<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Modern Genetics Journal</title>
<title_fa>فصلنامه علمی ژنتیک نوین</title_fa>
<short_title>MGj</short_title>
<subject>General</subject>
<web_url>http://mg.genetics.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>2008-4439</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2008-4439</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii>8</journal_id_pii>
<journal_id_doi></journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid>14</journal_id_sid>
<journal_id_nlai>8888</journal_id_nlai>
<journal_id_science>13</journal_id_science>
<language>fa</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1397</year>
	<month>9</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2018</year>
	<month>12</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>13</volume>
<number>3</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>تجزیه ارتباطی صفات مورفولوژیک برنج (Oryza sativa L) با استفاده ازنشانگر‌های ریزماهواره (SSR) در شرایط غرقاب و تنش خشکی</title_fa>
	<title>Association Analysis Morphological Traits in Rice (Oryza sativa L) using SSR markers  in terms of flooding and drought</title>
	<subject_fa>ژنتیک گیاهی</subject_fa>
	<subject>Subject 01</subject>
	<content_type_fa>پژوهشی کامل</content_type_fa>
	<content_type>Applicable</content_type>
	<abstract_fa>&lt;h1 dir=&quot;RTL&quot; style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:tahoma;&quot;&gt;با توجه به اهمیت پژوهش&amp;shy;های مرتبط با تنش&amp;shy; غیر&amp;shy;زیستی، پژوهش حاضر در راستای شناسایی نشانگر&#8204;های مولکولی که ارتباط معنی&amp;shy;داری با صفات مرتبط با تحمل تنش در برنج دارند، انجام گرفت. این بررسی با استفاده از 36 نشانگر&amp;shy; ریزماهواره (&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;SSR&lt;/span&gt;) و 59 ژنوتیپ برنج در دو شرایط نرمال و تنش خشکی انجام شد. 36 نشانگر ریزماهواره در مجموع 189 آلل با میانگین 25/5 آلل در هر مکان ژنی مشاهده شد. نشانگر&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;5647&lt;/span&gt; &amp;nbsp;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;RM&lt;/span&gt;دارای بیش&#8204;ترین تعداد آلل (12) و نشانگر&amp;shy;های &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;RM462&lt;/span&gt; و &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;6022&lt;/span&gt; &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&amp;nbsp;RM&lt;/span&gt; دارای کمترین تعداد آلل(2) بودند. میانگین محتوای اصلاعات چند شکل (&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;PIC&lt;/span&gt;) 58/0 برآورد شد و نشانگر&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;RM 5647&lt;/span&gt; &amp;nbsp;با 81/0 بیشترین و&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;RM 6022&lt;/span&gt; &amp;nbsp;با 32/0 کمترین &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;PIC&lt;/span&gt; را نشان دادند. به&#8204;طور کلی 29 متغییر شامل 21 صفت زراعی به&#8204;همراه هشت شاخص تحمل به تنش (&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;SSI&lt;/span&gt;، &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;STI&lt;/span&gt;، &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;MP&lt;/span&gt;، &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;GMP&lt;/span&gt;، &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;HM&lt;/span&gt;،&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;YSI &lt;/span&gt;،&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;TOL &lt;/span&gt;&amp;nbsp;و &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;SST&lt;/span&gt; ) ارزیابی&amp;shy;شد.&amp;nbsp; تجزیه ارتباط با استفاده از ماتریس ساختار جمعیت و با مدل&amp;shy;های آماری &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;GLM&lt;/span&gt; و &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;MLM&lt;/span&gt; با استفاده از نرم&#8204;افزار &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;TASSEL &lt;/span&gt;&amp;nbsp;برای 29 متغیر انجام شد. مدل&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;MLM&lt;/span&gt; &amp;nbsp;توانست در شرایط نرمال 11 نشانگر و در شرایط تنش خشکی 22 نشانگر معنی&#8204;دار را شناسایی نماید. در شرایط نرمال بالاترین ضریب تببین مربوط به نشانگر&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;RM5780&lt;/span&gt; &amp;nbsp;بود که 92/29 درصد تغییرات عملکرد را توجیه کرد و در شرایط تنش خشکی بالاترین ضریب تبیین مربوط به نشانگر &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;RM519&lt;/span&gt; بود که &amp;nbsp;69/39 درصد از تغییرات روز تا خوشه دهی را به خود اختصاص داد. برای هشت شاخص تحمل مورد بررسی، 6 نشانگر معنی&#8204;دار شناسایی شد. بالاترین درصد توجیه تغییرات فنوتیپی به نشانگر &amp;nbsp;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;RM441&lt;/span&gt;با 11/26 درصد به شاخص &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;TOL&lt;/span&gt; اختصاص داشت. با توجه به نتایج، پیش&#8204;بینی می&amp;shy;شود استفاده از نشانگرهای ریزماهواره ردیابی شده در این پژوهش در صورت تأیید و پس از اختصاصی شدن، با اطمینان زیادی در برنامه&#8204;های انتخاب به&#8204;کمک نشانگر امکان پذیر باشد.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/h1&gt;
</abstract_fa>
	<abstract>Given the importance of research related to abiotic stress, this study is to identify markers significantly associated with traits associated with drought tolerance in rice was done. In this study 36 microsatellite markers (SSR) and 59 rice genotypes were used in both normal and drought conditions. A total of 189 alleles in 36 microsatellite markers with an average of 25.5 alleles per locus were observed. RM5647 represents the highest number of alleles (12) and RM462 and 6022 RM has the lowest number of alleles (2). Average polymorphic information content was estimated (0.58) that RM5647(0.81)&amp;nbsp; and RM6022 (0.32) had highest and lowest PIC, respectively. In this study, 21 agronomic traits along with eight Stress Tolerance Index (SSI, STI, MP, GMP, HM and STS) was measured.&amp;nbsp; Association analysis using matrix structure of the population and statistical models GLM and MLM was performed. 11 and 22 informative markers were determined in normal and drought condition using MLM model respectively. Under normal conditions, RM5780 had the highest coefficient of determination and explained 29.92% variation of grain yield. In drought condition, RM519 was related to days to heading and explained 39.69% of variation. 6 significant markers identified for eight indicators evaluated. RM441 had the highest percentage of phenotypic variation (26.11%) of TOL variation. According to the results, microsatellite markers detected in the present study after specification and being confirmed are suitable for using marker-assisted selection .</abstract>
	<keyword_fa>برنج 
تجزیه ارتباط
 شاخص‌های تحمل به تنش
 نشانگرهای ریزماهواره
</keyword_fa>
	<keyword>Rice, Association Analysis, Stress Tolerance Indices, Microsatellite Markers</keyword>
	<start_page>393</start_page>
	<end_page>408</end_page>
	<web_url>http://mg.genetics.ir/browse.php?a_code=A-10-1-49&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>MR</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Karim</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>محمدرضا</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>کریم</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>1003194753284600333</code>
	<orcid>1003194753284600333</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation></affiliation>
	<affiliation_fa>گروه بیوتکنولوژی کشاورزی دانشگاه پیام نور تهران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>H</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Sabouri</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>حسین</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>صبوری</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>hos.sabouri@gmail.com</email>
	<code>1003194753284600334</code>
	<orcid>1003194753284600334</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation></affiliation>
	<affiliation_fa>گروه تولیدات گیاهی دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه گنبدکاووس</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>MA</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Ebrahimi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>محمدعلی</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>ابراهیمی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>1003194753284600335</code>
	<orcid>1003194753284600335</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation></affiliation>
	<affiliation_fa>گروه بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشگاه پیام نور، تهران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>AR</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Dadras</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>احمد‌رضا</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>دادرس</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>1003194753284600336</code>
	<orcid>1003194753284600336</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation></affiliation>
	<affiliation_fa>بخش تحقیقات علوم زراعی و باغی، مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعی استان زنجان، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، زنجان، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
