Modern Genetics Journal
فصلنامه علمی ژنتیک نوین
MGj
General
http://mg.genetics.ir
1
admin
2008-4439
2008-4439
8
14
8888
13
fa
jalali
1400
6
1
gregorian
2021
9
1
16
3
online
1
fulltext
fa
تنوع ژنتیکی ارقام و ژنوتیپهای پسته از نظر مقاومت به بیماری پوسیدگی طوقه و ریشه (Phytophthora drechsleri) و ارتباط آن با مارکرهای مولکولی SCoT
Genetic diversity of pistachio cultivars and genotypes in terms of resistance to crown and root rot (Phytophthora drechsleri) and its relationship with .SCoT molecular markers
ژنتیک گیاهی
Subject 01
پژوهشی کامل
Applicable
<div>دانش تنوع ژنتیکی همراه با مدیریت صحیح ژرم‏پلاسم را می‎توان در انتخاب ژنوتیپ‎ها در برنامه‎های به<span dir="LTR">‎</span>نژادی و حفاظت منابع ژنتیکی استفاده نمود. روش<span dir="LTR">‎</span>های ملکولی همراه با روش<span dir="LTR">‎</span>های آماری چندمتغیره، پتانسیل قابل توجهی جهت بررسی تنوع ژنتیکی گیاهان دارند. در این پژوهش، تعداد 20 رقم پسته در گلخانه نسبت به قارچ عامل پوسیدگی ریشه و طوقه ارزیابی شدند و صفات نمره بیماری (<span dir="LTR">score</span>)، درصد مرگ و میر و وزن خشک گیاه اندازه­گیری شد. جهت بررسی تنوع ژنتیکی مقاومت به این بیماری از 12 آغازگر مولکولی <span dir="LTR">SCoT</span> استفاده شد. ارزیابی فنوتیپی، ارقام پسته را به 4 گروه مقاوم، نیمه‏مقاوم، نیمه‏حساس و حساس تقسیم نمود. در ارزیابی تنوع ژنتیکی با آغازگرهای <span dir="LTR">SCoT</span>، از 122 باند تولید شده 105 باند، چند شکل بودند. تجزیه خوشه<span dir="LTR">‎</span>ای ژنوتیپ<span dir="LTR">‎</span>ها براساس باندهای بدست آمده مطابقت خوبی با گروه<span dir="LTR">‎</span>بندی فنوتیپی نداشت؛ لذا به منظور شناسایی باندهایی که بیشترین ارتباط را با صفات فنوتیپی مربوط به مقاومت به گموز داشتند، از روش<span dir="LTR">‎</span>های رگرسیون جزئی (<span dir="LTR">PLS</span>) و رگرسیون گام<span dir="LTR">‎</span>به<span dir="LTR">‎</span>گام استفاده شد. در رگرسیون گام به گام 7 مکان انتخاب شدند که مقاومت به بیماری گموز را 77 تا 86 درصد توجیه نمودند و با تجزیه خوشه<span dir="LTR">‎</span>ای براساس این 7 مکان، دو گروه حاصل گردید که از طریق تجزیه ارتباط (جدول توافق) رابطه این گروه<span dir="LTR">‎</span>بندی با گروه<span dir="LTR">‎</span>بندی براساس صفات فنوتیپی اثبات شد <span dir="LTR">.</span>این 7 مکان، عکس<span dir="LTR">‎</span>العمل ژنوتیپ<span dir="LTR">‎</span>های پسته در مقابل بیماری گموز را به مقدار زیادی توجیه نمودند که از آغازگرهای <span dir="LTR">SCoT12</span>، <span dir="LTR">SCoT16</span>، <span dir="LTR">SCoT17</span> و <span dir="LTR">SCoT20</span> تولید شدند؛ لذا برای مطالعه تنوع ژنتیکی ارقام پسته در مقابل گموز می­توان این آغازگرها را پیشنهاد نمود.</div>
<div>Knowledge of genetic diversity along with the management of germplasm can be used to select genotypes in breeding programs and to protect plant genetic resources. Molecular methods, along with multivariate statistical methods, have a high potential for studying relative relationships, evolution and genetic variation of plants. In this research, 20 pistachio cultivars and genotypes were evaluated in the greenhouse for root and crown rot (gummosis). The traits; disease score, mortality and dry weight were measured. Twelve SCoT primers were used to evaluate the genetic diversity of these cultivars in response to gummosis. The results of greenhouse experiment, divided the cultivars into four groups as: resistant, moderately-resistant, moderately-sensitive and sensitive. The results showed that the SCoT primers, produced 122 loci, of which 105 loci were polymorphic. Cluster analysis of genotypes based on obtained bands did not fit well with phenotypic grouping. In order to identify the bands that have the most relationship with phenotypic attributes related to gummosis, PLS and stepwise regression methods were used. Through stepwise regression, 7 loci were entered into the model, which explained the resistance to gummosis by77 to 86 percent. By cluster analysis based on the reduced variables (7 markers), two groups were obtained that association analysis (contingency table) showed association between this grouping with the phenotypic grouping. These 7 loci greatly explained the genetic variation of pistachio genotypes in response to gummosis disease. In general, according to the results, SCOT12, SCoT16, SCoT17 and SCoT20 primers could be used to study the genetic diversity of pistachio cultivars against gummosis.</div>
گیاه پسته, تنوع ژنتیکی, رگرسیون جزئی (PLS), گموز, آغازگر SCoT
Pistachio, Genetic Diversity, Partial Regression (PLS), Gummosis, SCoT primer
235
248
http://mg.genetics.ir/browse.php?a_code=A-10-203-1&slc_lang=fa&sid=1
shirin
khodadadi
شیرین
خدادادی
shiri.khodadadi@ymail.com
10031947532846005956
10031947532846005956
No
vali-e-asr university
دانشگاه ولی عصر
hossein
dashti
حسین
دشتی
dashti@vru.ac.ir
10031947532846005957
10031947532846005957
Yes
vali-e-asr university
دانشگاه ولی عصر
rooholah
saberi
روح الله
صابری
r.saberi@vru.ac.ir
10031947532846005958
10031947532846005958
No
vali-e-asr university
دانشگاه ولی عصر
khalil
malekzadeh
خلیل
ملکزاده
kh.malekzadeh@vru.ac.ir
10031947532846005959
10031947532846005959
No
vali-e-asr university
دانشگاه ولی عصر
ali
tajabadi pour
علی
تاج آبادی پور
tajabadi@pri.ir
10031947532846005960
10031947532846005960
No
Pistachio Research Center
موسسه تحقیاقات پسته