fa مطالعه چند شکلی در ژن ATP1A1 و ارتباط آن با صفت نرخ باروری درگاوهای هلشتاین و سرابی ژنتیک جانوری Subject 02 پژوهشي کوتاه Research <h1 dir="RTL" style="text-align: justify;"><span style="font-family:tahoma;"><span style="font-size:12px;">هدف از این تحقیق، مطالعه چند&shy;شکلی در ژن <em><span dir="LTR">ATP1A1</span></em> و ارتباط آن با صفت نرخ باروری در گاوهای هلشتاین و سرابی بود. به این منظور از 124 راس گاو شیرده شامل 72 راس هلشتاین و 52 راس گاو سرابی خون&shy;گیری انجام شد. استخراج <span dir="LTR">DNA</span> با استفاده از روش بهینه یافته نمکی انجام پذیرفت. کمیت و کیفیت <span dir="LTR">DNA</span>های استخراجی با استفاده از الکتروفورز و اسپکتروفتومتری صورت پذیرفت. با استفاده از آغازگرهای اختصاصی تکثیر قطعه 330 جفت‌بازی از ناحیه مذبور انجام گرفت و برای شناسایی چندشکلی در ناحیه مذکور از روش تفاوت فرم فضایی رشته‌های منفرد (<span dir="LTR">SSCP</span>) استفاده شد. در نهایت جهت شناسایی چندشکلی تک نوکلئوتیدی (<span dir="LTR">SNP</span>) از هر الگوی باندی متفاوت چند نمونه جهت توالی‌یابی ارسال شد. نتایج حاصل از توالی‌یابی و هم‌ردیف‌سازی با توالی ثبت شده در <span dir="LTR">NCBI</span> نشان داد که در این ناحیه دو <span dir="LTR">SNP</span> وجود دارد که یکی از این جهش‌ها در ناحیه اینترون و دیگری در ناحیه اگزون اتفاق افتاده است و جهش اتفاق افتاده در ناحیه اگزون تغییری در اسید‌آمینه و پروتئین حاصل از این ژن ایجاد نمی‌کند. برای بررسی ارتباط بین این جایگاه‌ها با صفت نرخ باروری الگوهای باندی (هاپلوتایپ) در مدل قرار گرفت که نشان داد بین هاپلوتایپ‌های مشاهده شده و صفت نرخ باروری ارتباط معنی‌داری وجود ندارد.</span></span></h1> The objective of this study was the detection of polymorphism in ATP1A1 gene and its association with conception rates in Holstein and Sarabi cows by PCR-SSCP method. For this purpose, blood samples were taken from 124 cows. DNA was extracted from whole blood using modified salting-out method and polymerase chain reactions were performed for amplification of 330bp fragment of the bovine ATP1A1gene. The polymerase chain reaction-single strand conformation polymorphism (PCR-SSCP) method was used to scan for the mutations within the amplified regions. Subsequently, a numbers of samples per each band pattern were sequenced for identification of Single Nucleotide Polymorphism (SNP). The results of the sequencing and alignment using available sequences in NCBI two SNPs in the ATP1A1 gene that one of those was located in exon14 and another one in intron14 area and the mutation located in exon area was along with no changes in amino acid and obtained protein of this gene. For evaluating of association between this locations and conception rate trait, the band pattern (haplotype) were considered in the model. The results showed that the observed haplotypes in the ATP1A1 gene is not significantly correlated with conception rate.<br> &nbsp; استرس حرارتی , هاپلوتایپ, SNP و PCR-SSCP Heat stress, Haplotypes, SNP, PCR-SSCP 367 371 http://mg.genetics.ir/browse.php?a_code=A-10-108-2&slc_lang=fa&sid=1 Mokhtar Ghaffari مختار غفاری m.ghaffari@urmia.ac.ir 10031947532846005766 10031947532846005766 Yes Urmia University دانشگاه ارومیه Ardeshi Nejati-Javaremi اردشیر نجاتی جوارمی javaremi@ut.ac.ir 10031947532846005767 10031947532846005767 No University of Tehran پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج Mostafa Sadeghi مصطفی صادقی sadeghimos@ut.ac.ir 10031947532846005768 10031947532846005768 No University of Tehran پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج Mohammad Moradi-shahrebabak محمد مرادی شهربابک moradim@ut.ac.ir 10031947532846005769 10031947532846005769 No University of Tehran پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج