زند ندا، فتوت رضا، رسولی دیاکو. آنالیز بیوانفورماتیکی EST ژنهای القاء شده در برنج بعد از تیمار بهوسیله بنزوتیادیازول . فصلنامه علمی ژنتیک نوین. 1397; 13 (3) :431-436
URL: http://mg.genetics.ir/article-1-79-fa.html
گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زنجان
چکیده: (2255 مشاهده)
مقاومت القایی (IR) نوعی از مقاومت است که هم با آلودگی با مواد بیولوژیکی قبل از آلودگی با پاتوژن و هم بهوسیله تیمار با مواد شیمیایی فعال میشود. یکی از مهمترین انواع آن، که بیشترین مطالعات بر روی آن انجام شده، مقاومت اکتسابی سیستمیک (SAR) است که نقش مهمی در مقاومت به بیماریها در گیاهان بهعهده دارد. برخی از مواد شیمیایی باعث ایجاد SAR در گیاهان میشوند. بنزوتیادیازول (BTH) از جمله مواد شیمیایی مؤثر است که کاربرد خارجی آن بهعنوان یک ترکیب جدید برای کنترل بیماریها شناخته شده میباشد که پاسخ آن در سرتاسر گیاه انتقال مییابد و پاسخهای دفاعی در مقابل بیماری را افزایش میدهد. بهمنظور بررسی مکانیسمهای فعالیت بیوشیمیایی BTH و ژنهای القا شده توسط آن، دادههای توالی ESTهای مربوط به BTH در برنج از سایت NCBI اخذ شدند. با دستهبندی و هم گذاری حدود 370 توالی EST برنج بعد از تیمار با BTH 33 کانتیگ و 234 سینگلتون تشکیل شد، سپس گروههای کارکردی مشخص و با انجام مقایسه بین دو کتابخانه ژنهای مشترک تعیین شدند. نتایج حاصل از این تحقیق مشخص کرد که پس از کاربرد BTH در برنج پروتئینهای کیناز، LHCB، OEEP، همچنین آنزیم کربنیک انهیدراز و نیز آنزیم Ribulose بیان میشوند. در این مطالعه برای نخستین بار تاثیر BTHبر دستگاه فتوسنتزی گیاهان مشاهده شد، همچنین مسیرهای سیگنالدهی دفاعی در برنج را پس از تیمار با BTH مشخص کرد. در این مطالعه ژنهایی که ممکن است در تنظیم مکانیسمهای دفاعی گیاه در برابر بیماریها دخالت داشته باشند شناسایی شدند. این نوع مطالعات بیوانفورماتیکی میتواند در طرحهای اصلاحی برای توسعه واریتههای متحمل در برابر بیماریها کمککننده باشد.
نوع مطالعه:
پژوهشي کوتاه |
موضوع مقاله:
ژنتیک گیاهی دریافت: 1396/1/14 | پذیرش: 1396/12/13 | انتشار: 1398/7/10