fa شناسایی و تعیین خصوصیات میکرو RNAهای حفاظت شده در ریشه گیاه ریواس (Rheum ribes) ژنتیک گیاهی Subject 01 پژوهشی کامل Applicable <div style="text-align: justify;"> <p dir="RTL" style="text-align: justify;"><span style="font-size:14px;"><span style="font-family:Tahoma;"><span style="direction:rtl"><span style="unicode-bidi:embed">miRNA<span lang="AR-SA">ها (میرناها) دسته‌ای از مولکول‌های </span>RNA<span lang="AR-SA"> کوتاه غیر کدکننده‌، با طولی حدود 24-18 نوکلئوتید هستند که ژن‌های هدف را در سطح پس از رونویسی کنترل می‌کنند. هیچ‌گونه گزارشی از شناسایی میرناها در گیاه ریواس ثبت نشده است. لذا در مطالعه حاضر به‌منظور پیش‌بینی میرناهای حفاظت شده بالقوه و ژن‌های هدفشان در ریشه گیاه ریواس، </span>RNA کل از بافت ریشه استخراج شد و مورد توالی‌یابی قرار گرفت. سپس رونوشت‌های غیرکننده پروتئین شناسایی شدند و به‌عنوان توالی‌های نامزد پیش‌ساز میرنا در نظر گرفته شدند. در این مطالعه 82047 رونوشت از گیاه ریواس به‌روش سرهم‌بندی نوپدید ایجاد شد. با جستجوی همولوژی این رونوشت‌ها با پایگاه داده &nbsp;mirbas<span lang="AR-SA">و پیش‌بینی ساختار ثانویه، 4 میرنا محافظت شده متعلق به خانواده‌های </span>mir396<span lang="AR-SA">، </span>mir164<span lang="AR-SA">، </span>mir319<span lang="AR-SA"> و </span>mir168<span lang="AR-SA"> شناسایی شدند. 574 رونوشت از ترانسکریپتوم ریشه ریواس توسط این میرناها مورد هدف قرار گرفتند. در مجموع با توجه به نقش تنظیمی میرناهای شناسایی شده بر طیف وسیعی از ژن‌ها، می‌توان از این میرناها در شناسایی ژن‌های مرتبط با متابولیت‌های ثانویه بهره برد. </span></span></span></span></span></p> <p></p></div> <p><span style="font-size:14px;"><span style="font-family:Tahoma;">&nbsp;</span></span></p> <div style="text-align: justify;"><span style="font-size:11pt"><span style="line-height:normal"><span style="font-family:Calibri,sans-serif"><span style="font-size:12.0pt"><span new="" roman="" style="font-family:" times="">MicroRNAs (miRNAs) are a group of short non-coding RNA molecules with a length of about 18-24 nucleotides, which control target genes expression at the post-transcriptional level. There are no reports of miRNA detection in <i>Rheum ribes</i> plant. Therefore, in the present study, in order to predict potential conserved miRNAs and their target genes in <i>R.ribes</i> roots, total RNA was extracted from the root tissue and sequenced. Then, non-coding transcripts were identified in <i>R.ribes</i> transcriptome and considered as miRNA precursor candidate sequences. In this study, 82047 transcripts were created from <i>R</i>.<i>ribes</i> root by <i>de novo</i> assembly method. By searching the homology of these transcripts with mirbas database and secondary structure prediction, 4 conserved miRNAs belonging to mir396, mir164, mir319 and mir168 families were identified. 574 transcripts from <i>R</i>.<i>ribes</i> root transcriptome were targeted by these miRNAs. In general, due to the regulatory role of identified miRNAs on a wide range of genes, these miRNAs can be used to identify genes related to secondary metabolites.</span></span></span></span></span></div> <span style="font-size:10pt"><span style="line-height:normal"><span style="unicode-bidi:embed"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><span style="color:black"><span style="background:yellow"><span style="font-family:"TimesNewRomanPSMT",serif"></span></span></span></span></span></span></span><br> <br> <span style="font-size:15pt"><span style="unicode-bidi:embed"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><span style="color:black"><span style="font-weight:bold"><span style="font-size:10.0pt"></span></span></span></span></span></span><br> &nbsp; ریواس, ساختار ثانویه, میرنا, هستی‌شناسی ژن, Rheum ribes Gene ontology, MiRNA, Rheum ribes, Secondary structure 357 366 http://mg.genetics.ir/browse.php?a_code=A-10-122-4&slc_lang=fa&sid=1 Asad Tafsiri اسعد تفسیری 10031947532846007997 10031947532846007997 No Lorestan University دانشگاه لرستان Ahmad Ismaili احمد اسماعیلی ismaili.a@lu.ac.ir 10031947532846007998 10031947532846007998 Yes Lorestan University دانشگاه لرستان Farhad Nazarian Firouzabadi فرهاد نظریان فیروزآبادی 10031947532846007999 10031947532846007999 No Lorestan University دانشگاه لرستان Mohammad Majdi محمد مجدی 10031947532846008000 10031947532846008000 No University of Kurdistan دانشگاه کردستان