fa تجزیه و تحلیلی جامع بر خانواده ژنی Snakin/GASA: بینشی بر منشاء، گسترش، تنوع و بیان آن‌ها ژنتیک گیاهی Subject 01 پژوهشی کامل Applicable <p style="text-align: justify;"><span style="font-size:14px;"><span style="font-family:IRANsans;"><span dir="RTL" lang="AR-SA">خانواده</span>&nbsp;nakin/GASA<span dir="RTL" lang="FA"> پپتیدهای کوچک غنی از سیستئینی هستند که به‌طور گسترده در ژنوم گیاه توزیع شده و در رشد و توسعه و پاسخ گیاهان به تنش‌های </span><span dir="RTL" lang="AR-SA">زیستی</span><span dir="RTL" lang="FA">&nbsp; و غیرزیستی نقش دارند. در مطالعه حاضر، وجود خانواده ژنی </span>GASA<span dir="RTL" lang="FA"> در موجودات مختلف بررسی شد همچنین ساختار و تغییرات بیان این خانواده ژنی در&nbsp; گیاهان&nbsp; مختلف مقایسه شد. علاوه بر این، تغییرات پس از ترجمه و خاصیت ضد میکروبی پروتئین‌های </span>GASA<span dir="RTL" lang="FA"> برای درک بیشتر مکانیسم‌های تنظیمی پیش‌بینی شد. حضور&nbsp; دمین </span>GASA<span dir="RTL" lang="FA">، پپتید سیگنال، تجمع خارج سلولی، شش پل دی‌سولفیدی، فسفوریلاسیون پس از ترجمه و فعالیت ضدمیکروبی برای همه ژن‌های </span>GASA<span dir="RTL" lang="FA"> مشاهده شد. الگوی بیان متفاوت در بافت‌های مختلف </span>(logFPKM= 0- 2.5)<span dir="RTL"> و القا تحت تنش‌های زیستی، غیرزیستی و هورمونی (در بازه </span>logFold Change= -10 - +5<span dir="RTL" lang="FA"> در شرایط خشکی و گرما) از دیگر ویژگی‌های این ژن‌ها بود و همچنین عناصر سیس تنظیم کننده کلیدی در نواحی پیشبر این ژن&shy;ها شناسایی شد که بیانگر این است که ژن&shy;های </span>Snakin/GASA<span dir="RTL" lang="FA"> به&shy;عنوان یک خانواده ژنی مهم، نقش و عملکرد&shy;های متنوعی دارند. همچنین نتایج نشان داد که اغلب پروتئین‌های </span>GASA<span dir="RTL" lang="FA"> مورد مطالعه بر اساس خصوصیات فیزیکوشیمیایی، ناپایدار و آبگریز بودند. همچنین، برهمکنش قوی بین ژن‌های خانواده </span>GASA<span dir="RTL" lang="FA"> و عوامل رونویسی از خانواده‌های </span>Dof<span dir="RTL" lang="FA">، </span>ERF<span dir="RTL" lang="FA"> و </span>MYB<span dir="RTL" lang="FA"> در آرابیدوپسیس و برنج پیش‌بینی شد. به&shy;طور کلی، این نتایج می&shy;تواند دانش ما را در مورد عملکرد ژن‌های </span>GASA<span dir="RTL" lang="FA"> بهبود بخشد و داده‌هایی را برای تحقیقات آینده فراهم کند. </span></span></span></p> <div dir="ltr" style="text-align: justify;"></div> <div style="text-align: justify;"><span style="font-size:11pt"><span style="line-height:115%"><span style="font-family:Calibri,sans-serif"><span style="font-size:12.0pt"><span style="line-height:115%"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><span style="color:black">The Snakin/GASA family consists of small, cysteine-rich peptides that are widely distributed across plant genomes, playing crucial roles in plant growth, development, and responses to biotic and abiotic stresses. In this study, the presence of the GASA gene family across various organisms was examined, and structural and expression variations of these genes were compared in different plant species. Additionally, post-translational modifications and the antimicrobial properties of GASA proteins were predicted to provide further insight into their regulatory mechanisms. Key characteristics observed for all GASA genes included the presence of the GASA domain, signal peptides, extracellular accumulation, six disulfide bridges, post-translational phosphorylation, and antimicrobial activity. Differential expression patterns were noted in various tissues (logFPKM = 0-2.5), with induction under biotic, abiotic, and hormonal stresses (logFold Change ranging from -10 to +5, particularly under drought and heat conditions). Furthermore, key cis-regulatory elements were identified in the promoter regions of these genes, highlighting the diverse roles and functions of the Snakin/GASA gene family. Physicochemical analysis revealed that most of the studied GASA proteins were unstable and hydrophobic. A strong interaction was also predicted between the GASA gene family and transcription factors from the Dof, ERF, and MYB families in both Arabidopsis and rice. Overall, these findings provide valuable insights into the functional diversity of GASA genes and offer a foundation for future research.</span></span></span></span></span></span></span></div> بیان اختصاصی بافت, تجزیه و تحلیل ژنومی, تنش‌های زیستی و غیر زیستی, خانواده ژنی Snakin/GASA, گیاهان تک‌لپه و دو‌لپه Biotic and abiotic stresses, Genomic Analysis, Monocot and Dicot plants, Snakin/GASA gene family, Tissue-specific expression 75 89 http://mg.genetics.ir/browse.php?a_code=A-10-122-5&slc_lang=fa&sid=1 Anahita Panji آناهیتا پنجی panji.a1367@gmail.com 10031947532846008297 10031947532846008297 No Department of Plant Production and Genetic Engineering, Faculty of Agriculture, Lorestan University, Khorramabad, Iran گروه مهندسی تولید و ژنتیک گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه لرستان، خرم‌آباد، ایران Ahmad Ismaili احمد اسماعیلی Ismaili.a@lu.ac.ir 10031947532846008298 10031947532846008298 Yes Department of Plant Production and Genetic Engineering, Faculty of Agriculture, Lorestan University, Khorramabad, Iran گروه مهندسی تولید و ژنتیک گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه لرستان، خرم‌آباد، ایران Seyyed Mohsen Sohrabi سید محسن سهرابی sm.shorabi@scu.ac.ir 10031947532846008299 10031947532846008299 No Department of Production Engineering and Plant Genetics, Faculty of Agriculture, Shahid Chamran University of Ahvaz, Ahvaz, Iran گروه مهندسی تولید و ژنتیک گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید چمران اهواز، اهواز، ایران