Modern Genetics Journal
فصلنامه علمی ژنتیک نوین
MGj
General
http://mg.genetics.ir
1
admin
2008-4439
2008-4439
8
14
8888
13
fa
jalali
1399
7
1
gregorian
2020
10
1
15
2
online
1
fulltext
fa
ارزیابی تنوع در مکان ژنی خودناسازگاری و جداسازی اولین آلل این مکان ژنی در ژنوتیپ-های بومی درخت به (Cydonia oblonga Mill.) ایران
Evaluation of Diversity of Self-Incompatibility Locus and Isolation of the First Allele of this locus in Indigenous Quince (Cydonia oblonga Mill.) Genotypes of Iran
ژنتیک گیاهی
Subject 01
پژوهشی کامل
Applicable
<h1 dir="RTL" style="text-align: justify;"><span style="font-size:12px;"><span style="font-family:Tahoma;">درخت به (<em><span dir="LTR">Cydonia oblonga</span></em><span dir="LTR"> Mill.</span>) از نظر سازگاری گرده، گونهای خودسازگار محسوب میشود، لیکن سطوح متفاوتی از خود ناسازگاری در ارقام و ژنوتیپهای آن گزارش شده است. با توجه به عدم بررسی آللهای خودناسازگاری مکان ژنی و تنوع احتمالی آللی این مکان ژنی (<em><span dir="LTR">S</span></em>) در درخت به و تاثیر آن در میزان خود ناسازگاری، در این تحقیق به ارزیابی تنوع در مکان ژنی خودناسازگاری، جداسازی، تعیین توالی و ودیعهگذاری اولین آلل خودناسازگاری در شماری از ارقام و ژنوتیپهای بومی این درخت پرداخته شد. آغازگرهای مورد استفاده بر اساس نواحی محافظت شده <span dir="LTR">C1</span> و <span dir="LTR">C5</span> مکان ژنی <em><span dir="LTR">S</span></em> در گونههای نزدیک مشتمل بر سیب و گلابی طراحی شدند. ژنوتیپهای مورد بررسی مشتمل بر 55 رقم و ژنوتیپ از استانهای اصفهان، خراسانرضوی، اردبیل و گیلان بودند و تکثیر این مکان ژنی نشاندهنده تنوع آن در ژنوتیپها بود. قطعات تکثیری با طول بین 500 تا 1100 باز در 13 اندازه مختلف در ارقام و ژنوتیپها مشاهده شدند که بهصورت <em><span dir="LTR">Sq1</span></em> تا <em><span dir="LTR">Sq13</span></em> بهصورت مقدماتی کدگذاری شدند. بیشترین فراوانی آللی مربوط به آلل <em><span dir="LTR">Sq13</span></em> با 7/17 درصد فراوانی و پس از آن آلل <em><span dir="LTR">Sq4</span></em> با 4/14 درصد فراونی بود. تعیین توالی کامل این مکان ژنی در ژنوتیپ <span dir="LTR">KM1</span> یا به ترشاصفهان ضمن تشخیص اولین آلل خودناسازگاری این گونه که بهصورت <em><span dir="LTR">S1</span></em> (<span dir="LTR">MF281258</span>) نامگذاری و ودیعه­گذاری شد، بیانگر بالاترین شباهت این آلل با دو آلل خودناسازگاری <em><span dir="LTR">S6</span></em> گونه سیب <em><span dir="LTR">Malus domestica</span></em><span dir="LTR"> Borkh.</span> و آلل <em><span dir="LTR">Ss</span></em> (<em><span dir="LTR">S111</span></em>) گونه گلابی <em><span dir="LTR">Pyrus communis</span></em><span dir="LTR"> L.</span> بهترتیب با 94 و 93 درصد شباهت نوکلئوتیدی بود.</span></span></h1>
<div style="text-align: justify;"></div>
Quince (<em>Cydonia oblonga</em> Mill.) is considered as a self-compatible species, but some levels of self-incompatibility also have been reported in its cultivars and genotypes. Therefore in this research allelic diversity, isolation and deposition of alleles has been considered in some indigenous quince cultivars and genotypes of Iran. The primes were designed according to the C1 to C5 conserved regions of apple and pear species. 55 genotypes, cultivars and related species of quince were evaluated and amplification of this locus demonstrated various band lengths between 500 to 1100 bp with 13 various sizes. After partial sequencing, these bands primarily were coded as <em>Sq1</em> to <em>Sq13</em>, but the frequency of two putative alleles, <em>Sq13</em> and <em>Sq4</em> where higher than other respectively with 17.7 and 14.4%. Sequencing of the first self-incompatibility allele (<em>S1</em>) in KM1 genotype or cultivar Torsh Esfahan revealed the highest homology of this allele with <em>S6</em> of apple species <em>Malus</em> <em>domestica</em> Borkh. and <em>Ss</em> (<em>S111</em>) of pear species <em>Pyrus</em> <em>communis</em> L., respectively, with 94 and 93 of nucleotide similarity.
آلل S, خودسازگاری, تنوع آللی, پیشرانه, درختان میوه دانهدار
S allele, Self-incompatibility, Allele diversity, Promoter, Pome fruits.
93
101
http://mg.genetics.ir/browse.php?a_code=A-10-100-2&slc_lang=fa&sid=1
زهرا
طلایی
hengameh.talaei@gmail.com
10031947532846005070
10031947532846005070
No
دانشگاه آزاد اسلامی،واحد کرج
حمید
عبداللهی
h.abdollahi@areeo.ac.ir
10031947532846005071
10031947532846005071
Yes
علمی موسسه تحقیقات علوم باغبانی، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی
بهزاد
سرخی
bsorkhi@spii.ir
10031947532846005072
10031947532846005072
No
موسسه تحقیقات اصلاح و تهیه نهال و بذر، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی
مریم
تاتاری
mtatari1@gmail.com
10031947532846005073
10031947532846005073
No
مرکز تحقیقات کشاورزی و منابع طبیعی اصفهان
محمد
ترکاشوند
torkashvand_mohamad@yahoo.com
10031947532846005074
10031947532846005074
No
دانشگاه آزاد اسلامی، واحد علوم و تحقیقات