سرمای دیررس بهاره به‌عنوان مهم­ترین محدودیت محیطی برای بادام محسوب می­شود و به‌واسطه صدمه به بافت­های زایشی همه ساله منجر به خسارت قابل توجهی در تولید محصول آن می­شود. از آن­جایی که اطلاعات بسیار محدودی دررابطه با پاسخ این گیاه به تنش سرمازدگی بهاره وجود دارد و از طرف دیگر با توجه به نقش مهم تنظیمی miRNA‌ها در بسیاری از شبکه­های تنظیمی، بر اساس اطلاعات حاصل از آنالیز نتایج توالی‌یابی RNA و sRNA‌های بادام، سه ژن Pdu-miR160a، Pdu-miR168 و Pdu-miR171a به‌عنوان miRNA‌های پاسخ دهنده به تنش سرما به‌همراه ژن­های هدف­شان انتخاب و به‌منظور تأیید نتایج توالی­یابی، بیان آن­ها با استفاده از روش RT-qPCR در اندام­های زایشی دو ژنوتیپ متحمل H و حساس به سرمای Sh12 تحت دو تیمار تنش صفر و 2- درجه سانتی‌گراد مورد بررسی قرار گرفت. نتایج، نقش تنظیمی منفی سه miRNA مورد مطالعه را در پاسخ به هر دو تیمار تنش سرمایی در ژنوتیپ H نشان داد. اما بر خلاف ژنوتیپ H، نقش تنظیمی مثبت Pdu-miR168 و Pdu-miR171a در پاسخ به تنش سرما در رقم Sh12 آشکار شد. نتایج آزمون همبستگی پیرسون، وجود همبستگی منفی بین Pdu-miR160a و PduARF18 تحت هر دو تنش سرمایی را تنها در اندام­های زایشی بساک و تخمدان رقم Sh12 نشان داد. این در حالی بود که وجود همبستگی منفی میان Pdu-miR168 وPduAGO1 تنها در تخمدان ژنوتیپ H تحت هر دو تنش تیمار سرمایی مشاهده شد. همچنین اثر تنظیمی منفی Pdu-miR171a بر ژن هدف PduSCL6 تحت تنش 2- درجه سانتی­گراد در تخمدان ژنوتیپ H و هر دو بافت زایشی رقم Sh12 آشکار شد.