Modern Genetics Journal
فصلنامه علمی ژنتیک نوین
MGj
General
http://mg.genetics.ir
1
admin
2008-4439
2008-4439
8
14
8888
13
fa
jalali
1396
9
1
gregorian
2017
12
1
12
3
online
1
fulltext
fa
مطالعه تنوع ژنتیکی برخی گونهها و زیرگونههای جنس ولیک (Crataegus spp.) در ایران با استفاده از نشانگرهای SSR
The Study of Genetic Diversity of Some Species and Sub-Species of Hawthorn (Crataegus spp.) in Iran using SSR Markers
جنس ولیک (Crataegus) بهدلیل سازگاری و همچنین تحمل به شرایط نامساعد بهعنوان پایهای مناسب برای برخی درختان میوه دانهدار بهویژه درخت به قابل استفاده است، اما بهدلیل پراکنش زیاد و تنوع ژنتیکی گسترده آن، طبقهبندی دقیقی از روابط ژنتیکی این گونه و کاربرد دقیق آنها وجود ندارد. این تحقیق بهمنظور بررسی تنوع و رابطه ژنتیکی شماری از گونههای ولیک در رویشگاهها و برخی از مراکز تنوع آن در ایران انجام شد. به این منظور 32 ژنوتیپ این جنس از 14 گونه و 10 زیر گونه مختلف با 32 جفت آغازگر اختصاصی SSR سیب و گلابی مورد بررسی قرار گرفتند. نتایج بیانگر تکثیر مجموعاً 422 باند در کلیه گونهها، زیرگونهها و ژنوتیپهای مورد بررسی بود و میانگین شاخص PIC برای جفت آغازگرها 77 درصد برآورد شد. ارزیابی فاصله ژنتیکی بین رویشگاهها با استفاده از ضریب تشابه ژنتیکی نی (Nei) نشاندهنده بیشترین فاصله بین دو رویشگاه استان کرمانشاه و مازندران و کمترین فاصله بین دو رویشگاه آذربایجان شرقی و گیلان بود. تجزیه خوشهای با استفاده از ضریب تشابه جاکارد و روش UPGMA بیانگر شباهت اندک ژنتیکی بین ژنوتیپها و در نتیجه خوشهبندی با فاصله زیاد در ژنوتیپهای مورد بررسی بود که این امر میتواند بهدلیل تنوع گونهها و سطوح پلوئیدی متعدد آنها باشد. در نهایت این بررسی نشاندهنده پراکندگی بالا و اختلاط شدید این ژنوتیپها در ایران بوده و بیانگر لزوم ارائه یک برنامه جامع جمعآوری و ارزیابی ژرمپلاسم بهمنظور کاربردهای بعدی گونههای این جنس میباشد.
Due to high adaptability and tolerance to stressful condition, genus hawthorn (Crataegus) is considered as useful rootstocks for several species of pome fruits. On the contrary, due to high genetic diversity of this genus little information is available on its genetic relatedness and accurate use of each species. This research was considered in order to evaluate genetic diversity of several species and sub-species of hawthorn species that have been collected from several habitats of this species in Iran. 32 hawthorn genotypes including 14 species and 10 sub-species were evaluated by 32 pairs of specific SSR primers of apples and pears. The results presented totally 422 amplified bands and mean PIC parameter was 77 percent for each individual primer pair. Evaluation of genetic distance between hawthorn habitats in Iran by matrix of Nei similarity showed the highest distance between Kermanshah and Mazandaran, while the least distance was observed between West Azarbaijan and Guilan habitats. Cluster analysis by using Jaccard`s coefficient and UPGMA method demonstrated low similarity of accumulated hawthorn genotypes and therefore high distance of clustering in hawthorn genotypes, that could be a consequence of numerous species and poloidy levels of evaluated genotypes. Finally this research demonstrated high dispersal and complexity of genetic diversity of this genus in Iran that presents necessity of a comprehensive program for collecting and evolution of hawthorn species in their habitats.
پلوییدی,تجزیه خوشهای,رویشگاه,ژنوتیپ,نشانگر ریزماهواره
Genotype, ,Habitat, Cluster analysis, Microsatellite marker, ,Poloidy
365
376
http://mg.genetics.ir/browse.php?a_code=A-10-109-498&slc_lang=fa&sid=1
محمد ترکاشوند
محمد ترکاشوند
10031947532846002798
10031947532846002798
No
حسن اکبری بیشه
حسن اکبری بیشه
10031947532846002799
10031947532846002799
No
امیرعباس تقی زاده
امیرعباس تقی زاده
10031947532846002800
10031947532846002800
No
حمید عبداللهی
حمید عبداللهی
10031947532846002801
10031947532846002801
No