دانشگاه زنجان
چکیده: (524 مشاهده)
گندم نان (Triticum aestivum L.) یک گیاه آلوهگزاپلوئید متشکل از سه ژنوم (A، B و D) است که از سه گونه دیپلوئیدی اجدادی از طریق هیبریداسیونهای متعدد منشاء گرفته است. با وجود در دسترس بودن توالی ژنوم گندم و مطالعات انجام شده در مورد آن، همچنان میتوان اطلاعات بیشتری در مورد ژنوم و ترانسکریپتوم آن بهدست آورد. در این تحقیق هدف استخراج اطلاعات توصیفی در مورد ژنها و رونوشتهای گندم و بررسی شباهتها و تفاوتهای موجود در ژنومهای مختلف گندم از موادری مانند تعداد ژنها و رونوشتها، چگالی ژنی، تعداد اینترونها، پیرایش متناوب و همچنین مقایسه شاخصهایی مانند طول CDS، UTR و درصد GC بود. نتایج نشان داد که چگالی ژن در گندم حدود 5/7 میباشد و ژنوم D نسبت به دو ژنوم دیگر چگالی بالاتری دارد. بهعلاوه علیرغم تفاوت در میانگین طول ژن و اینترون، شباهت بسیاری در میانگین طول اگزون، رونوشت و طول ناحیه کدکننده (CDS) در ژنومهای A، B و D دیده شد. مقایسه رونوشتها و ژنها نشان داد که تقریباً 80 درصد ژنها دارای اینترون بوده و رخداد پیرایش متناوب تقریباً در 16 درصد ژنها اتفاق افتاده است. بخش عمده پیرایشها در ناحیه کدکننده رونوشتها و بخش کمی در ناحیه UTR صورت میگیرد. همچنین در ناحیه کدکننده (CDS)، فراوانی پیرایش در بین کدون بیش از پیرایش در درون کدونها بود. اکثر رونوشتها در گندم دارای UTR بوده و حدود 10 درصد از UTRها دارای uORF میباشند. اگرچه تغییرات GC برای ژنها، رونوشتها، اینترونها و UTR، بین 30 تا 80 درصد بود با این وجود بررسی ارتباط تغییرات درصد GC با طول موارد اشاره شده الگوی متفاوتی را نشان داد. در نهایت میتوان گفت با وجود تفاوت در منشأ ژنومهای گندم وجود شباهتهای بسیاری از نظر طول کروموزوم، چگالی ژن، پیرایش متناوب و پارامترهای مختلفی از جمله طول CDS، طول UTR و درصد GC قابل توجه میباشد.
شمارهی مقاله: 6
نوع مطالعه:
پژوهشی کامل |
موضوع مقاله:
ژنتیک گیاهی دریافت: 1401/4/4 | پذیرش: 1401/12/3 | انتشار: 1402/2/17