Modern Genetics Journal

fa بررسی الگوی بیان PdumiR160a ، PdumiR168 و PdumiR171a و ژن های هدف آن ها در اندام های زایشی بادام در پاسخ به تنش سرما Study the expression pattern of PdumiR160a, PdumiR168 and PdumiR171a and their target genes in reproductive tissues of almond in response to cold stress ژنتیک گیاهی Subject 01 پژوهشی کامل Applicable سرمای دیررس بهاره به‌عنوان مهمترین محدودیت محیطی برای بادام محسوب میشود و به‌واسطه صدمه به بافتهای زایشی همه ساله منجر به خسارت قابل توجهی در تولید محصول آن میشود. از آنجایی که اطلاعات بسیار محدودی دررابطه با پاسخ این گیاه به تنش سرمازدگی بهاره وجود دارد و از طرف دیگر با توجه به نقش مهم تنظیمی miRNA‌ها در بسیاری از شبکههای تنظیمی، بر اساس اطلاعات حاصل از آنالیز نتایج توالی‌یابی RNA و sRNA‌های بادام، سه ژن Pdu-miR160a، Pdu-miR168 و Pdu-miR171a به‌عنوان miRNA‌های پاسخ دهنده به تنش سرما به‌همراه ژنهای هدفشان انتخاب و به‌منظور تأیید نتایج توالییابی، بیان آنها با استفاده از روش RT-qPCR در اندامهای زایشی دو ژنوتیپ متحمل H و حساس به سرمای Sh12 تحت دو تیمار تنش صفر و 2- درجه سانتی‌گراد مورد بررسی قرار گرفت. نتایج، نقش تنظیمی منفی سه miRNA مورد مطالعه را در پاسخ به هر دو تیمار تنش سرمایی در ژنوتیپ H نشان داد. اما بر خلاف ژنوتیپ H، نقش تنظیمی مثبت Pdu-miR168 و Pdu-miR171a در پاسخ به تنش سرما در رقم Sh12 آشکار شد. نتایج آزمون همبستگی پیرسون، وجود همبستگی منفی بین Pdu-miR160a و PduARF18 تحت هر دو تنش سرمایی را تنها در اندامهای زایشی بساک و تخمدان رقم Sh12 نشان داد. این در حالی بود که وجود همبستگی منفی میان Pdu-miR168 وPduAGO1 تنها در تخمدان ژنوتیپ H تحت هر دو تنش تیمار سرمایی مشاهده شد. همچنین اثر تنظیمی منفی Pdu-miR171a بر ژن هدف PduSCL6 تحت تنش 2- درجه سانتیگراد در تخمدان ژنوتیپ H و هر دو بافت زایشی رقم Sh12 آشکار شد.   Cold spring frost is considered as the most important environmental constraint for almond and due to damage to reproductive tissues annually, it causes significant damage to its product. Since little information is available regarding the molecular response of this plant to the frost stress and considering the important role of regulatory microRNA (miRNAs) in many regulatory networks, based on the data from RNA and sRNA sequencing analysis of almond, three microRNA namely, PdumiR160a, PdumiR168 and PdumiR171a with their target genes were selected as cold stress-responsive microRNA. Confirmation of miRNAs expression patterns by quantitative real-time PCR (RT-qPCR) was performed in reproductive tissues of cold-tolerant genotype (H) alongside a sensitive variety (Sh12) under two stress conditions of 0 and -2 ° C. The results showed the negative regulatory role of two miRNAs in response to both cold stresses, but unlike the H genotype, the positive regulatory role of PdumiR168 and PdumiR171a were revealed under cold stress in both reproductive tissues of Sh12 variety. Pearson correlation test showed a negative correlation between PdumiR160a and PduARF18 under both cold stress treatments in the reproductive tissues of Sh12 variety. However, the negative correlation was observed between PdumiR168 and PduAGO1 in ovary tissue of H genotype under two cold stress conditions. Also, in this study, the negative regulatory role of PdumiR171a on the PduSCL6 target gene was revealed under -2 ° C in ovary tissue of H genotype and both reproductive tissues of Sh12 variety. تنش سرما, PdumiR160a, PdumiR168 ,PdumiR171a, RT-qPCR Cold stress, PdumiR160a, PdumiR168, PdumiR171a, RT-qPCR 161 173 http://mg.genetics.ir/browse.php?a_code=A-10-149-1&slc_lang=fa&sid=1 Marzieh Karimi مرضیه کریمی mr.karimi83@gmail.com 10031947532846005653 10031947532846005653 No Shahrekord University دانشگاه شهرکرد Behrouz Shiran بهروز شیران beshiran45@gmail.com 10031947532846005654 10031947532846005654 Yes Shahrekord University دانشگاه شهرکرد Mohammad Rabiei محمد ربیعی k_rabiei@yahoo.com 10031947532846005655 10031947532846005655 No Shahrekord University دانشگاه شهرکرد Hossein Fallahi حسین فلاحی fallahi.raziuni@gmail.com 10031947532846005656 10031947532846005656 No Razi University دانشگاه رازی کرمانشاه