%0 Journal Article %A sadeghi, zahra %A Nasrollanejad, Saeed %A lagzian, Milad %A Razavi, Esmaeil %A jafari, Majid %T Bioinformatics study on the role of homolog heat shock protein 70 gene of Iranian isolates of Cucurbit chlorotic yellows virus in increasing genetic variation %J Modern Genetics Journal %V 15 %N 1 %U http://mg.genetics.ir/article-1-90-fa.html %R %D 2020 %K CCYV, Heat shock protein (HSP70h), Phenylalanine amino acid, Phylogeny, Positive pressure selection, %X پروتئین شوک حرارتی در کلستروویروس‌ها نقش­های متعددی به‌ویژه حرکت سلول- به- سلول را برای ایجاد آلودگی سیستمیک بر عهده دارد. در پژوهش حاضر، تفاوت ژنتیکی ژن همولوگ پروتئین شوک حرارتی (HSP70h) جدایه‌های ایرانی ویروس زردی کلروتیک کدوئیان و همچنین فشار انتخاب وارد شده بر آن­ها بررسی شد .به این منظور تعداد 195 نمونه با علایم زردی، کوتولگی و بدشکلی برگ­ها از مزارع کدوئیان استان سیستان و بلوچستان جمع‌آوری و با استفاده از آغازگرهای اختصاصی، از منطقه ژنتیکی پروتئین همولوگ شوک حرارتی ویروسCCYV قطعه‌ای به‌طول 462 جفت‌باز برای 15 نمونه توسط روش RT-PCR تکثیرشد و 7 جدایه مورد بررسی فیلوژنتیکی قرار گرفت. نتایج به‌دست آمده نشانگر آلودگی 7 درصد نمونه‌ها به ویروس زردی کلروتیک کدوئیان در مناطق مورد بررسی بود. آنالیزفیلوژنی توالی‌های نوکلئوتیدی و اسید آمینه‌ای جدایه‌های CCYV را به دو گروه ایرانی و شرق آسیا تقسیم نمود و جدایه‌های سیستان و بلوچستان در دو شاخه مجزا قرارگرفتند. هم‌ردیفی توالی اسیدآمینه فرضی پروتئین همولوگ شوک حرارتی و مطالعات فشار انتخاب بر روی 7 جدایه موجود در تحقیق با 3 جدایه ایرانی و جدایه­های خارجی این ویروس نشان داد که ژن HSP70h در جدایه­های ایرانی و سایر جدایه­های این ویروس تحت فشار انتخاب مثبت در کدون 82 قرار دارند که منجر به تغییر یک اسید نوکلئیک (CTC به TTC) به‌ترتیب برای جدایه‌های مرکزی و جدایه­های زابل، هیرمند و نیمروز در موقعیت 244 شده و اسید آمینه لوسین به فنیل آلانین در پروتئین همولوگ شوک حرارتی تغییر نموده است. نتایج نشان‌دهنده وجود جدایه‌های متنوع ویروس CCYV در کشور بوده و تفاوت در توالی نوکلئوتیدی و اسیدآمینه‌ای می‌تواند حاکی از تفاوت در منشا میزبانی باشد بنابراین فشار انتخاب در تنوع ژنتیکی جدایه‌ها دخالت داشته است. %> http://mg.genetics.ir/article-1-90-fa.pdf %P 41-47 %& 41 %! %9 Applicable %L A-10-31-1 %+ , Department of Plant Protection %G eng %@ 2008-4439 %[ 2020