial experiment based on completely randomized design(CRD) with three replication was used in this study. Plants were exposed to salinity stress in six-leaf stage and after 24 h sampling from leaf and root was performed then samples were freezed in liquid nitrogen. cDNA was synthesized with stem-loop RT-PCR procedure. Expression of miR160 and miR167 was measured using qRT-PCR technique. The results showed that the expression of miR160 was firstly increased and then decreased. While the values of fold change showed significant reduction of miR160 expression in 75mM salinity level, it didn’t show any significant differences comparing to control condition at 150 mM salinity. The expression of BU026935 gene in both salinity levels and tissues were increased in comparison to control. MiR167 was significantly down regulated at 75 mM salinity. The results of network analysis revealed that increasing miR167 expression under salinity condition is leading to auxin reduction. ARF6 expression level was decreased at 75mM salinity level in both root and leaf tissues. At 150 mM salinity level ARF6 gene showed down regulation only in root tissue.
آفتابگردان,ژن ARF6,ژن BU026935,miR160,miR167
ARF6 gene, ,BU026935 gene, ,miR160, miR167, Sunflower
217
227
http://mg.genetics.ir/browse.php?a_code=A-10-109-420&slc_lang=fa&sid=1
فهیمه خلجی
فهیمه خلجی
10031947532846002507
10031947532846002507
No
بهروز شیران
بهروز شیران
10031947532846002508
10031947532846002508
No
فریبا رفیعی
فریبا رفیعی
10031947532846002509
10031947532846002509
No