<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Modern Genetics Journal</title>
<title_fa>فصلنامه علمی ژنتیک نوین</title_fa>
<short_title>MGj</short_title>
<subject>General</subject>
<web_url>http://mg.genetics.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>2008-4439</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2008-4439</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii>8</journal_id_pii>
<journal_id_doi></journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid>14</journal_id_sid>
<journal_id_nlai>8888</journal_id_nlai>
<journal_id_science>13</journal_id_science>
<language>fa</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1399</year>
	<month>7</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2020</year>
	<month>10</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>15</volume>
<number>2</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>شناسایی فاکتورهای رونویسی مسیر بیوسنتز توکوفرول با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی</title_fa>
	<title>Identification of transcription factors involved in the transcriptional regulation of gamma tocopherol methyl transferase gene using bioinformatics tools</title>
	<subject_fa>ژنتیک گیاهی</subject_fa>
	<subject>Subject 01</subject>
	<content_type_fa>پژوهشی کامل</content_type_fa>
	<content_type>Applicable</content_type>
	<abstract_fa>&amp;nbsp;
&lt;p dir=&quot;RTL&quot; style=&quot;margin: 0px 0px 13.33px; text-align: justify; line-height: normal; unicode-bidi: embed; direction: rtl;&quot;&gt;&lt;font color=&quot;#000000&quot;&gt;&lt;i&gt;&lt;span b=&quot;&quot; font-size:=&quot;&quot; lang=&quot;AR-SA&quot; style=&quot;margin: 0px; font-family: &quot;&gt;روغن&#8204;های خورا&lt;/span&gt;&lt;span b=&quot;&quot; font-size:=&quot;&quot; lang=&quot;FA&quot; style=&quot;margin: 0px; font-family: &quot;&gt;کی&lt;/span&gt;&lt;span b=&quot;&quot; font-size:=&quot;&quot; lang=&quot;AR-SA&quot; style=&quot;margin: 0px; font-family: &quot;&gt; یکی از کالاهای اساسی موجود در سبد غذایی مردم می&#8204;باشند و حفظ پایداری اکسیداتیو آن&#8204;ها جهت افزایش عمر انبارداری و ارتقای ارزش کیفی و تغذیه&#8204;ای محصول از اهمیت ویژه&#8204;ای برخوردار است. دستیابی به این هدف توسط افزایش محتوای آنتی&#8204;اکسیدان&#8204;های طبیعی نظیر توکوفرول&#8204;ها از طریق مهندسی متابولیک ژن&#8204;های کدکننده آنزیم&#8204;ها و فاکتورهای رونویسی کلیدی دخیل در مسیر بیوسنتز توکوفرول محقق می&#8204;شود. هدف از پژوهش حاضر، شناسایی فاکتورهای رونویسی متناظر با موتیف&#8204;های حفاظت&#8204;شده موجود در توالی پروموتری ژن گاما توکوفرول متیل ترنسفراز (&lt;/span&gt;&lt;/i&gt;&lt;i&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;margin: 0px;&quot;&gt;&lt;font face=&quot;Times New Roman&quot;&gt;VTE4&lt;/font&gt;&lt;/span&gt;&lt;/i&gt;&lt;span style=&quot;margin: 0px;&quot; dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;margin: 0px;&quot; dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;span b=&quot;&quot; font-size:=&quot;&quot; lang=&quot;FA&quot; style=&quot;margin: 0px; font-family: &quot;&gt;&lt;span style=&quot;margin: 0px;&quot; dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;margin: 0px;&quot; dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;/span&gt;)&lt;i&gt; &lt;/i&gt;به&#8204;عنوان یک گلوگاه محدودکننده در مسیر بیوسنتز توکوفرول در گیاه مدل &lt;/span&gt;&lt;i&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;margin: 0px;&quot;&gt;&lt;font face=&quot;Times New Roman&quot;&gt;Arabidopsis thaliana&lt;/font&gt;&lt;/span&gt;&lt;/i&gt;&lt;span style=&quot;margin: 0px;&quot; dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;margin: 0px;&quot; dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;span b=&quot;&quot; font-size:=&quot;&quot; lang=&quot;FA&quot; style=&quot;margin: 0px; font-family: &quot;&gt;&lt;span style=&quot;margin: 0px;&quot; dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;margin: 0px;&quot; dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;/span&gt; با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی می&#8204;باشد. بر اساس نتایج حاصل، فاکتورهای رونویسی یافت شده عمدتاً متعلق به خانواده&#8204;های هومئودومین (4/24 درصد)، &lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;margin: 0px;&quot;&gt;&lt;font face=&quot;Times New Roman&quot;&gt;bZIP&lt;/font&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;margin: 0px;&quot; dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;margin: 0px;&quot; dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;span b=&quot;&quot; font-size:=&quot;&quot; lang=&quot;FA&quot; style=&quot;margin: 0px; font-family: &quot;&gt;&lt;span style=&quot;margin: 0px;&quot; dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;margin: 0px;&quot; dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;/span&gt; (1/17 درصد)، &lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;margin: 0px;&quot;&gt;&lt;font face=&quot;Times New Roman&quot;&gt;SANT/MYB&lt;/font&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;margin: 0px;&quot; dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;margin: 0px;&quot; dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;span b=&quot;&quot; font-size:=&quot;&quot; lang=&quot;FA&quot; style=&quot;margin: 0px; font-family: &quot;&gt;&lt;span style=&quot;margin: 0px;&quot; dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;margin: 0px;&quot; dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;/span&gt; (6/14 درصد)، &lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;margin: 0px;&quot;&gt;&lt;font face=&quot;Times New Roman&quot;&gt;K-box&lt;/font&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;margin: 0px;&quot; dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;margin: 0px;&quot; dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;span b=&quot;&quot; font-size:=&quot;&quot; lang=&quot;FA&quot; style=&quot;margin: 0px; font-family: &quot;&gt;&lt;span style=&quot;margin: 0px;&quot; dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;margin: 0px;&quot; dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;/span&gt; (2/12 درصد)، &lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;margin: 0px;&quot;&gt;&lt;font face=&quot;Times New Roman&quot;&gt;MADS-box&lt;/font&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;margin: 0px;&quot; dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;margin: 0px;&quot; dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;span b=&quot;&quot; font-size:=&quot;&quot; lang=&quot;FA&quot; style=&quot;margin: 0px; font-family: &quot;&gt;&lt;span style=&quot;margin: 0px;&quot; dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;margin: 0px;&quot; dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;/span&gt; (2/12 درصد) و &lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;margin: 0px;&quot;&gt;&lt;font face=&quot;Times New Roman&quot;&gt;MYB&lt;/font&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;margin: 0px;&quot; dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;margin: 0px;&quot; dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;span b=&quot;&quot; font-size:=&quot;&quot; lang=&quot;FA&quot; style=&quot;margin: 0px; font-family: &quot;&gt;&lt;span style=&quot;margin: 0px;&quot; dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;margin: 0px;&quot; dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;/span&gt; (2/12 درصد) بودند. علاوه بر این، تحلیل عملکرد فاکتورهای رونویسی حاصله ارتباط معنی&#8204;دار میان بیوسنتز توکوفرول، پاسخ به تنش&#8204;های غیرزنده و مسیرهای سیگنال&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;margin: 0px;&quot;&gt;&lt;font face=&quot;Times New Roman&quot;&gt;&amp;shy;&lt;/font&gt;&lt;/span&gt;&lt;span b=&quot;&quot; font-size:=&quot;&quot; lang=&quot;FA&quot; style=&quot;margin: 0px; font-family: &quot;&gt;دهی هورمونی به&#8204;خصوص آبسیزیک اسید و جیبرلیک اسید را نشان داد. از طرف دیگر، نقش محرک&#8204;های نوری، به&#8204;ویژه نور قرمز و مادون&#8204;قرمز و اجزای مسیر سیگنال&lt;/span&gt;&lt;/font&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;margin: 0px;&quot;&gt;&lt;font face=&quot;Times New Roman&quot;&gt;&lt;span style=&quot;margin: 0px;&quot;&gt;&lt;ins datetime=&quot;2020-04-08T12:42&quot;&gt;&lt;font color=&quot;#008080&quot;&gt;&amp;shy;&lt;/font&gt;&lt;/ins&gt;&lt;/span&gt;&lt;/font&gt;&lt;font color=&quot;#000000&quot; face=&quot;Times New Roman&quot;&gt;&amp;shy;&lt;/font&gt;&lt;/span&gt;&lt;font color=&quot;#000000&quot;&gt;&lt;span b=&quot;&quot; font-size:=&quot;&quot; lang=&quot;FA&quot; style=&quot;margin: 0px; font-family: &quot;&gt;دهی نوری در القای بیان فاکتورهای رونویسی مرتبط با ژن &lt;/span&gt;&lt;i&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;margin: 0px;&quot;&gt;&lt;font face=&quot;Times New Roman&quot;&gt;VTE4&lt;/font&gt;&lt;/span&gt;&lt;/i&gt;&lt;span style=&quot;margin: 0px;&quot; dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;margin: 0px;&quot; dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;span b=&quot;&quot; font-size:=&quot;&quot; style=&quot;margin: 0px; font-family: &quot;&gt;&lt;span style=&quot;margin: 0px;&quot; dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;margin: 0px;&quot; dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;/span&gt; &lt;span lang=&quot;FA&quot; style=&quot;margin: 0px;&quot;&gt;به&#8204;وضوح&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;margin: 0px;&quot; dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;margin: 0px;&quot; dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;i&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; lang=&quot;FA&quot; style=&quot;margin: 0px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;margin: 0px;&quot; dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;margin: 0px;&quot; dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;font face=&quot;Times New Roman&quot;&gt; &lt;/font&gt;&lt;/span&gt;&lt;/i&gt;&lt;span b=&quot;&quot; font-size:=&quot;&quot; lang=&quot;FA&quot; style=&quot;margin: 0px; font-family: &quot;&gt;مشاهده گردید.&lt;/span&gt;&lt;/font&gt;&lt;span style=&quot;margin: 0px;&quot; dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;</abstract_fa>
	<abstract>&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;Edible oils are one of the essential commodities in the food basket of the people. Maintaining oil oxidative stability to extend shelf life and enhance the quality and nutritional value of the product is particularly important. &lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;This is achieved by increasing the content of natural antioxidants such as tocopherols as additives or by modifying their content and composition in oilseed plant through metabolic engineering of key enzymes or transcription factors involved in tocopherol biosynthesis. The present study aimed to identify transcription factors corresponding to conserved motifs in the promoter regions of &lt;em&gt;VTE4 &lt;/em&gt;and its orthologous genes as a limiting bottleneck in tocopherol biosynthesis using bioinformatics tools. The results showed that the transcription factors mainly belonged to hemodomain-like (24.4%), bZIP (17.1%), SANT / MYB (14.6%), K-box (12.2%), MADS-box (12.2%) and MYB (12.2%) families. Furthermore, functional analysis of transcription factors indicated a significant interaction between response to abiotic stresses, hormone signaling pathways, especially abscisic acid and gibberellic acid, and the tocopherol biosynthesis pathway. On the other hand, the prominent role of light stimuli, in particular, red and infrared light, and light signaling pathway components was observed in the induction of expression of &lt;em&gt;VTE4&amp;rsquo;s&lt;/em&gt; transcription factors.&lt;/span&gt;</abstract>
	<keyword_fa>آنتی‌اکسیدان, توکوفرول, فاکتورهای رونویسی, گاما توکوفرول متیل ترنسفراز, مسیر سیگنال‌دهی نوری.</keyword_fa>
	<keyword>Antioxidants, Gamma tocopherol methyl transferase, Light signaling pathway, Tocopherols, Transcription factors.</keyword>
	<start_page>183</start_page>
	<end_page>189</end_page>
	<web_url>http://mg.genetics.ir/browse.php?a_code=A-10-57-3&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Nina</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Mastour Tehrani</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>نینا</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>مستور طهرانی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>n_mastour@ut.ac.ir</email>
	<code>10031947532846005107</code>
	<orcid>10031947532846005107</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>University of Tehran</affiliation>
	<affiliation_fa>دانشگاه تهران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Alireza</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Taleei</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>علیرضا</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>طالعی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>ataleei@ut.ac.ir</email>
	<code>10031947532846005108</code>
	<orcid>10031947532846005108</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>University of Tehran</affiliation>
	<affiliation_fa>دانشگاه تهران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Naser</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Farrokhi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>ناصر</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>فرخی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>n_farrokhi@sbu.ac.ir</email>
	<code>10031947532846005109</code>
	<orcid>10031947532846005109</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Shahid Beheshti University</affiliation>
	<affiliation_fa>دانشگاه شهید بهشتی</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Mohammad Reza</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Naghavi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>محمدرضا</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>نقوی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>mnaghavi@ut.ac.ir</email>
	<code>10031947532846005110</code>
	<orcid>10031947532846005110</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>University of Tehran</affiliation>
	<affiliation_fa>دانشگاه تهران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Mahdi</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Ghaffari</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>مهدی</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>غفاری</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>ghaffari@areeo.ac.ir</email>
	<code>10031947532846005111</code>
	<orcid>10031947532846005111</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Seed and Plant Improvement, Karaj</affiliation>
	<affiliation_fa>مؤسسه اصلاح و تهیه نهال و بذر، کرج</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
