Raeesi V, Ehsani A, Vaez Torshizi R. Identification of single nucleotide polymorphisms underlying the strength of lysozyme activity in chicken, a genome-wide association study. MGj 2018; 13 (2) :189-196
URL:
http://mg.genetics.ir/article-1-55-fa.html
رئیسی وحید، احسانی علیرضا، واعظ ترشیزی رسول. شناسایی چندشکلیهای تکنوکلئوتیدی کنترلکننده شدت فعالیت آنزیم لیزوزیم در مرغ، یک مطالعه همراهی در سطح ژنوم. فصلنامه علمی ژنتیک نوین. 1397; 13 (2) :189-196
URL: http://mg.genetics.ir/article-1-55-fa.html
گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تربیت مدرس
چکیده: (2140 مشاهده)
در پژوهش حاضر، یک مطالعه همراهی در سطح ژنوم با هدف شناسایی نواحی ژنومیک کنترلکننده میزان فعالیت آنزیم لیزوزیم در مرغ انجام شد. پرندگان تحت آزمایش از یک جمعیت F2 حاصل از تلاقی ضربدری لاین گوشتی آرین و سویه بومی مرغ آذربایجان غربی بهدست آمد و آنالیزهای مربوطه با استفاده از پانل 60 هزارتایی چندشکلی تک نوکلئوتیدی شرکت ایلومینا انجام گرفت. در این مطالعه، میزان فعالیت آنزیم لیزوزیم علیه باکتری میکروکوکوس لوتئوس بهعنوان شاخصی برای فعالیت ایمنی ذاتی مورد مطالعه قرار گرفت. آنالیز آماری بر اساس مدل رگرسیونی مختلط و ثابت شده با تصحیح اثرات ناشی از اریبهای سیستماتیک و اثرات ثابت جنس و هچ بود. اثرات چند آزمونی با اعمال سطح 10 درصد نرخ کشف کاذب در سطح ژنوم بهعنوان سطح معنیدار تصحیح شدند. نتایج این پژوهش ضمن تطابق با مطالعات پیشین، نشان داد که در هر دو مدل آماری سه نشانگر GGaluGA206187، rs16479594 و rs15204127 که بهترتیب بر روی کروموزومهای 3، 5 و 1 واقع شدهاند؛ همراهی معنیداری با فعالیت آنزیم لیزوزیم در مرغ دارند (1/0 > FDR). آنالیزهای بعدی غناء ژن در پایگاه داده DAVID نشان داد که ژنهای کاندید واقع در این نواحی از ژنوم، در نه مسیر بیوشیمیایی مؤثر بر عملکرد سیستم ایمنی نقش قابل توجهی دارند (1/0 > FDR). تنوع جایگاههای ژنتیکی مؤثر بر صفت یاد شده نشان میدهد که توارث این صفت بهصورت پلی ژنیک بوده و اصلاح نژاد برای این صفت میتواند در دراز مدت به بهبود ژنتیکی حیوانات تحت انتخاب برای این صفت منجر شود.
نوع مطالعه:
پژوهشی کامل |
موضوع مقاله:
ژنتیک گیاهی دریافت: 1396/4/24 | پذیرش: 1397/7/15 | انتشار: 1398/7/9