همه گیاهان در انواع بافت­هایشان تعداد زیادی ریزسازواره دارند که برروی بسیاری از اعمال میزبان خود موثر هستند. عمده­ترین بخش حضور ریزسازواره­ها منطقه ریشه­گاه است که در مجاورت ریشه گیاهان قرار دارد. سازواره­های همراه ریشه نقش مهمی در ارتقا رشد و سلامت میزبان دارند. شناسایی ترکیب جمعیتی این ژنوم مکمل، در علوم کشاورزی بسیار مهم است، چرا که می­تواند وابستگی کشت و زرع را به استفاده از کود­های شیمیایی مضرکم‌ترکند. براساس روش‌های مرسوم آزمایشگاهی شناسایی بخش عمده­ای از این جمعیت همچنان ناشناخته باقی‌مانده است زیرا کمتر از یک درصد جمعیت­های باکتریایی محیط­های خشکی امکان ایزوله­شدن در محیط‌های کشت خالص را دارند. روش­های توالی­یابی نسل جدید امکان شناسایی جمعیت­های میکروبی موجود در اکوسیستم­های مختلف را به‌صورت مستقل از کشت و از طریق تکنیکی با نام متاژنومیکس فراهم می­کنند. در این مقاله شناسایی باکتری­ها منطقه ریشه­گاه گندم در دو نقطه زمانی مرتبط با مراحل رشد رویشی و زایشی، در کشت دیم بدون تناوب، براساس توالی‌یابی ژن16SrRNA  انجام گرفت. براساس نتایج به‌دست آمده، شاخه­های باکتریایی پروتئوباکتری­ها، باکترویدت­ها، اکتینوباکتری­ها، سیانوباکتری­ها و جنس­های خاصی در این شاخه­ها الگوی توزیع متفاوتی را در این دو مرحله نشان دادند. نتایج نشان داد که گیاه می­تواند مجموعه خاصی از باکتری­ها را متناسب با مرحله نموی خود برای انجام اعمال خاص مطلوب در آن مرحله، برگزیند که نقش مهمی در حفظ سلامت آن‌ها دارد. ازآنجایی‌که، شناخت ساختار جمعیتی باکتری­های همراه ریشه، پیش­نیاز اصلی برای تعیین نقش تک­تک افراد جمعیت است، متاژنومیکس می­تواند پاسخ­های مهمی را در ارتباط با این بخش بزرگ غیرقابل­کشت فراهم کند.