<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Modern Genetics Journal</title>
<title_fa>فصلنامه علمی ژنتیک نوین</title_fa>
<short_title>MGj</short_title>
<subject>General</subject>
<web_url>http://mg.genetics.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>2008-4439</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2008-4439</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii>8</journal_id_pii>
<journal_id_doi></journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid>14</journal_id_sid>
<journal_id_nlai>8888</journal_id_nlai>
<journal_id_science>13</journal_id_science>
<language>fa</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1402</year>
	<month>7</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2023</year>
	<month>10</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>18</volume>
<number>2</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>بررسی تنوع ژنتیکی موجود در گونه‌های Aegilops crassa و Aegilops cylindrica با استفاده از نشانگرهای SCoT</title_fa>
	<title>Assessment of genetic diversity among Aegilops crassa and Aegilops cylindrica species using SCoT markers</title>
	<subject_fa>ژنتیک گیاهی</subject_fa>
	<subject>Subject 01</subject>
	<content_type_fa>پژوهشی کامل</content_type_fa>
	<content_type>Applicable</content_type>
	<abstract_fa>&lt;p dir=&quot;RTL&quot; style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Tahoma;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;direction:rtl&quot;&gt;&lt;span style=&quot;unicode-bidi:embed&quot;&gt;&lt;span lang=&quot;FA&quot;&gt;گونه&amp;shy;های متعلق به جنس آژیلوپس به&#8204;عنوان یکی از مهم&#8204;ترین ذخایر ژنتیکی گندم محسوب می&#8204;شوند. این منابع ژرم&amp;shy;پلاسمی به&#8204;واسطه پتانسیل&amp;shy;های اصلاحی خود همواره منبع ژنی غنی برای استفاده در برنامه&#8204;های به&#8204;نژادی گندم محسوب می&#8204;شوند. در این مطالعه تنوع ژنتیکی موجود در 60 توده آژیلوپس متعلق به دو گونه &lt;/span&gt;&lt;i&gt;Ae. crassa&lt;/i&gt;&lt;i&gt; &lt;/i&gt;&lt;span lang=&quot;FA&quot;&gt;و &lt;/span&gt;&lt;i&gt;Ae. cylindrica&lt;/i&gt;&lt;i&gt; &lt;/i&gt;&lt;span lang=&quot;FA&quot;&gt;با استفاده از نشانگرهای &lt;/span&gt;SCoT&lt;span lang=&quot;FA&quot;&gt; مورد بررسی قرار گرفت. بررسی الگوی باندی به&#8204;دست آمده از آغازگرهای استفاده شده نشان داد در مجموع 171 قطعه در توده&#8204;های مورد بررسی تکثیر یافت که 156 قطعه چندشکل بودند. متوسط شاخص اطلاعات چندشکلی (&lt;/span&gt;PIC&lt;span lang=&quot;FA&quot;&gt;)، قدرت تمایز (&lt;/span&gt;Rp&lt;span lang=&quot;FA&quot;&gt;) و شاخص نشانگر (&lt;/span&gt;MI&lt;span lang=&quot;FA&quot;&gt;) به&#8204;ترتیب 30/0، 27/16 و 18/3 برآورد شد. نتایج تجزیه واریانس مولکولی (&lt;/span&gt;AMOVA&lt;span lang=&quot;FA&quot;&gt;) نشان داد بیشترین میزان تنوع ژنتیکی مربوط به درون گونه&#8204;ها بود (79% در مقابل 21%). بررسی شاخص&#8204;های تنوع ژنتیکی نیز نشان داد بیشترین میزان تنوع ژنتیکی مربوط به گونه &lt;/span&gt;&lt;i&gt;Ae. crassa&lt;/i&gt;&lt;i&gt; &lt;/i&gt;&lt;span lang=&quot;FA&quot;&gt;بود. نتایج حاصل از تجزیه خوشه&#8204;ای بر اساس ماتریس تشابه ژنتیکی جاکارد نشان داد کلیه توده&#8204;ها در دو گروه اصلی مجزا شدند، به&#8204;طوری که الگوی گروه&amp;shy;بندی منطبق با ساختار ژنومی توده&#8204;ها بود. علاوه براین، نتایج تجزیه به مختصات اصلی (&lt;/span&gt;PCoA&lt;span lang=&quot;FA&quot;&gt;) نیز تأیید کننده گروه&#8204;بندی به&#8204;دست آمده از تجزیه خوشه&#8204;ای بود. به&#8204;طور کلی این نتایج می&#8204;تواند بیانگر قابلیت نشانگرهای &lt;/span&gt;SCoT&lt;span lang=&quot;FA&quot;&gt; در تمایز توده&#8204;های ژرم&#8204;پلاسمی بر اساس ساختار ژنومی آن&#8204;&lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;FA&quot;&gt;&#8204;&#8204;&#8204;ها باشد. از این&#8204;رو، استفاده از این سیستم نشانگری در دیگر مطالعات ژنتیکی قابل توصیه می&amp;shy;باشد. &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p&gt;&lt;/p&gt;</abstract_fa>
	<abstract>&lt;div style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt&quot;&gt;&lt;span new=&quot;&quot; roman=&quot;&quot; style=&quot;font-family:&quot; times=&quot;&quot;&gt;Species belonging to the &lt;i&gt;Aegilops&lt;/i&gt; genus are one of the most important genetic resources of wheat. This germplasm due to its breeding potential usually is served in wheat breeding programs. In the present study, genetic diversity among 60 accessions belonging to &lt;i&gt;Ae. crassa&lt;/i&gt; and &lt;i&gt;Ae. cylindrica&lt;/i&gt; were investigated using start codon targeted polymorphism (SCoT) markers. The obtained banding pattern showed that in total 171 fragments were amplified across all investigated accessions, out of which 156 were polymorphic. The average values for polymorphism information content (PIC), resolving power (Rp), and marker index (MI) indices were estimated as 0.30, 16.27, and 3.18, respectively. The results of molecular analysis of variance (AMOVA) indicated that the most portion of genetic variation was belonged to within species than between them (79% vs. 21%). Based on the genetic variation parameters, &lt;i&gt;Ae. crassa&lt;/i&gt; species showed greater levels of genetic variation compared with &lt;i&gt;Ae. cylindrica&lt;/i&gt; species. The results of cluster analysis based on Jaccard&amp;rsquo;s similarity matrix grouped all investigated accessions into two main groups, so that the grouping pattern was in accordance with their genomic constitution. Moreover, the results of principal coordinate analysis (PCoA) confirmed the grouping pattern obtained by cluster analysis. In conclusion, our results revealed considerable efficiency of SCoT markers in grouping the studied germplasm; hence the use of this marker system could be recommended in other genetic studies.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/div&gt;</abstract>
	<keyword_fa>آژیلوپس, تنوع ژنتیکی, نشانگرهای مبتنی بر ژن, تجزیه واریانس مولکولی</keyword_fa>
	<keyword>Aegilops, genetic diversity, gene-targeted markers, analysis of molecular variance</keyword>
	<start_page>151</start_page>
	<end_page>160</end_page>
	<web_url>http://mg.genetics.ir/browse.php?a_code=A-10-124-3&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>aLISAJJAD</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Bokaii</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>علی سجاد</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>بکایی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>as.bokaei@yahoo.com</email>
	<code>10031947532846007709</code>
	<orcid>10031947532846007709</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>University of Mohaghegh Ardabili,</affiliation>
	<affiliation_fa>دانشگاه محقق اردبیلی</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Omid</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Sofalian</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>امید</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>سفالیان</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>sofalian@gmail.com</email>
	<code>10031947532846007710</code>
	<orcid>10031947532846007710</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>University of Mohaghegh Ardabili,</affiliation>
	<affiliation_fa>دانشگاه محقق اردبیلی</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Behzad</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Sorkhi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>بهزاد</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>سرخی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>bsorkhi@gmail.com</email>
	<code>10031947532846007711</code>
	<orcid>10031947532846007711</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>of Seed and Plant Improvement Institute, Agricultural Research Education and Extension Organization, Karaj, Iran.</affiliation>
	<affiliation_fa>موسسه تحقیقات اصلاح و تهیه نهال و بذر، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Ali</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Asghari</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>علی</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>اصغری</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>a_asghari@uma.ac.ir</email>
	<code>10031947532846007712</code>
	<orcid>10031947532846007712</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>University of Mohaghegh Ardabili,</affiliation>
	<affiliation_fa>دانشگاه محقق اردبیلی. دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی. گروه نهندسی تولید و ژنتیک گیاهی. 179</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Alireza</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Pourabugaddareh</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>علیرضا</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>پورابوقداره</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>a.poraboghadareh@gmail.com</email>
	<code>10031947532846007713</code>
	<orcid>10031947532846007713</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Seed and Plant Improvement Institute, Agricultural Research Education and Extension Organization, Karaj, Iran.</affiliation>
	<affiliation_fa>موسسه تحقیقات اصلاح و تهیه نهال و بذر، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
