Modern Genetics Journal
فصلنامه علمی ژنتیک نوین
MGj
General
http://mg.genetics.ir
1
admin
2008-4439
2008-4439
8
14
8888
13
fa
jalali
1401
8
1
gregorian
2022
11
1
17
3
online
1
fulltext
fa
بررسی تنوع ژنتیکی در سه گونه مختلف آژیلوپس با استفاده از نشانگرهای CBDP, SCOT و ISSR
Assessment of genetic diversity among three different species of Aegilops sp. using CBDP, SCoT and ISSR markers
ژنتیک گیاهی
Subject 01
پژوهشی کامل
Applicable
<div style="text-align: justify;"><span style="font-family:Tahoma;"><span class="Heading1Char"><span style="font-weight:bold"><span dir="RTL" lang="AR-SA" style="font-size:12.0pt">جنس آژیلوپس یکی از مهمترین خویشاوندان وحشی گندم بهشمار میرود و گونههای مختلف این جنس پراکنش وسیعی بهویژه در مناطق خاورمیانه و غرب آسیا دارند. آگاهی از تنوع ژنتیکی خویشاوندان وحشی گندم اطلاعات مفیدی را برای استفاده از آنها در برنامههای بهنژادی گندم فراهم میکند. در این مطالعه تنوع ژنتیکی در ۶۰ اکسشن از سه گونه مختلف آژیلوپس با استفاده از سه نشانگر </span></span></span><span class="Heading1Char"><span style="font-weight:bold"><span style="font-size:10.0pt">DNA</span></span></span><span class="Heading1Char"><span style="font-weight:bold"><span dir="RTL" style="font-size:12.0pt"> متفاوت مورد بررسی قرار گرفت. آغازگرهای </span></span></span><span class="Heading1Char"><span style="font-weight:bold"><span style="font-size:10.0pt">CBDP</span></span></span><span class="Heading1Char"><span style="font-weight:bold"><span dir="RTL" lang="AR-SA" style="font-size:12.0pt">، </span></span></span><span class="Heading1Char"><span style="font-weight:bold"><span style="font-size:10.0pt">SCoT</span></span></span><span class="Heading1Char"><span style="font-weight:bold"><span dir="RTL" lang="AR-SA" style="font-size:12.0pt"> و </span></span></span><span class="Heading1Char"><span style="font-weight:bold"><span style="font-size:10.0pt">ISSR</span></span></span><span class="Heading1Char"><span style="font-weight:bold"><span dir="RTL" style="font-size:12.0pt"> بهترتیب ۱۳۰، ۱۳۵ و ۱۵۲ قطعه چند شکل را تکثیر نمودند. متوسط مقدار شاخص اطلاعات چند شکل (</span></span></span><span class="Heading1Char"><span style="font-weight:bold"><span style="font-size:10.0pt">PIC</span></span></span><span class="Heading1Char"><span style="font-weight:bold"><span dir="RTL" lang="AR-SA" style="font-size:12.0pt">)</span></span></span> <span class="Heading1Char"><span style="font-weight:bold"><span dir="RTL" lang="AR-SA" style="font-size:12.0pt">برای آغازگرهای </span></span></span><span class="Heading1Char"><span style="font-weight:bold"><span style="font-size:10.0pt">CBDP</span></span></span><span class="Heading1Char"><span style="font-weight:bold"><span dir="RTL" lang="AR-SA" style="font-size:12.0pt">، </span></span></span><span class="Heading1Char"><span style="font-weight:bold"><span style="font-size:10.0pt">SCoT</span></span></span><span class="Heading1Char"><span style="font-weight:bold"><span dir="RTL" lang="AR-SA" style="font-size:12.0pt"> و </span></span></span><span class="Heading1Char"><span style="font-weight:bold"><span style="font-size:10.0pt">ISSR</span></span></span><span class="Heading1Char"><span style="font-weight:bold"><span dir="RTL" lang="AR-SA" style="font-size:12.0pt"> بهترتیب 37/0 34/0 و 39/0 بهدست آمد که نشاندهنده کارایی و قدرت تفکیک بالا و مناسب این نشانگرها بود. تجزیه کلاستر دادههای نشانگرها 60 اکسشن مورد مطالعه را در سه گروه اصلی طبقهبندی کرد که این گروهبندی کاملا</span></span></span><span class="Heading1Char"><span style="font-weight:bold"><span dir="RTL" lang="FA" style="font-size:12.0pt">ً</span></span></span> <span class="Heading1Char"><span style="font-weight:bold"><span dir="RTL" lang="AR-SA" style="font-size:12.0pt">منطبق با ساختار ژنتیکی و بر اساس گونههای مربوطه بود. نتیجه تجزیه واریانس مولکولی (</span></span></span><span class="Heading1Char"><span style="font-weight:bold"><span style="font-size:10.0pt">AMOVA</span></span></span><span class="Heading1Char"><span style="font-weight:bold"><span dir="RTL" lang="AR-SA" style="font-size:12.0pt">) بر اساس دادههای </span></span></span><span class="Heading1Char"><span style="font-weight:bold"><span style="font-size:10.0pt">CBDP</span></span></span><span class="Heading1Char"><span style="font-weight:bold"><span dir="RTL" lang="AR-SA" style="font-size:12.0pt">، </span></span></span><span class="Heading1Char"><span style="font-weight:bold"><span style="font-size:10.0pt">ISSR</span></span></span><span class="Heading1Char"><span style="font-weight:bold"><span dir="RTL" lang="AR-SA" style="font-size:12.0pt"> و </span></span></span><span class="Heading1Char"><span style="font-weight:bold"><span style="font-size:10.0pt">SCoT</span></span></span><span class="Heading1Char"><span style="font-weight:bold"><span dir="RTL" lang="AR-SA" style="font-size:12.0pt"> نشان داد که سهم واریانس بین گونهای بهترتیب 66 درصد، 45 درصد و ۴۲ درصد از میزان تنوع کل میباشد. علاوه بر این، در بین سه گونه مورد مطالعه گونه</span></span></span> <span class="Heading1Char"><span style="font-weight:bold"><span style="font-size:10.0pt">Ae. <i>triuncialis</i></span></span></span><span class="Heading1Char"><span style="font-weight:bold"><span dir="RTL" style="font-size:12.0pt"> بیشترین تعداد آلهای اختصاصی را بر اساس نشانگرهای مختلف نشان داد که این موضوع میتواند نمایانگر تنوع بالا و زمینه ژنتیکی منحصربهفرد این گونه باشد. نتایج این تحقیق سطح بالایی از تنوع ژنتیکی را درون سه گونه مورد مطالعه نشان داد که حاکی از پتانسیل بالای این مواد ژنتیکی برای بهکارگیری در برنامههای بهنژادی گندم است. همچنین یافتههای تحقیق مشخص نمود که هر سه سیستم نشانگری تکنیکهایی مناسب و کارآمد برای بررسی تنوع ژنتیکی میباشند، اگرچه یقیناً استفاده از نشانگرهای </span></span></span><span class="Heading1Char"><span style="font-weight:bold"><span style="font-size:10.0pt">CBDP</span></span></span><span class="Heading1Char"><span style="font-weight:bold"><span dir="RTL" lang="AR-SA" style="font-size:12.0pt"> و </span></span></span><span class="Heading1Char"><span style="font-weight:bold"><span style="font-size:10.0pt">SCoT</span></span></span><span class="Heading1Char"><span style="font-weight:bold"><span dir="RTL" lang="AR-SA" style="font-size:12.0pt"> که تنوع را بر اساس چندشکلی موجود در توالیهای نواحی فعال ژنوم مشخص مینمایند بر نشانگرهای تصادفی و نیمه تصادفی ارجحیت دارد. </span></span></span></span></div>
<span style="font-size:11pt"><span style="line-height:200%"><span calibri="" style="font-family:"><span class="fontstyle01" style="font-family:" timesnewromanpsmt=""><span style="color:black"><span style="font-weight:normal"><span style="font-style:normal"><span style="font-size:12.0pt"><span style="line-height:200%"><span new="" roman="" style="font-family:" times="">The genus of Aegilops is one of the most important wild relatives of wheat, and different species of this genus have a wide distribution in Middle East and West Asia. Knowledge about the genetic diversity of Aegilops species provides useful information which can be exploited for breeding programs of wheat. In this study, genetic diversity of 60 Agilops accessions from three different species were investigated using three different DNA markers. CBDP, SCoT and ISSR primers amplified 130, 135 and 152 polymorphic fragments respectively. The average of polymorphism information content (PIC) for CBDP, SCoT and ISSR primers were 0.37, 0.34 and 0.39 respectively indicated the efficiency and usefulness of the used primers. The neighbor-joining (NJ) based clustering using marker data, classified all 60 accessions into three main groups and the investigated accessions were clustered based on the genetic structure. The results of analysis of molecular variance based on CBDP, ISSR and SCoT data showed that the variance among populations covered 66%, 45% and 42% of total variation respectively. Besides, among all three species, </span></span></span></span></span></span></span><span class="fontstyle01" style="font-family:" timesnewromanpsmt=""><span style="color:black"><span style="font-weight:normal"><span style="font-style:normal"><i><span style="font-size:12.0pt"><span style="line-height:200%"><span new="" roman="" style="font-family:" times="">Ae. triuncialis</span></span></span></i></span></span></span></span><span class="fontstyle01" style="font-family:" timesnewromanpsmt=""><span style="color:black"><span style="font-weight:normal"><span style="font-style:normal"><span style="font-size:12.0pt"><span style="line-height:200%"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""> showed the maximum number of private allels indicating its unique genetic background. Our results revealed high levels of genetic diversity within all three species, showing high potential of studied germplasm for using in breeding programs. Further, our findings indicated that all three marker systems were useful techniques for evaluation of genetic diversity, however, CBDP and SCoT markers which are generated from the functional regions of the genomes, would be more useful for evaluation of genetic diversity than random or semi random PCR based markers.</span></span></span></span></span></span></span></span></span></span><br>
گندم, خویشاوندان وحشی, تنوع ژنتیکی, نشانگرهای DNA
wheat, wild relatives, genetic diversity, DNA markers
323
335
http://mg.genetics.ir/browse.php?a_code=A-10-382-1&slc_lang=fa&sid=1
ghazal
ghobadi
غزل
قبادی
ghobadighazal@yahoo.com
10031947532846007240
10031947532846007240
No
دانشگاه آزاد اسلامی واحد کرمانشاه
alireza
etminan
علیرضا
اطمینان
alietminan55@yahoo.com
10031947532846007241
10031947532846007241
Yes
دانشگاه آزاد اسلامی واحد کرمانشاه
ali mehras
mehrabi
علی مهراس
مهرابی
alimehrasmehrabi@yahoo.com
10031947532846007242
10031947532846007242
No
دانشگاه آزاد اسلامی واحد کرمانشاه
lia
shooshtary
لیا
شوشتری
L_shooshtary@yahoo.com
10031947532846007243
10031947532846007243
No
دانشگاه آزاد اسلامی واحد کرمانشاه