Modern Genetics Journal
فصلنامه علمی ژنتیک نوین
MGj
General
http://mg.genetics.ir
1
admin
2008-4439
2008-4439
8
14
8888
13
fa
jalali
1398
9
1
gregorian
2019
12
1
14
3
online
1
fulltext
fa
آنالیز ژنتیکی و فیلوژنتیکی ناحیهی HVR1 میتوکندری در سه نژاد گوسفند ایرانی
Genetic and phylogenetic analysis of mitochondrial HVR1 region in three breeds of Iranian sheep
ژنتیک جانوری
Subject 02
پژوهشی کامل
Applicable
<p dir="RTL"><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;"><span style="font-size:10.0pt;">هدف از انجام این پژوهش توالی­یابی ناحیه بسیار متغیر </span></span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-size:10.0pt;">D-loop</span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;"><span style="font-size:10.0pt;"> میتوکندری (</span></span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-size:10.0pt;">HVR1</span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;"><span style="font-size:10.0pt;">) </span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;"><span style="font-size:10.0pt;">در سه نژاد گوسفند ایرانی (لری، لری­بختیاری و عربی) بهمنظور بررسی تنوع ژنتیکی و فیلوژنتیکی بین نژادهای مذکور و همچنین بررسی ارتباط مادری این نژادها با سایر نژادهای جهانی بود.</span></span></span> <span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;"><span style="font-size:10.0pt;">آنالیز فیلوژنیک با استفاده از یک قطعه 623 نوکلئوتیدی نواحی بسیار متغیر </span></span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-size:10.0pt;">D-loop</span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;"><span style="font-size:10.0pt;"> میتوکندری (</span></span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-size:10.0pt;">HVR1</span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;"><span style="font-size:10.0pt;">) </span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;"><span style="font-size:10.0pt;">از 33 راس گوسفند بومی خوزستان (شامل 12 راس گوسفند عربی، 11 راس گوسفند لری و 10 راس گوسفند لری­بختیاری) انجام شد. پس از استخراج </span></span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-size:10.0pt;">DNA</span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;"><span style="font-size:10.0pt;">، ناحیه </span></span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-size:10.0pt;">HVR1</span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;"><span style="font-size:10.0pt;"> میتوکندری با استفاده از </span></span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-size:10.0pt;">PCR</span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;"><span style="font-size:10.0pt;"> تکثیر شد. سپس محصولات </span></span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-size:10.0pt;">PCR</span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;"><span style="font-size:10.0pt;"> توالییابی و آنالیز نتایج با استفاده از نرمافزارهای بیوانفورماتیکی انجام گرفت. درخت فیلوژنتیک نشان داد که نژاد لری و عربی متعلق به گروه هاپلوتایپی </span></span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-size:10.0pt;">B</span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;"><span style="font-size:10.0pt;"> و نژاد لری­بختیاری متعلق به گروه هاپلوتایپی </span></span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-size:10.0pt;">A</span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;"><span style="font-size:10.0pt;"> میباشند که این موضوع میتواند بهدلیل متفاوت بودن خاستگاه زیستی این نژادها باشد. جدول تجزیه واریانس مولکولی تنوع بین جمعیتی را 4 درصد و تنوع درون جمعیتی را 96 درصد محاسبه نمود. همچنین، بیشترین و کمترین تنوع هاپلوتیپی در نژاد عربی و لری بهترتیب 95/0 و 61/0 محاسبه شد. بعلاوه، مقدار</span></span></span> <span dir="LTR" style="position:relative;top:2.5pt;"><span style="font-size:10.0pt;"><img alt="" height="14" src="file:///C:UserspanahiAppDataLocalTempmsohtmlclip1�1clip_image002.gif" width="22" ></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;"><span style="font-size:10.0pt;">محاسبه شده شان داد که بین گوسفند لری و لری­بختیاری بیشتر (146/0) و بین نژاد عربی و لری کمتر (009/0 ) تفاوت ژنتیکی وجود دارد. نتایج نشاندهنده وجود تنوع بالا در این نژادهاست و این موضوع میتواند در اصلاح نژاد و پرورش این دامها تاثیرگذار باشد.</span></span></span></p>
The aim of this research was to sequence mitochondrial hypervariable region 1 (HVR1) in three Iranian sheep breeds (Lori, Lori Bakhtiari and Arabic) in order to explore the genetic and phylogenetic diversity of these breeds and also to investigate the maternal association of these breeds with other global breeds. Phylogenetic analysis was carried out using hypervariable region 1 (623 base pair) obtained from 33 animals (12 Arabic, 11 Lori and 10 Lori Bakhtiari breeds) from different parts of the Khuzestan province. After DNA extraction, the HVR1 region was amplified using PCR method. Then, PCR products were sequenced and analyzed using bioinformatics softwares. The phylogenetic tree pattern showed that the Lori and Arabic breeds belong to the haplotype group B and the Lori Bakhtiari breeds belonging to the haplotype group A, which could be due to the different biological origin of these breeds. Analysis of molecular variance (AMOVA) revealed 94% of the genetic variation existing among populations and 4% within populations. Also, the highest and lowest average haplotype diversity for Arabic and Lori breeds were calculated to be 0.95 and 0.61 respectively. Moreover, the calculated FST value indicated that there was a maximum genetic variation between the Lori and Lori-Bakhtiari sheep (0.146) and minimal genetic variation between the Arabic and Lari breeds (0.009). These results indicate high-divergence status of the three Iranian sheep breeds (Lori, Lori Bakhtiari and Arabic) and will influence breeding and conservation strategies adopted for these breeds<br>
تنوع , نژادهای عربی, لری و لری بختیاری, HVR1. میتوکندری
Diversity, Lori, Lori Bakhtiari and Arabic breeds, Mitochondrial HVR 1.
211
219
http://mg.genetics.ir/browse.php?a_code=A-10-98-1&slc_lang=fa&sid=1
ghazal
Mohamadi ahvazi
غزال
محمدی اهوازی
71ghazalm@gmail.com
10031947532846004215
10031947532846004215
No
Agricultural science and Natural Resources University of Khuzestan
دانشکده علوم دامی و صنایع غذایی -دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی خوزستان
Mahmood
Nazari
محمود
نظری
m.nazari@Asnrukh.ac.ir
10031947532846004216
10031947532846004216
Yes
Agricultural science and Natural Resources University of Khuzestan
دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی خوزستان-اهواز-ایران
Mohamad Reza
Mohamadabadi
محمدرضا
محمدآبادی
mrm@uk.ac.ir
10031947532846004217
10031947532846004217
No
Agricultural science and Natural Resources University of Khuzestan
دانشکده کشاورزی - دانشگاه شهید باهنر کرمان-کرمان-ایران
Razieh
Heidari
راضیه
حیدری
fat_sa_2012@yahoo.com
10031947532846004218
10031947532846004218
No
Department of Venomous Animals and Anti-Venom Production, Razi Vaccine and Serum Research Institute, Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Ahvaz-Iran.
سازمان تحقیقات اموزش و ترویج کشاورزی-موسسه تحقیقات واکسن و سرم سازی رازی شعبه کرج