دوره 16، شماره 4 - ( 10-1400 )                   جلد 16 شماره 4 صفحات 328-321 | برگشت به فهرست نسخه ها

XML English Abstract Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Khoshnevisan A, Farrokh P. Identification and molecular characterization of two tatD DNase genes from a native Bacillus sp. B2. MGj. 2021; 16 (4) :321-328
URL: http://mg.genetics.ir/article-1-1703-fa.html
خوشنویسان امین، فرخ پریسا. شناسایی و تعیین خصوصیات مولکولی دو ژن tatD DNase از سویه بومی Bacillus sp. B2. فصلنامه علمی ژنتیک نوین. 1400; 16 (4) :328-321

URL: http://mg.genetics.ir/article-1-1703-fa.html


دانشگاه دامغان
چکیده:   (280 مشاهده)

نوکلئازها پیوندهای فسفودی‌استر را در اسیدهای نوکلئیک می‌شکنند. TatD DNase پروتئین تکاملی حفاظت شده‌ای است که در موجودات مختلف بیان می­شود، اما عملکردش به‌طور کامل شناخته نشده است. هدف این پژوهش، شناسایی ژن‌های tatD در جدایه Bacillus sp. B2 بود که قبلا از خاک شهرستان دامغان جداسازی شده است. شناسایی مولکولی این جدایه با تکثیر و توالی‌یابی 16S rRNA انجام شد. دو جفت پرایمر چندحالتی برای ژن‌هایtatD  طراحی شدند و توالی‌های تکثیر شده با BLAST بررسی شد. توالی‌های اسید‌آمینه‌ای ژن‌های tatD، با توالی شناخته شده TatD در E. coli هم‌ردیف شدند. ساختار دوم پروتئین‌های TatD و دُمین حفاظت شده در آن‌ها به‌ترتیب با ابزارهای PSIpred و CD-search پیش‌بینی شدند. توالی 16S rRNA در Bacillus sp. B2، 100% با توالی‌های B. cereus، B. thuringiensis و B. anthracis همسانی نشان داد. به‌علاوه، ژن‌های tatD1 و tatD2 تکثیر شده، بیش از 90% با توالی­های tatD DNase در گونه‌های باسیلوس همسانی داشتند. هم‌ردیفی توالی‌های TatD با توالی TatD Dnase از E. coli نشان داد که باقی‌مانده‌های متصل­شونده به یون فلزی و جایگاه فعال در آن‌ها حفاظت شده است. ساختارهای دوم توالی‌های TatD1 و TatD2 مشابه با توالی TatD Dnase در E. coli بودند و CD-Search نشان داد که هر دو پروتئین TatD به ابرخانواده هیدرولازهای وابسته به یون فلزی تعلق دارند. بر اساس این نتایج، جدایه Bacillus sp. B2 دو ژن متفاوت tatD داشت. به‌نظر می‌رسد که tatD در ژنوم تعدادی از گونه‌های باسیلوسی مضاعف شده و تکامل یافته است. شناسایی و تعیین خصوصیات TatD از موجودات مختلف برای درک نقش آن به‌عنوان یک پروتئین تکاملی حفاظت شده، ارزشمند است.

متن کامل [PDF 417 kb]   (92 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشی کامل | موضوع مقاله: ژنتیک ریزسازواره
دریافت: 1400/3/6 | پذیرش: 1400/7/28 | انتشار: 1400/10/11

ارسال نظر درباره این مقاله : نام کاربری یا پست الکترونیک شما:
CAPTCHA

ارسال پیام به نویسنده مسئول


بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.

کلیه حقوق این وب سایت متعلق به فصلنامه علمی ژنتیک نوین می باشد.

طراحی و برنامه نویسی : یکتاوب افزار شرق

© 2022 CC BY-NC 4.0 | فصلنامه علمی ژنتیک نوین

Designed & Developed by : Yektaweb