در این تحقیق تنوع ژنتیکی 28 ژنوتیپ گلرنگ با استفاده از 7 نشانگر ISSR، 3 نشانگر رتروترانسپوزون و 12 نشانگر ترکیبی ISSR و رتروترانسپوزون، ارزیابی شد. نتایج حاصل از تجزیه خوشه‌ای بررسی مولکولی به روش UPGMA با معیار فاصله ضریب تطابق ساده با استفاده از داده‌های حاصل از آغازگرهای ISSR، رتروترانسپوزون و آغازگرهای ترکیبی ISSR و رتروترانسپوزون 28 ژنوتیپ مورد مطالعه را در سه گروه قرار داد که گروه‌ها به‌ترتیب شامل 14، 9 و 5 ژنوتیپ بودند که در بین این گروه‌ها، گروه اول بزرگ‌ترین گروه می‌باشد، اما در بررسی ژنوتیپ‌ها براساس صفات مورفولوژی به روش UPGMA و معیار فاصله اقلیدسی 28 ژنوتیب در چهار گروه قرار گرفتند. صحت گروه‌بندی حاصل از تجزیه خوشه‌ای توسط تجزیه تابع تشخیص کانونی به روش خطی فیشر با 100 درصد برای مولکولی تأیید شد.