کوهی فرشید، سرخه کریم، ایرسیزلی سزای. شناسایی miRNAها و ژنهای هدف بالقوه آنها در گلرنگ زراعی (Carthamus tinctorius L). فصلنامه علمی ژنتیک نوین. 1397; 13 (3) :363-379
URL: http://mg.genetics.ir/article-1-73-fa.html
دانشکده کشاورزی دانشگاه شهید چمران اهواز
چکیده: (2171 مشاهده)
microRNAها (miRNA) گروهی از RNAهای غیر کدکننده و کوتاه (~21 نوکلئوتید) هستند که از طریق تنظیم بیان ژنها در سطح پس از رونویسی نقش کلیدی را در توسعه و فیزیولوژی گیاه ایفا میکنند. ازآنجاییکه تاکنون مطالعه جامعی در رابطه با شناسایی miRNAهای گلرنگ به روش in silico انجام نشده است، در این پژوهش با آنالیز توالیهای ژنومی، 124 miRNA بالقوه متعلق به 26 خانواده حفاظتشده، شناسایی و حضور 2 مورد از آنها در ژنوم گلرنگ با استفاده از RT-qPCR تأیید شد. این 29 خانواده miRNA بهطور چشمگیری در اندازه متفاوت هستند. آنالیز توالیهای pre- miRNA نشان داد که طول این پیشسازها در گلرنگ از 57 تا 317 با میانگین 1/40 ± 88/95 نوکلئوتید متغیر است. دیگر نتیجه مهم بهدستآمده در این مطالعه، موفقیت در تعیین کلاسترهای miR169، miR395 و miR397 در ژنوم گلرنگ بود. در مطالعه پیش رو برای نخستین بار اعضای خانوادههای miR393، miR477، miR530، miR6111، miR6113 و miR6114 در ژنوم گلرنگ شناسایی شد. با استفاده از پروتکلهای ارائهشده در مطالعات پیشین، درمجموع 84 ژن هدف بالقوه برای miRNAهای گلرنگ شناسایی شد. ژنهای هدف این قبیل از ژنها، فاکتورهای رونویسی، پروتئینهای دخیل در همانندسازی DNA و آنزیمهای متابولیکی را شامل میشوند. نتایج این مطالعه نشان داد که miRNAهای حفاظت شده در گلرنگ وجود دارند و میتوانند عملکرد مؤثری در پاسخ به تنشهای محیطی نیز داشته باشند.
نوع مطالعه:
پژوهشی کامل |
موضوع مقاله:
ژنتیک گیاهی دریافت: 1397/1/28 | پذیرش: 1397/7/15 | انتشار: 1398/7/10