fa شناسایی miRNAها و ژن‌های هدف بالقوه آن‌ها در گلرنگ زراعی (Carthamus tinctorius L) ژنتیک گیاهی Subject 01 پژوهشی کامل Applicable <h1 dir="RTL" style="text-align: justify;"><span style="font-size:14px;"><span style="font-family:tahoma;"><span dir="LTR">microRNA</span>ها (<span dir="LTR">miRNA</span>) گروهی از <span dir="LTR">RNA</span>های غیر کدکننده و کوتاه (~21 نوکلئوتید) هستند که از طریق تنظیم بیان ژن‌ها در سطح پس از رونویسی نقش‌ کلیدی را در توسعه و فیزیولوژی گیاه ایفا می‌کنند. ازآنجایی‌که تاکنون مطالعه جامعی در رابطه با شناسایی <span dir="LTR">miRNA</span>های گلرنگ به روش <em><span dir="LTR">in silico</span></em> انجام نشده است، در این پژوهش با آنالیز توالی‌های ژنومی، 124 <span dir="LTR">miRNA</span> بالقوه متعلق به 26 خانواده حفاظت‌شده، شناسایی و حضور 2 مورد از آن‌ها در ژنوم گلرنگ با استفاده از <span dir="LTR">RT-qPCR</span> تأیید شد. این 29 خانواده <span dir="LTR">miRNA</span> به‌طور چشم‌گیری در اندازه متفاوت هستند. آنالیز توالی‌های <span dir="LTR">pre- miRNA</span> نشان داد که طول این پیش&shy;سازها در گلرنگ از 57 تا 317 با میانگین <span style="color:black;">1/40 </span><span style="color:black;">&plusmn;</span><span style="color:black;"> 88/95 </span>نوکلئوتید متغیر است. دیگر نتیجه مهم به‌دست‌آمده در این مطالعه، موفقیت در تعیین کلاسترهای <span dir="LTR">miR169</span>، <span dir="LTR">miR395</span> و <span dir="LTR">miR397</span> در ژنوم گلرنگ بود. در مطالعه پیش رو برای نخستین &shy;بار اعضای خانواده‌های <span dir="LTR">miR393</span>، <span dir="LTR">miR477</span>، <span dir="LTR">miR530</span>، <span dir="LTR">miR6111</span>، <span dir="LTR">miR6113</span> و <span dir="LTR">miR6114</span> در ژنوم گلرنگ شناسایی شد. با استفاده از پروتکل‌های ارائه‌شده در مطالعات پیشین، درمجموع 84 ژن هدف بالقوه برای <span dir="LTR">miRNA</span>های گلرنگ شناسایی شد. ژن&shy;های هدف این قبیل از ژن‌ها، فاکتورهای رونویسی، پروتئین‌های دخیل در همانندسازی <span dir="LTR">DNA</span> و آنزیم‌های متابولیکی را شامل می‌شوند. نتایج این مطالعه نشان داد که <span dir="LTR">miRNA</span>های حفاظت شده در گلرنگ وجود دارند و می‌توانند عملکرد مؤثری در پاسخ به تنش‌های محیطی نیز داشته باشند.</span></span></h1> <span dir="LTR">miRNAs</span><span dir="LTR"> are a class of non-coding and small RNAs (~ 21 nucleotides) performs a key function in plant growth and physiology by regulating gene expression in post-transcriptional level. Since there has not been a comprehensive study on identification of the miRNAs of safflower (<em>Carthamus tinctorius</em> L) using <em>in silico</em> method, in current study, 124 potential miRNAs belonging to 26 conserved families were identified and two miRNAs were validated using qRT-PCR technique. The 29 miRNA families were significantly different in size. Safflower pre- miRNAs greatly varied from 57 to 317 nt in length<a name="_GoBack"></a> with an average of 94.56 &plusmn; 38.1 nt. Another result of this study was the success in determining miR169, miR395 and miR397 clusters in the safflower genome. In the present study, the family members of miRNAs including miR393, miR477, miR530, miR6111, miR6113, and miR6114were recognized which have not previously been reported. A total of 84 potential target genes were predicted for the identified safflower miRNAs including transcription factors, proteins involved in DNA replication, and metabolic enzymes. The results of this study showed the existence of conserved miRNAs in safflower and may be important role in response to environmental stress.</span> کلاستر Carthamus tinctorius in silico miRNA RT-qPCR Carthamus tinctorius, in silico, miRNA, qRT-PCR, cluster 363 379 http://mg.genetics.ir/browse.php?a_code=A-10-1-47&slc_lang=fa&sid=1 F Kouhi فرشید کوهی 1003194753284600326 1003194753284600326 No گروه اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی دانشگاه شهید چمران اهواز K Sorkheh کریم سرخه karimsorkheh@gmail.com 1003194753284600327 1003194753284600327 Yes دانشکده کشاورزی دانشگاه شهید چمران اهواز S Ercisli سزای ایرسیزلی 1003194753284600328 1003194753284600328 No دانشکده کشاورزی دانشگاه آتاتورک ترکیه