fa تهیه نقشه ژنتیکی اشباع جمعیت لاین‌های اینبرد نوترکیب گندم نان بهاره با استفاده از روش ارزیابی ژنوتیپی با توالی‌یابی (Genotyping by Sequencing) ژنتیک گیاهی Subject 01 پژوهشی کامل Applicable <h1 dir="RTL" style="text-align: justify;"><span style="font-family:tahoma;"><span style="font-size:12px;">نقشه‌های ژنتیکی اشباع لازمه مکان‌یابی دقیق مکان&shy;های ژنی کنترل کننده صفات کمی می&shy;باشند. در این مطالعه، نقشه ژنتیکی اشباع جمعیت لاین&shy;های اینبرد نوترکیب گندم نان بهاره حاصل از تلاقی رقم <span dir="LTR">Yecora Rojo</span> و ژنوتیپ بومی <span dir="LTR">No. 49</span> با استفاده از روش ارزیابی ژنوتیپی با توالی&shy;یابی <span dir="LTR">(GBS)</span> تهیه شد. برای شناسایی چندشکلی‌های تک نوکلئوتیدی (<span dir="LTR">SNPs</span>)، توالی‌یابی والدین و لاین&shy;های اینبرد نوترکیب به‌صورت تکرار دار در سه لاین دستگاه ایلومینا <span dir="LTR">Illumina Hiseq 2500</span> انجام شد. در مجموع، بیش از 36 هزار <span dir="LTR">SNP</span> شناسایی شد که 804 <span dir="LTR">SNP</span> به هیچ گروه کروموزومی منتسب نشد. از این تعداد <span dir="LTR">SNP</span>، 3042 به زیرژنوم <span dir="LTR">A</span>، 3977 به زیرژنوم <span dir="LTR">B</span> و 769 <span dir="LTR">SNP</span> به زیرژنوم <span dir="LTR">D</span> تعلق داشتند. پس از حذف <span dir="LTR">SNP</span>هایی با داده گمشده بیش از 20 درصد، فراوانی آلل نادر کمتر از 5 درصد و نیز دارای انحراف تفرق از نسبت‌ مندلی 1:1، تعداد 5831 نشانگر <span dir="LTR">SNP</span> شناسایی و به 21 کروموزوم گندم منتسب شد. این نشانگرها، 14/3642 سانتی‌مورگان از ژنوم گندم را با متوسط فاصله 62/0 سانتی‌مورگان بین دو نشانگر مجاور پوشش دادند.</span></span></h1> High density linkage maps are essential for precise mapping of gene loci controlling quantitative traits. In the present study, a high density linkage map of spring wheat recombinant inbred lines population derived from a cross between Yecora Rojo and No. 49 was constructed using genotyping by sequencing (GBS) method. To identify single nucleotide polymorphisms (SNPs), sequencing of parents and recombinant inbred lines was carried out at three lanes of Illumina Hiseq 2500. In total, more than 36 thousand SNP were identified of which 804 SNPs were not aligned to any wheat chromosome. Among these SNPs, 3042, 3977 and 769 SNPs were belonged to A, B and D sub genomes, respectively. After removing SNPs with &ge;20% missing data and minimum allele frequency &le;0.05 as well as loci segregating from 1:1 Mendelian ratio, in total 5831 polymorphic SNPs identified and assigned to 21 chromosomes of wheat. These markers spanned 3642.14 cM of the wheat genome with an average marker density of 0.62 (markers/cM).<br> &nbsp; ارزیابی ژنوتیپی با توالی‌یابی (GBS), چندشکلی‌های تک نوکلئوتیدی, گندم, نقشه پیوستگی Genotyping by Sequencing (GBS), Linkage map, Single Nucleotide Polymorphism, Wheat 281 290 http://mg.genetics.ir/browse.php?a_code=A-10-64-1&slc_lang=fa&sid=1 نیر عبدالهی سیسی nayyer_bio@yahoo.com 10031947532846007373 10031947532846007373 No دانشگاه تبریز سید ابولقاسم محمدی mohammadi@tabrizu.ac.ir 10031947532846007374 10031947532846007374 Yes دانشگاه تبریز سارا غفاریان Saraghafariyan@yahoo.com 10031947532846007375 10031947532846007375 No دانشگاه شهید مدنی آذربایجان