fa مطالعات ژنتیکی روی ژن هسته یخ باکتری Bacillus cereusعامل سرمازدگی گیاه پیاز (Allium cepa) ژنتیک گیاهی Subject 01 پژوهشی کامل Applicable <h1 dir="RTL" style="text-align: justify;"><span style="font-family:tahoma;"><span style="font-size:14px;">باکتری<span dir="LTR">&shy;</span>های فعال هسته ‌یخ به‌دلیل تسریع فرآیند یخ‌زدگی در دمای <span dir="LTR">&deg;C</span> 5- و دماهای بالاتر، یکی از عوامل مهم سرمازدگی در سطح مزارع و باغ‌های کشور هستند. به‌منظور شناسایی باکتری‌های دارای ژن هسته یخ، چندین نمونه باکتریائی با قدرت هسته‌ یخ جداسازی شد که نهایتاً باکتری عامل سرمازدگی گیاه پیاز انتخاب شد. جهت ارزیابی فعالیت هسته ‌یخ از آزمون انجماد درون لوله‌ای و انجماد قطره‌ای استفاده شد. شناسایی به روش معمول صفات فنوتیپی انجام گرفت و جدایه باکتریائی در سطح جنس <em><span dir="LTR">Bacillus</span></em> شناسائی شد. با تکثیر ژن <em><span dir="LTR">16SrRNA</span></em> و بلاست توالی در سایت <span dir="LTR">NCBI</span> تعلق آن به گونه <em><span dir="LTR">Bacillus cereus</span></em> محرز شد. به‌دلیل عدم وجود ژن مولد هسته ‌یخ برای جدایه مذکور در سایت <span dir="LTR">NCBI</span> آغازگری مشابه با آغازگرهای تعریف شده برای ژن هسته‌ یخ در<em><span dir="LTR">Pseudomonas syringae</span></em> &nbsp;با این فرض که ژن <em><span dir="LTR">ina</span></em> در<em><span dir="LTR">B. cereus</span></em> مشابه با ژن هسته‌ یخ (<em><span dir="LTR">inaZ</span></em>) در <em><span dir="LTR">Pseudomonas syringae</span></em> &nbsp;است طراحی شد و برای ردیابی ژن هسته ‌یخ (<em><span dir="LTR">ina</span></em>) آنالیز واکنش زنجیره‌ای پلیمراز انجام گرفت. در ادامه تحقیق با استفاده از آغازگر <em><span dir="LTR">16SrRNA</span></em>، فرآیند همسانه‌سازی و استخراج پلاسمید به‌منظور انجام توالی‌یابی دقیق‌تر انجام گرفت. این اولین گزارش از وجود ژن هسته ‌یخ در گونه <em><span dir="LTR">Bacillus cereus</span></em> است.</span></span></h1> The ice nucleation active (INA⁺) bacteria are one of the most important biological factors in fields and orchards frost damage. Most of these bacteria usually accelerate the freezing process at<span dir="RTL">- </span>5&deg;C and higher temperatures. In order to identify INA⁺ bacteria, many plant samples were screened and one positive Ice bacterium associated with onion bulb was selected. The bacterium was then tentatively identified using some key bacteriological methods. Accurate identification of the strain A at species level was made by PCR amplification of <em>16SrRNA</em> followed by blast at NCBI. Ice nucleation activity of the bacterium was tested by tube INA assay and droplet freezing method. Due to the absence of a nucleus-producing gene for representative isolate at the NCBI site, a primer set similar to <em>inaZ</em> gene of <em>Pseudomonas syringae</em> was designed and PCR analysis was performed. PCR-amplicons were further analyzed by plasmid DNA analysis as well as cloning and sequencing. The results were indicated that there might be different types of ice gene in <em>Bacillus</em> <em>cereus </em>strain A. This is the first report of an Ice-plus <em>Bacillus cereus</em> from plant samples. همسانه‌سازی هسته ‌یخ INA Bacillus cereus INA, Bacillus cereus, Cloning, Ice nucleation bacteria 49 54 http://mg.genetics.ir/browse.php?a_code=A-10-163-1&slc_lang=fa&sid=1 S Karkazi سارا کرکزی 10031947532846003981 10031947532846003981 No گروه بیوتکنولوژی و به نژادی، واحد علوم و تحقیقات، دانشگاه آزاد اسلامی، تهران، ایران P Abdollahi پریسا عبداللهی abdollahi@srbiau.ac.ir 10031947532846003982 10031947532846003982 Yes گروه بیوتکنولوژی و به نژادی، واحد علوم و تحقیقات، دانشگاه آزاد اسلامی، تهران، ایران N Hasanzadeh rastegari نادر حسن‌زاده راستگاری 10031947532846003983 10031947532846003983 No گروه گیاهپزشکی، واحد علوم و تحقیقات، دانشگاه آزاد اسلامی، تهران، ایران