توالی‌یابی RNA در حال حاضر یک انتخاب مناسب جهت مطالعه ترانسکریپتوم گیاهان غیرمدل می‌باشد که با شناسایی سریع‌تر شبکه‌های ژنی و الگوهای ژن‌های تولیدکننده متابولیت‌های ثانویه، می‌تواند جهت افزایش این ترکیبات مؤثر واقع شود. در این مطالعه، به‌منظور شناسایی برخی ژن‌های دخیل در مسیر ساخت اسکلت ترپنوئیدی در سرشاخه‌های هوایی (برگ و گل) گیاه دارویی اسطوخودوس (Lavandula angustifolia cv. Hidcote) بااستفاده از توالی‌یابی RNA، با تکنیک پربازده Iluumina HiSeq2500 انجام گرفت. پس از کنترل کیفیت خوانش­ها با استفاده از نرم‌افزارهای FastQC و Trimmomatic، تعداد 306995557 خوانش با کیفیت مناسب تولید شد که بعد از یکپارچه‌سازی de novo با برنامه Evidentialgene، منجر به تولید 262412 یونی‌ژن با میانگین طول 07/1181 و N50 معادل 1633 نوکلئوتید شد. جهت شناسایی یونی‌ژن‌‌های مرتبط با مسیر بیوسنتزی اسکلت ترپنوئیدی، توالی یونی‌ژن‌‌ها در پایگاه KASS بارگذاری شد. در مجموع 17777 یونی‌ژن در 122 مسیر زیستی شناسایی شدند، مسیر "اسکلت ترپنوئید" با تعداد 88 یونی‌ژن از پر تعدادترین مسیرهای شناسایی‌شده از میان 1664 یونی ‌ژن مسیر بیوسنتز متابولیت‌های ثانویه بود. به‌طورکلی نتایج حاصل از تفسیر کارکردی ژن‌ها منتهی به شناسایی 27 ژن در مسیر بیوسنتز اسکلت ترپنوئید‌ها شد که شامل تمامی‌ژن‌های دو مسیر اصلی بیوسنتزی اسکلت ترپنوئیدی (مسیر سیتوزولی موالونیک‌اسید (MVA) و پلاستیدی متیل- اریترول- فسفات (MEP) از ابتدای مسیر تا تولید ایزوپنتنیل دی‌فسفات (IPP) بود. شناسایی توالی ژن‌های مسیرهای بیوسنتزی اسکلت ترپنوئیدی و عملکرد‌های مرتبط با آن می‌تواند پایه‌ای برای پژوهش‌های بعدی با پیشبرد اهداف مهندسی متابولیت این ژن‌ها شود.