fa ارزیابی تنوع ژنتیکی بین و درون گونه‌ای چاودار با استفاده از نشانگر مولکولی AFLP ژنتیک گیاهی Subject 01 پژوهشی کامل Applicable <span dir="RTL">چاودار یکی از گیاهان زراعی مهم ایران با نام علمی </span>&nbsp;<em>Secale</em><span dir="RTL">متعلق به خانواده گندمیان (</span>Poaceae<span dir="RTL">)&rlm; می</span><span dir="RTL">&not;</span><span dir="RTL">باشد. در این پژوهش تنوع ژنتیکی 39 جمعیت چاودار از مناطق مختلف ایران، آمریکا و روسیه با نشانگر </span>AFLP<span dir="RTL"> مورد ارزیابی قرار گرفت. نتایج بدست آمده نشان داد که 13 جفت آغازگر </span>AFLP 188<span dir="RTL"> باند تولید کردند که شامل 177 باند چندشکل بود. میانگین میزان اطلاعات چندشکلی (</span>PIC<span dir="RTL">) و شاخص نشانگر (</span>MI<span dir="RTL">) در جفت آغازگرهای </span>AFLP<span dir="RTL"> به ترتیب معادل 22/0 و 3 عدد بود. بیشترین مقدار </span>PIC<span dir="RTL"> مربوط به جفت آغازگر </span>ECC 3N 4S 1<span dir="RTL"> و بیشترین </span>MI<span dir="RTL"> مربوط به جفت آغازگر </span>ECC 3N 4S 5<span dir="RTL"> بود. پس از مشاهده محصول</span><span dir="RTL">&not;</span><span dir="RTL">های واکنش زنجیره</span><span dir="RTL">&not;</span><span dir="RTL">ای پلیمراز بر روی ژل پلی اکریل آمید و امتیازدهی باندهای </span>DNA<span dir="RTL">، تجزیه و تحلیل با نرم</span><span dir="RTL">&not;</span><span dir="RTL">افزار </span>NTSYS<span dir="RTL"> انجام شد. دندروگرام تجزیه خوشه</span><span dir="RTL">&not;</span><span dir="RTL">ای با روش </span>UPGMA<span dir="RTL"> و ضریب تشابه دایس جمعیت</span><span dir="RTL">&not;</span><span dir="RTL">های چاودار را به پنج گروه تقسیم کرد که گروه</span><span dir="RTL">&not;</span><span dir="RTL">بندی آن با گروه</span><span dir="RTL">&not;</span><span dir="RTL">بندی تجزیه مولفه</span><span dir="RTL">&not;</span><span dir="RTL">های اصلی مطابقت داشت. نتایج تجزیه واریانس مولکولی بیانگر تنوع درون گونه</span><span dir="RTL">&not;</span><span dir="RTL">ای بیشتر از تنوع بین گونه</span><span dir="RTL">&not;</span><span dir="RTL">ای بود. و میانگین شاخص شانون </span><span dir="RTL">(</span>I<span dir="RTL">)</span><span dir="RTL"> در گونه</span><span dir="RTL">&not;</span><span dir="RTL">های چاودار 48/0 بود که بیانگر تنوع نسبتاً خوب درون گونه</span><span dir="RTL">&not;</span><span dir="RTL">ها می</span><span dir="RTL">&not;</span><span dir="RTL">باشد. نتایج نشان داد که نشانگر </span>AFLP<span dir="RTL"> ابزار مفیدی در تعیین تنوع ژنتیکی درون و بین گونه</span><span dir="RTL">&not;</span><span dir="RTL">ای چاودار است.</span> Rye cereal Secale is one of the most important crops in Iran and belongs to the family Poaceae Understanding the Rye genetic diversity is essential for breeding programs of this plant. In this study, AFLP molecular markers were used to determine genetic diversity among 39 populations of Rye (from different regions of Iran, the United States and Russia). Thirteen primers were used, which could create 188 detectable and repeatable bands and 94% of primers showed polymorphism (177 bands) among different populations. The highest PIC was for the ECC 3N 4S 1 starter pair and the highest MI was for the ECC 3N 4S 5 starter pair. To determine the similarity between populations, the Dissse similarity coefficients were used. Maximum similarity (0.971) between the two populations Montanum of Park Jhan nama and Cereal of Fereydoun Shahr, and the minimum similarity (0.386) between Sermont of Arak and Sermont of the United States was observed. The cluster analysis was performed using the UPGMA algorithm based on the similarity matrix. Cluster analysis classified different populations of Rye in five main groups, which relevant to the grouping of principal components analysis. The results of this study showed noticeable genetic diversity among Rye populations of Iran, besides the results of the analysis of molecular variance show that intra-species diversity is higher than inter-species diversity, the average Shannon (I) index in rye species was 0.48, which indicates a relatively good diversity within species<span dir="RTL">.</span> چاودار, تنوع ژنتیکی, نشانگر AFLP, چندشکلی, تجزیه واریانس مولکولی Rye, Genetic Diversity, AFLP Indicator, Polymorphism, Analysis of Molecular Variance 351 360 http://mg.genetics.ir/browse.php?a_code=A-10-36-1&slc_lang=fa&sid=1 Elham Rezaei Mirghayed الهام رضایی میرقاید rezaeimirghayed@gmail.com 10031947532846005329 10031947532846005329 Yes Biotechnology Department, Agriculture Faculty, University of Payam Noor, Isfahan, Isfahan, Iran گروه بیوتکنولوژی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه پیام نور، اصفهان، اصفهان، ایران Hosein Zeinali حسین زینلی hos.zeinali@yahoo.com 10031947532846005330 10031947532846005330 No Isfahan Research Center مرکز تحقیقات اصفهان