Modern Genetics Journal
فصلنامه علمی ژنتیک نوین
MGj
General
http://mg.genetics.ir
1
admin
2008-4439
2008-4439
8
14
8888
13
fa
jalali
1400
4
1
gregorian
2021
7
1
16
2
online
1
fulltext
fa
بررسی الگوی بیان PdumiR160a ، PdumiR168 و PdumiR171a و ژن های هدف آن ها در اندام های زایشی بادام در پاسخ به تنش سرما
Study the expression pattern of PdumiR160a, PdumiR168 and PdumiR171a and their target genes in reproductive tissues of almond in response to cold stress
ژنتیک گیاهی
Subject 01
پژوهشی کامل
Applicable
<p dir="RTL" style="text-align: justify;"><span style="font-family:Tahoma;"><span style="font-size:10.0pt;">سرمای دیررس بهاره بهعنوان مهم­ترین محدودیت محیطی برای بادام محسوب می­شود و بهواسطه صدمه به بافت­های زایشی همه ساله منجر به خسارت قابل توجهی در تولید محصول آن می­شود. از آن­جایی که اطلاعات بسیار محدودی دررابطه با پاسخ این گیاه به تنش سرمازدگی بهاره وجود دارد و از طرف دیگر با توجه به نقش مهم تنظیمی </span><span dir="LTR"><span style="font-size:10.0pt;">miRNA</span></span><span style="font-size:10.0pt;">ها در بسیاری از شبکه­های تنظیمی، بر اساس اطلاعات حاصل از آنالیز نتایج توالییابی </span><span dir="LTR"><span style="font-size:10.0pt;">RNA</span></span><span style="font-size:10.0pt;"> و </span><span dir="LTR"><span style="font-size:10.0pt;">sRNA</span></span><span style="font-size:10.0pt;">های بادام، سه ژن </span><em><span dir="LTR"><span style="font-size:10.0pt;">Pdu-miR160a</span></span></em><span style="font-size:10.0pt;">، </span><em><span dir="LTR"><span style="font-size:10.0pt;">Pdu-miR168</span></span></em><span style="font-size:10.0pt;"> و </span><em><span dir="LTR"><span style="font-size:10.0pt;">Pdu-miR171a</span></span></em><span style="font-size:10.0pt;"> بهعنوان </span><span dir="LTR"><span style="font-size:10.0pt;">miRNA</span></span><span style="font-size:10.0pt;">های پاسخ دهنده به تنش سرما بههمراه ژن­های هدف­شان انتخاب و بهمنظور تأیید نتایج توالی­یابی، بیان آن­ها با استفاده از روش </span><span dir="LTR"><span style="font-size:10.0pt;">RT-qPCR</span></span><span style="font-size:10.0pt;"> در اندام­های زایشی دو ژنوتیپ متحمل </span><span dir="LTR"><span style="font-size:10.0pt;">H</span></span><span style="font-size:10.0pt;"> و حساس به سرمای </span><span dir="LTR"><span style="font-size:10.0pt;">Sh12</span></span><span style="font-size:10.0pt;"> تحت دو تیمار تنش صفر و 2- درجه سانتیگراد مورد بررسی قرار گرفت. نتایج، نقش تنظیمی منفی سه </span><span dir="LTR"><span style="font-size:10.0pt;">miRNA</span></span><span style="font-size:10.0pt;"> مورد مطالعه را در پاسخ به هر دو تیمار تنش سرمایی در ژنوتیپ </span><span dir="LTR"><span style="font-size:10.0pt;">H</span></span><span style="font-size:10.0pt;"> نشان داد. اما بر خلاف ژنوتیپ </span><span dir="LTR"><span style="font-size:10.0pt;">H</span></span><span style="font-size:10.0pt;">، نقش تنظیمی مثبت </span><em><span dir="LTR"><span style="font-size:10.0pt;">Pdu-miR168</span></span></em> <span style="font-size:10.0pt;">و </span><em><span dir="LTR"><span style="font-size:10.0pt;">Pdu-miR171a</span></span></em> <span style="font-size:10.0pt;">در پاسخ به تنش سرما در رقم </span><span dir="LTR"><span style="font-size:10.0pt;">Sh12</span></span><span style="font-size:10.0pt;"> آشکار شد. نتایج آزمون همبستگی پیرسون، وجود همبستگی منفی بین </span><em><span dir="LTR"><span style="font-size:10.0pt;">Pdu-miR160a</span></span></em><span style="font-size:10.0pt;"> و </span><em><span dir="LTR"><span style="font-size:10.0pt;">PduARF18</span></span></em> <span style="font-size:10.0pt;">تحت هر دو تنش سرمایی را تنها در اندام­های زایشی بساک و تخمدان رقم </span><span dir="LTR"><span style="font-size:10.0pt;">Sh12</span></span><span style="font-size:10.0pt;"> نشان داد.</span> <span style="font-size:10.0pt;">این در حالی بود که وجود همبستگی منفی میان </span><em><span dir="LTR"><span style="font-size:10.0pt;">Pdu-miR168</span></span></em><span style="font-size:10.0pt;"> و</span><em><span dir="LTR"><span style="font-size:10.0pt;">PduAGO1</span></span></em><span style="font-size:10.0pt;"> تنها در تخمدان ژنوتیپ </span><span dir="LTR"><span style="font-size:10.0pt;">H</span></span><span style="font-size:10.0pt;"> تحت هر دو تنش تیمار سرمایی مشاهده شد. همچنین اثر تنظیمی منفی </span><em><span dir="LTR"><span style="font-size:10.0pt;">Pdu-miR171a</span></span></em><span style="font-size:10.0pt;"> بر ژن هدف </span><em><span dir="LTR"><span style="font-size:10.0pt;">PduSCL6</span></span></em><span style="font-size:10.0pt;"> تحت تنش 2- درجه سانتی­گراد در تخمدان ژنوتیپ </span><span dir="LTR"><span style="font-size:10.0pt;">H</span></span><span style="font-size:10.0pt;"> و هر دو بافت زایشی رقم </span><span dir="LTR"><span style="font-size:10.0pt;">Sh12</span></span><span style="font-size:10.0pt;"> آشکار شد.</span></span></p>
<p dir="RTL" style="text-align: justify;"><span style="font-family:Tahoma;"> </span></p>
Cold spring frost is considered as the most important environmental constraint for almond and due to damage to reproductive tissues annually, it causes significant damage to its product. Since little information is available regarding the molecular response of this plant to the frost stress and considering the important role of regulatory microRNA (miRNAs) in many regulatory networks, based on the data from RNA and sRNA sequencing analysis of almond, three microRNA namely, <em>PdumiR160a</em>, <em>PdumiR168</em> and <em>PdumiR171a</em> with their target genes were selected as cold stress-responsive microRNA. Confirmation of miRNAs expression patterns by quantitative real-time PCR (RT-qPCR) was performed in reproductive tissues of cold-tolerant genotype (H) alongside a sensitive variety (Sh12) under two stress conditions of 0 and -2 ° C. The results showed the negative regulatory role of two miRNAs in response to both cold stresses, but unlike the H genotype, the positive regulatory role of <em>PdumiR168</em> and <em>PdumiR171a</em> were revealed under cold stress in both reproductive tissues of Sh12 variety. Pearson correlation test showed a negative correlation between <em>PdumiR160a</em> and <em>PduARF18</em> under both cold stress treatments in the reproductive tissues of Sh12 variety. However, the negative correlation was observed between <em>PdumiR168</em> and <em>PduAGO1</em> in ovary tissue of H genotype under two cold stress conditions. Also, in this study, the negative regulatory role of <em>PdumiR171a</em> on the <em>PduSCL6</em> target gene was revealed under -2 ° C in ovary tissue of H genotype and both reproductive tissues of Sh12 variety.
تنش سرما, PdumiR160a, PdumiR168 ,PdumiR171a, RT-qPCR
Cold stress, PdumiR160a, PdumiR168, PdumiR171a, RT-qPCR
161
173
http://mg.genetics.ir/browse.php?a_code=A-10-149-1&slc_lang=fa&sid=1
Marzieh
Karimi
مرضیه
کریمی
mr.karimi83@gmail.com
10031947532846005653
10031947532846005653
No
Shahrekord University
دانشگاه شهرکرد
Behrouz
Shiran
بهروز
شیران
beshiran45@gmail.com
10031947532846005654
10031947532846005654
Yes
Shahrekord University
دانشگاه شهرکرد
Mohammad
Rabiei
محمد
ربیعی
k_rabiei@yahoo.com
10031947532846005655
10031947532846005655
No
Shahrekord University
دانشگاه شهرکرد
Hossein
Fallahi
حسین
فلاحی
fallahi.raziuni@gmail.com
10031947532846005656
10031947532846005656
No
Razi University
دانشگاه رازی کرمانشاه