آللهای جدید شناسائیشده مکان ژنی خودناسازگاری گلابی معمولی، نامگذاری مجدد و همولوژی بالای برخی این آللها، سبب تداخل در بررسی و طبقهبندی آنها شدهاست. تحقیق اخیر با هدف مرور جامع بیوانفورماتیک و بررسی ساختار ژنتیکی کلیه 27 آلل S شناسائیشده این گونه و بررسی این آللها در برخی ارقام تجاری و بومی گلابی ایران بر اساس این اطلاعات بیوانفورماتیک و مقایسه با گزارشات قبل انجام شد. نتایج نشاندهنده وجود توالی کامل 21 آلل این گونه بود که بهصورت نواحی 13 گانه شامل پیشرانه، پنج ناحیه حفاظتشده C1 تا C5، اینترون و 6 ناحیه بینابینی خطی و حفاظتشدگی قابلتوجهی در ناحیه پیشرانه و سیگنال، به غیر از نواحی C1 تا C5 مشاهده شد. همچنین در ناحیه پیشرانه اغلب آللها، حداقل دو جایگاه CAAT و دو جایگاه نزدیک و یا بههم چسبیده TAAT مشاهده شد. تجزیه خوشهای بخشهای مختلف آللها، بیانگر شباهت کامل پلیپپتیدی دو آلل S119 و S121 بود، لیکن از نظر اینترون تفاوت جزئی در طول و توالی داشته که دلیل اشتباهات ارزیابی آللهای برخی ارقام داخلی نظیر رقم درگزی بود. مقایسه نتایج بررسی آللهای خودناسازگاری در برخی از ارقام بومی با استفاده از نتاج بیوانفورماتیک نشانداد، استفاده از آغازگرهای اختصاصی، روش کاملاً قابلاعتمادی در شناسائی این آللها خصوصاً در ارقام دارای جریان ژنی دیگر گونهها نیست. بررسی آللهای خودناسازگاری ارقام نشاندهنده حضور آلل S104 در ارقام شاهد کوشیا و بورهدیل و رقم کروسسیحان (Krus Siehan)، S108 در کروسالون (Krusalun)، S107 در شاهمیوه و شکری، S119 در اسفراینی و درگزی، S35 گونه P. ussuriensis در ارقام کفتربچه، شیرین ترکان و کنجونی و S19 گونه P. × bretschneideri بهعنوان دیگر آلل رقم شکری بود. نتایج ضمن تایید گزارشات قبلی وجود جریان ژنی دیگر گونههای گلابی در تکامل ارقام بومی ایران، نشانگر اهمیت بررسی جامع بیوانفورماتیک آللهای جنس Pyrus در کنار هم بود.
بازنشر اطلاعات | |
![]() |
این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است. |