دوره 14، شماره 3 - ( 9-1398 )                   جلد 14 شماره 3 صفحات 197-210 | برگشت به فهرست نسخه ها

XML English Abstract Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Bioinformatic Analysis of Self-Incompatibility Locus in Pear Species, Pyrus communis L. and Evaluation of the Related Alleles in Some Commercial and Native Cultivars. MGj. 2019; 14 (3) :197-210
URL: http://mg.genetics.ir/article-1-113-fa.html
عبداللهی حمید، صادق نژاد سارا. آنالیز بیوانفورماتیک مکان ژنی خودناسازگاری گونه گلابی Pyrus communis L. و بررسی آلل-های مرتبط در برخی از ارقام تجاری و بومی. فصلنامه علمی ژنتیک نوین. 1398; 14 (3) :197-210

URL: http://mg.genetics.ir/article-1-113-fa.html


سازمان تحقیقات اموزش و ترویج کشاورزی-موسسه تحقیقات
چکیده:   (270 مشاهده)

آلل‌های جدید شناسائی‌شده مکان ژنی خودناسازگاری گلابی معمولی، نام‌گذاری مجدد و همولوژی بالای برخی این آلل‌ها، سبب تداخل در بررسی و طبقه‌بندی آن‌ها شده‌است. تحقیق اخیر با هدف مرور جامع بیوانفورماتیک و بررسی ساختار ژنتیکی کلیه 27 آلل S شناسائی­شده این گونه و بررسی این آلل­ها در برخی ارقام تجاری و بومی گلابی ایران بر اساس این اطلاعات بیوانفورماتیک و مقایسه با گزارشات قبل انجام شد. نتایج نشان­دهنده وجود توالی کامل 21 آلل این گونه بود که به‌صورت نواحی 13 گانه شامل پیشرانه، پنج ناحیه حفاظت­شده C1 تا C5، اینترون و 6 ناحیه بینابینی خطی و حفاظت­شدگی قابل­توجهی در ناحیه پیشرانه و سیگنال، به غیر از نواحی C1 تا C5 مشاهده شد. همچنین در ناحیه پیشرانه اغلب آلل­ها، حداقل دو جایگاه CAAT و دو جایگاه نزدیک و یا به­هم چسبیده TAAT مشاهده شد. تجزیه خوشه­ای بخش­های مختلف آلل­ها، بیانگر شباهت کامل پلی­پپتیدی دو آلل S119 و S121 بود، لیکن از نظر اینترون تفاوت جزئی در طول و توالی داشته که دلیل اشتباهات ارزیابی آلل­های برخی ارقام داخلی نظیر رقم درگزی بود. مقایسه نتایج بررسی آلل­های خودناسازگاری در برخی از ارقام بومی با استفاده از نتاج بیوانفورماتیک نشان­داد، استفاده از آغازگرهای اختصاصی، روش کاملاً قابل­اعتمادی در شناسائی این آلل­ها خصوصاً در ارقام دارای جریان ژنی دیگر گونه­ها نیست. بررسی آلل­های خودناسازگاری ارقام نشان­دهنده حضور آلل S104 در ارقام شاهد کوشیا و بوره­دیل و رقم کروس­سیحان (Krus SiehanS108 در کروسالون (KrusalunS107 در شاه­میوه و شکری، S119 در اسفراینی و درگزی، S35 گونه P. ussuriensis در ارقام کفتربچه، شیرین ترکان و کنجونی و S19 گونه P. × bretschneideri به‌عنوان دیگر آلل رقم شکری بود. نتایج ضمن تایید گزارشات قبلی وجود جریان ژنی دیگر گونه­های گلابی در تکامل ارقام بومی ایران، نشانگر اهمیت بررسی جامع بیوانفورماتیک آلل­های جنس Pyrus در کنار هم بود.

متن کامل [PDF 777 kb]   (104 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشی کامل | موضوع مقاله: ژنتیک گیاهی
دریافت: ۱۳۹۸/۷/۱۷ | پذیرش: ۱۳۹۸/۹/۲۵ | انتشار: ۱۳۹۸/۱۱/۱۰

ارسال نظر درباره این مقاله : نام کاربری یا پست الکترونیک شما:
CAPTCHA

ارسال پیام به نویسنده مسئول


کلیه حقوق این وب سایت متعلق به فصلنامه علمی ژنتیک نوین می باشد.

طراحی و برنامه نویسی : یکتاوب افزار شرق

© 2020 All Rights Reserved | فصلنامه علمی ژنتیک نوین

Designed & Developed by : Yektaweb