fa ارزیابی تنوع ژنتیکی جمعیت‌های آژیلوپس واجد ژنوم D با استفاده از نشانگرهای SCoT و TRAP ژنتیک گیاهی Subject 01 پژوهشی کامل Applicable <p dir="RTL"><span style="font-family:b zar;"><span style="font-size:10.0pt;">اهداف اصلی این مطالعه ارزیابی تنوع ژنتیکی موجود در 53 توده آژیلوپس متعلق به سه گونه </span></span><em><span dir="LTR">Aegilops tauschii</span></em><span style="font-family:b zar;"><span style="font-size:10.0pt;">، </span></span><em><span dir="LTR">Ae. cylindrica</span></em> <span style="font-family:b zar;"><span style="font-size:10.0pt;">و </span></span><em><span dir="LTR">Ae. crassa</span></em> <span style="font-family:b zar;"><span style="font-size:10.0pt;">و همچنین مقایسه کارایی دو نشانگر مولکولی </span></span><span dir="LTR">SCoT (Start codon targeted)</span><span style="font-family:b zar;"><span style="font-size:10.0pt;"> و</span></span> <span style="font-family:b zar;"><span style="font-size:10.0pt;">(</span></span><span dir="LTR">Target Region Amplification Polymorphism</span><span style="font-family:b zar;"><span style="font-size:10.0pt;">) </span></span><span dir="LTR">TRAP</span><span style="font-family:b zar;"><span style="font-size:10.0pt;"> بود. در مجموع 15 آغازگر </span></span><span dir="LTR">SCoT</span><span style="font-family:b zar;"><span style="font-size:10.0pt;"> و شش جفت آغازگر </span></span><span dir="LTR">TRAP</span><span style="font-family:b zar;"><span style="font-size:10.0pt;"> به‌ترتیب 165 و 201 قطعه چند شکل تکثیر کردند. متوسط شاخص‌های تعداد قطعات چندشکل تکثیری، شاخص نشانگری و قدرت تمایز آغازگر برای آغازگرهای </span></span><span dir="LTR">TRAP</span><span style="font-family:b zar;"><span style="font-size:10.0pt;"> بیشتر از </span></span><span dir="LTR">SCoT</span><span style="font-family:b zar;"><span style="font-size:10.0pt;"> بود. با این حال متوسط شاخص محتوای اطلاعات چندشکل در آغازگرهای </span></span><span dir="LTR">SCoT</span><span style="font-family:b zar;"><span style="font-size:10.0pt;"> بیشتر از </span></span><span dir="LTR">TRAP</span><span style="font-family:b zar;"><span style="font-size:10.0pt;"> بود. نتایج حاصل از تجزیه واریانس مولکولی (</span></span><span dir="LTR">AMOVA</span><span style="font-family:b zar;"><span style="font-size:10.0pt;">) انجام شده بر اساس هر یک از سیستم&shy;های نشانگری متفاوت از هم بود به‌طوری‌که بر اساس داده&shy;های </span></span><span dir="LTR">SCoT</span><span style="font-family:b zar;"><span style="font-size:10.0pt;"> بیشترین سهم تنوع ژنتیکی مربوط به تنوع درون گونه&shy;ای بود و بر عکس داده&shy;های </span></span><span dir="LTR">TRAP</span><span style="font-family:b zar;"><span style="font-size:10.0pt;"> بیشترین میزان تنوع ژنتیکی را در بین گونه&shy;ها نشان دادند. آغازگرهای </span></span><span dir="LTR">SCoT</span><span style="font-family:b zar;"><span style="font-size:10.0pt;"> نسبت به </span></span><span dir="LTR">TRAP</span><span style="font-family:b zar;"><span style="font-size:10.0pt;"> مقادیر بالاتری برای کلیه پارامترهای ژنتیکی نشان دادند و بر اساس آغازگرهای </span></span><span dir="LTR">SCoT</span><span style="font-family:b zar;"><span style="font-size:10.0pt;"> و </span></span><span dir="LTR">TRAP</span><span style="font-family:b zar;"><span style="font-size:10.0pt;"> بیشترین مقادیر پارامترهای ژنتیکی به‌ترتیب در گونه </span></span><em><span dir="LTR">Ae. cylindrica</span></em> <span style="font-family:b zar;"><span style="font-size:10.0pt;">و</span></span><em><span dir="LTR">Ae. tauschii</span></em><span style="font-family:b zar;"><span style="font-size:10.0pt;"> مشاهده شد. تجزیه خوشه&shy;ای بر اساس هر یک از سیستم&shy;های نشانگری و هم‌چنین ترکیب داد&shy;های حاصل از هر دو نشانگر کلیه توده&shy;های مورد بررسی را درسه گروه اصلی تفکیک نمود. الگوی گروه&shy;بندی به وجود آمده بر اساس آغازگرهای </span></span><span dir="LTR">SCoT</span><span style="font-family:b zar;"><span style="font-size:10.0pt;"> نسبت به </span></span><span dir="LTR">TRAP</span><span style="font-family:b zar;"><span style="font-size:10.0pt;"> واضح‌تر بود. از این‌رو استفاده از نشانگرهای </span></span><span dir="LTR">SCoT</span><span style="font-family:b zar;"><span style="font-size:10.0pt;"> در بررسی ساختار جمعیت و گروه&shy;بندی توده&shy;های مختلف و استفاده از نشانگرهای </span></span><span dir="LTR">TRAP</span><span style="font-family:b zar;"><span style="font-size:10.0pt;"> در اشباع نقشه&shy;های ژنتیکی توصیه می&shy;شود.</span></span></p> The main objectives of this study were to evaluate the genetic diversity in 53 <em>Aegilops</em> accessions belonging to <em>Aegilops tauschii</em>, <em>Ae. cylindrica</em> and <em>Ae. crassa</em> as well as comparison of the efficiency of start codon targeted (SCoT) and targeted region amplification polymorphism (TRAP) markers. A total of 15 SCoT and six TRAP primer pairs amplified 165 and 201 polymorphic bands, respectively. TRAP primers indicated higher values for the number of polymorphic bands, marker index and resolving power compared to SCoT primers. However, SCoT primers showed the higher PIC value than TRAPs. The results of molecular variance analysis (AMOVA) were different for each of the marker systems, so that SCoT markers showed the highest portion of genetic variance referred to intra-species, while based on TRAP markers the highest variance was observed inter-species. SCoT markers indicated the highest values for all genetic parameters compared to TRAPs and <em>Ae. cylindrica</em> and <em>Ae. tauschii </em>exhibited the highest genetic variation based on SCoTs and TRAPs, respectively. Cluster analysis based on each marker systems as well as the pooled data classified all accessions into three main groups. The clustering pattern based on SCoT primers was clearer than TRAPs. Hence, the use of SCoT markers is recommended for population genetic structure analysis and grouping of them, while the use of TRAPs can be recommended for fine mapping studies.<br> &nbsp; آژیلوپس, تجزیه واریانس مولکولی, توالی‌های بیان شونده برچسب‌دار, نشانگرهای مولکولی هدفمند Aegilops, AMOVA, Targeted molecular markers, Expressed sequence tags 221 230 http://mg.genetics.ir/browse.php?a_code=A-10-83-1&slc_lang=fa&sid=1 Jafar Ahmadi جعفر احمدی njahmadi910@yahoo.com 10031947532846004136 10031947532846004136 Yes دانشگاه بین‌المللی امام خمینی (ره)، قزوین، ایران Sedigheh Fabriki-Ourang صدیقه فابریکی اورنگ s.ourang910@gmail.com 10031947532846004137 10031947532846004137 No دانشگاه بین‌المللی امام خمینی (ره)، قزوین، ایران Alireza Pour-Aboughadareh علیرضا پورابوقداره a.poraboghadareh@gmail.com 10031947532846004138 10031947532846004138 No سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران