Modern Genetics Journal

fa بررسی تنوع آللی و هاپلوتایپی نشانگرهای ریزماهواره در کلزا Assessment of haplotype and allelic diversity of SSR markers in canola ژنتیک گیاهی Subject 01 پژوهشی کامل Applicable <h1 dir="RTL" style="text-align: justify;">به‌منظور بررسی تنوع آللی و هاپلوتایپی و هم‌چنین شناسایی نشانگرهای آگاهیبخش خصوصیات مورفولوژیک در 41 لاین و ژنوتیپ کلزا تحت شرایط تنش خشکی، از 36 نشانگر ریزماهواره‌ای که با QTL‌های کنترل‌کننده صفات مورفولوژیک بر روی کروموزم‌های A1، C3، C5 و C6 در شرایط تنش خشکی پیوسته بودند، استفاده شد. سی و شش نشانگر مورد مطالعه، 166 نوار قابل تشخیص ایجاد کردند و 157 آلل (58/94 درصد) آن چند شکل بودند که نشان‌دهنده تنوع ژنتیکی قابل ملاحظه‌ی میان لاینها و ژنوتیپها بود. نتایج نشان داد که متوسط شاخص نشانگری، تنوع ژنی نِی، شاخص اطلاعات شانون و تعداد آلل‌های مؤثر به‌ترتیب 508/1، 449/0 و 298/0 بود. تنوع هاپلوتایپی دو صفت وزن خشک اندام هوایی و وزن خشک کل توسط نشانگرهای SSR مرتبط با QTLهای متحمّل به خشکی بر روی کروموزومهای A1، C3، C5 و C6 بررسی شد. نتایج نشان داد که 41 لاین و ژنوتیپ کلزا به‌ترتیب به 9 و 5 هاپلوتایپ مختلف بر مبنای QTL وزن خشک کل، روی کروموزومهای A1 و C3 تقسیم شدند. همچنین، ژنوتیپ SLM046 بهعنوان رقم مرجع استفاده شد. هاپلوتایپهایی که با نشانگرهای Ol12-F12، BRMS-096 و BRAS041 روی کروموزوم A1 و نشانگرهایNa10-E02 ، FITO133 و Na12-A08 بر روی کروموزوم C1 مشخص شدند، میتوانند در شناسایی ژنوتیپهای متحمّل بهکار روند و بنابراین برای انتخاب به کمک نشانگر (MAS) QTLهای متحمّل به خشکی استفاده شوند.</h1> To study the haplotype and allelic diversity and to identify the informative markers of morphologic characteristics of 41 canola lines and genotypes under drought stress, 36 microsatellite markers linked to the QTLs located on the chromosome A1, C3, C5 and C6 controlling morphologic characteristics under drought stress were used. Thirteen seven selected primers produced 166 discernible bands, with 157 (94.58%) being polymorphic, indicating considerable genetic diversity among lines and genotypes. The results showed that average of marker index including Nei’s gene diversity, Shannon’s information index, the effective number of alleles were 1.508, 0.449 and 0.298 respectively in line and genotypes of rapeseed. The haplotype diversity w::as char::acterized with SSR markers associated using the QTLs associated with the two traits (shoot dry weight and total dry weight) on chromosome A1, C3, C5 and C6. The results showed that forty one rapeseed lines and genotypes divided into 9 and 5 different haplotypes based on total dry weight QTL located on chromosome A1 and C3, respectively using SLM046 cultivar as the reference. The haplotypes possessing Ol2-F11, BRMS-096 and BARS041 markers on chromosome A1 and Na10-E02, FITO133 and Na12-A08 markers on chromosome C1 could discriminate the tolerant genotypes and hence could be useful for marker-assisted selection of QTL associated with drought tolerance. کلزا تنوع هاپلوتایپی تنش خشکی ریزماهواره‌ها Brassica napus, Haplotype diversity, drought stress, Microsatellites 63 77 http://mg.genetics.ir/browse.php?a_code=A-10-1-18&slc_lang=fa&sid=1 H Zali حسن زالی 1003194753284600208 1003194753284600208 No بخش تحقیقات اصلاح و تهیه نهال و بذر، مرکز تحقیقات کشاورزی و منابع طبیعی فارس، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، داراب، ایران O Sofalian امید سفالیان 1003194753284600209 1003194753284600209 Yes گروه اصلاح نباتات، دانشگاه محقق اردبیلی، اردبیل، ایران M Zeinalabedini مهرشاد زین العابدینی 1003194753284600210 1003194753284600210 No بخش ژنومیک، پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی ایران، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران T Hasanloo طاهره حسنلو 1003194753284600211 1003194753284600211 No بخش فیزیولوژی مولکولی، پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی ایران، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران A Asghari علی اصغری 1003194753284600212 1003194753284600212 No گروه اصلاح نباتات، دانشگاه محقق اردبیلی، اردبیل، ایران B Alizadeh بهرام علیزاده 1003194753284600213 1003194753284600213 No مؤسسه تحقیقات اصلاح و تهیه نهال و بذر، سازمان تحقیقات، آموزش ترویج کشاورزی، کرج، ایران