انار (Punica granatum L.) یکی از قدیمی‌ترین میوه‌های خوراکی است که دارای ارزش غذایی و خواص دارویی بالایی می‌باشد. مرکز پیدایش انار آسیای میانه، به ویژه بخش‎های از ایران، افغانستان و هند می‌باشد که از آن‌جا به دیگر نقاط جهان گسترش یافته است که نشان دهنده تنوع ژنتیکی گسترده و دامنه سازگاری بالای آن جهت کشت در شرایط اقلیمی مختلف است. به‎منظور بررسی روابط ژنتیکی موجود بین و درون جمعیت‎های ارقام انار از کشورهای ایران، افغانستان، ترکمنستان، سوریه، لبنان، هند، یمن و ایالت متحده آمریکا واقع در دو قاره آسیا و آمریکا از آغازگرSSR  استفاده شد. در این مطالعه، شش آغازگر ریز ماهواره‎ای، 24 آلل چند شکل تولید کردند. برای هر مکان ژنی تعداد آلل‎ها از 3 تا 5 آلل با میانگین 4 آلل متغیر بود. محتوی اطلاعات چند شکلی مربوط به مکان‎های ژنی 28/0 تا 46/0 با میانگین 38/0 ارزیابی شد. نتایج شاخص تنوع نی، تجزیه و تحلیل هماهنگ اصلی و تجزیه واریانس مولکولی، حاکی از وجود تنوع در داخل ژنوتیپ‌های هر جمعیت بود. در بین ژنوتیپ‎های مورد مطالعه، ارقام ایرانی دارای تنوع ژنتیکی بالاتری نسبت به سایر جمعیت‌ها بودند. براساس نتایج تجزیه خوشه‏ای مشخص شد که تنوع جغرافیایی ژنوتیپ‏ها تا حدودی از تنوع ژنتیکی تبعیت می‏کند. براساس پژوهش حاضر آغازگر SSR توانست اطلاعات سودمندی را در ارتباط با روابط ژنتیکی ژنوتیپ‎های انار با منشاء مختلف ارائه دهد که می‎تواند در برنامه‎های به نژادی انار مانند برنامه‌های گزینش و هیبریداسیون جهت تهیه ارقام هیبرید و یا ترسیم نقشه‌های لینکاژی و همچنین توالی‌یابی باندهای اختصاصی و مدیریت کلکسیون‌های انار مفید واقع شود.