ارزیابی تنوع ژنتیکی در یک منبع ژرم‌پلاسمی به انتخاب مؤثر ژنوتیپ‌ها کمک نموده و زمان فرآیند به­نژادی را کوتاه می­نماید. تنوع ژنتیکی نقش بسیار مهمی در کاهش آسیب‌پذیری ژنتیکی در هنگام اصلاح گیاهان دارد. در مطالعه‌ی حاضر، 96 لاین اصلاحی گندم دوروم برای ارزیابی تنوع ژنتیکی با استفاده از 12 آغازگر SCoT مورد ارزیابی قرار گرفت. نتایج نشان داد که آغازگرهایSCoT ، در مجموع 76 باند چند شکل با متوسط 42/5 باند به ازای هر آغازگر در جمعیت مورد بررسی تکثیر نمودند. میانگین مقادیر شاخص نشانگر (MI) و محتوای اطلاعات چندشکلی (PIC) برای آغازگرهای SCoT به‌ترتیب 46/0 و 51/2 به‌دست آمد و نشان داد که نشانگرهای SCoT از کارایی بالایی در شناسایی تنوع ژنتیکی در ژرم پلاسم گندم دوروم برخوردارند. برآورد تعداد آلل­های مشاهده شده (Na)، آلل مؤثر (Ne)، شاخص شانون (I) و میزان هتروزیگوسیتی (H) نشان داد که لاین‌های با منشاء ICARDA در مقایسه با لاین‌های با منشاء CIMMYT از میزان تنوع ژنتیکی بیش‌تری برخوردارند. گروه‌بندی لاین­های مورد بررسی با استفاده از روش تجزیه خوشه­ای بر اساس ماتریس تشابه جاکارد و الگوریتم joining-Neighbor لاین‌های مورد بررسی را تا حد زیادی بر اساس منشاء آن‌ها دسته بندی نمود. این نتایج نشان داد که تنوع ژنتیکی نسبتاً بالایی در لاین­های مورد مطالعه وجود داشته و نشانگرهای SCoT ابزاری مناسب برای مطالعه تنوع ژنتیکی در ژرم پلاسم گندم دوروم هستند.