دوره 14، شماره 4 - ( 11-1398 )                   جلد 14 شماره 4 صفحات 281-290 | برگشت به فهرست نسخه ها

XML English Abstract Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Construction of high density linkage map in spring bread wheat recombinant inbred lines using genotyping by sequencing (GBS) method. MGj. 2020; 14 (4) :281-290
URL: http://mg.genetics.ir/article-1-130-fa.html
عبدالهی سیسی نیر، محمدی سید ابولقاسم، غفاریان سارا. تهیه نقشه ژنتیکی اشباع جمعیت لاین‌های اینبرد نوترکیب گندم نان بهاره با استفاده از روش ارزیابی ژنوتیپی با توالی‌یابی (Genotyping by Sequencing). فصلنامه علمی ژنتیک نوین. 1398; 14 (4) :281-290

URL: http://mg.genetics.ir/article-1-130-fa.html


دانشگاه تبریز
چکیده:   (365 مشاهده)

نقشه‌های ژنتیکی اشباع لازمه مکان‌یابی دقیق مکان­های ژنی کنترل کننده صفات کمی می­باشند. در این مطالعه، نقشه ژنتیکی اشباع جمعیت لاین­های اینبرد نوترکیب گندم نان بهاره حاصل از تلاقی رقم Yecora Rojo و ژنوتیپ بومی No. 49 با استفاده از روش ارزیابی ژنوتیپی با توالی­یابی (GBS) تهیه شد. برای شناسایی چندشکلی‌های تک نوکلئوتیدی (SNPs)، توالی‌یابی والدین و لاین­های اینبرد نوترکیب به‌صورت تکرار دار در سه لاین دستگاه ایلومینا Illumina Hiseq 2500 انجام شد. در مجموع، بیش از 36 هزار SNP شناسایی شد که 804 SNP به هیچ گروه کروموزومی منتسب نشد. از این تعداد SNP، 3042 به زیرژنوم A، 3977 به زیرژنوم B و 769 SNP به زیرژنوم D تعلق داشتند. پس از حذف SNPهایی با داده گمشده بیش از 20 درصد، فراوانی آلل نادر کمتر از 5 درصد و نیز دارای انحراف تفرق از نسبت‌ مندلی 1:1، تعداد 5831 نشانگر SNP شناسایی و به 21 کروموزوم گندم منتسب شد. این نشانگرها، 14/3642 سانتی‌مورگان از ژنوم گندم را با متوسط فاصله 62/0 سانتی‌مورگان بین دو نشانگر مجاور پوشش دادند.

متن کامل [PDF 699 kb]   (90 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشی کامل | موضوع مقاله: ژنتیک گیاهی
دریافت: 1398/7/17 | پذیرش: 1398/12/15 | انتشار: 1398/12/15

ارسال نظر درباره این مقاله : نام کاربری یا پست الکترونیک شما:
CAPTCHA

ارسال پیام به نویسنده مسئول


کلیه حقوق این وب سایت متعلق به فصلنامه علمی ژنتیک نوین می باشد.

طراحی و برنامه نویسی : یکتاوب افزار شرق

© 2020 All Rights Reserved | فصلنامه علمی ژنتیک نوین

Designed & Developed by : Yektaweb