Modern Genetics Journal

fa ارزیابی اثرات اصلی و متقابل ژنوتیپ × محیط و برآورد ضرایب همبستگی ارزش‌های اصلاحی ژنومی صفات کیفیت نانوایی گندم (T.aestivum L.) Evaluation of the main and genotype × environment interaction effects of and estimation of correlation coefficients of genomic breeding values of bakery quality traits of bread wheat ژنتیک گیاهی Subject 01 پژوهشی کامل Applicable جهت ارزیابی اثرات اصلی و متقابل ژنوتیپ × محیط و برآورد و مقایسه ضرایب همبستگی ارزش‌های اصلاحی ژنومی صفات کیفیت نانوایی گندم در یک جمعیت پیشرفته اصلاحی گندم نان، آزمایشی در قالب طرح آلفا لاتیس در سه تکرار با 50 لاین و ارقام شاهد در ایستگاه تحقیقاتی چرداول مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعی استان ایلام به مدت دو سال اجرا شد. تجزیه واریانس صفات کیفیت نانوایی گندم به صورت ساده و مرکب انجام و عامل ژنوتیپ، سال و اثر متقابل ژنوتیپ × سال بر میزان پروتئین خام، عدد فالینگ، عدد زلنی و اندازه حجم رسوب SDS معنی‌دار بود. برای برآورد ارزش‌های اصلاحی ژنومی از روش ddRAD-Seq و بستر NextSeqTM500Illumina استفاده شد. تعداد کل SNP های صحیح فراخونی شده برای 50 درصد داده گم‌شده برابر با 3342 عدد، که تعداد 1322 بر ژنوم B، 1253 بر ژنوم A و 767 روی ژنوم D و بیشترین SNP بر روی کروموزوم دو و سه از ژنوم B و کمترین آن روی کروموزوم چهار از ژنوم D شناسائی شد. برآورد ضریب همبستگی ارزش اصلاحی ژنومی در سال اول، دوم و متوسط دو سال برای صفات پروتئین خام، عدد فالینگ و عدد زلنی با روش‌های آماری رگرسیون LASSO و رگرسیون شبکه الاستیک صورت گرفت و برای اندازه حجم رسوب SDS هیچگونه مدلی برازش نشد. To evaluate the main and genotype × environment interaction effects of and to estimate and compare the correlation coefficients of genomic breeding values of bread wheat bakery quality traits in an advanced bread wheat breeding population, an experiment in the form of alpha lattice design in three replications with 50 lines and checks in Chardaval research station Ilam Agricultural and Natural Resources Research and Education Center was conducted for two growing years in row. Analysis of variance simple and combined for bread wheat bread-making qualitative traits was performed. Combined analysis of variance indicated significant effects of genotype, environment and interactions of genotype × environment. In order to calculate genomic breeding values of ddRAD-Seq method and NextSeq TM 500 Illumina ® platform were used. The total number of correct SNPs recalled for 50% of the missing data were 3342, of which 1322, 1253 and 767were on the B, A & D genomes respectively. The highest SNPs on the 2B and 3B and the lowest on 4D chromosomes were identified. The correlation coefficients of genomic breeding values in the first, second and mean two years for crude protein, Falling number and Zeleny number traits was estimated by LASSO regression and elastic net regression and no model was fitted for SDS sediment volume. اثرات اصلی و متقابل, روش آماری, ژنوتیپ‌سنجی به روش ddRAD-Seq, ضرایب همبستگی برآورد ارزش اصلاحی ژنومی, گندم نان Bread wheat, Genotyping by ddRAD-Seq, Main and interaction effects, Statistical methods 387 401 http://mg.genetics.ir/browse.php?a_code=A-10-395-1&slc_lang=fa&sid=1 Mohammad Reza Bihamta محمد رضا بی همتا mrghanad@ut.ac.ir 10031947532846007324 10031947532846007324 No University of Tehran دانشگاه تهران Mohammad Armion محمد آرمیون armion@ut.ac.ir 10031947532846007325 10031947532846007325 No Ilam Agricultural and Natural Resources Research and Education Center مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعی ایلام Reza Maali Amiri رضا معالی امیری rmamiri@ut.ac.ir 10031947532846007326 10031947532846007326 No University of Tehran دانشگاه تهران Manuchehr Khodarahmi منوچهر خدارحمی khodarahmi_m@yahoo.com 10031947532846007327 10031947532846007327 No Seed and Plant Improvement Institute موسسه تحقیقات اصلاح و تهیه نهال و بذر Sachiko Isobe ساچیکو ایسوبه sisobe@kazusa.or.jp 10031947532846007328 10031947532846007328 Yes Kazusa DNA Research Institute موسسه تحقیقات DNA کازوسا ژاپن