دوره 13، شماره 1 - ( 7-1397 )                   جلد 13 شماره 1 صفحات 19-30 | برگشت به فهرست نسخه ها

XML English Abstract Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Asghari B, Dashab G, Banabazi M. Codon usage pattern of genes differentially expressed between two bovine subspecies (Bos indicus vs. Bos taurus). MGj. 2018; 13 (1) :19-30
URL: http://mg.genetics.ir/article-1-40-fa.html
اصغری اسفدن بتول، داشاب غلامرضا، بناءبازی محمدحسین. الگوی ترجیح کدونی در ژن‌های متفاوت بیان شده بین دو زیر گونه گاو ( Bos indicusوBos taurus ) . فصلنامه علمی ژنتیک نوین. 1397; 13 (1) :19-30

URL: http://mg.genetics.ir/article-1-40-fa.html


بخش پژوهش‌های بیوتکنولوژی، موسسه تحقیقات علوم دامی کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران
چکیده:   (939 مشاهده)

الگوی ترجیح کدونی (CUB)، به‌عنوان الگوی استفاده غیر­تصادفی از کدون­های مشابه که اسیدآمینه­های مختلف را در ژنوم رمز­گذاری می­کنند، تعریف می­شود که عوامل مختلفی از جمله جهش و انتخاب در شکل­گیری آن­ها مؤثر هستند و از آنجایی‌ که این الگوها مرتبط با بیان و ترجمه ژن­ها می­باشند، می­توان از آن­ها در فرآیند انتخاب دام‌ها بهره جست. در این مطالعه به بررسی الگوی ترجیح کدونی ژن­های متفاوت بیان شده ین دو جمعیت گاو هلشتاین و کلیستانی و ارتباط آن با بیان ژن پرداخته می­شود. در این مطالعه، از نتایج آنالیز بیان ژن افتراقی دو داده‌RNA-Seq  به‌ترتیب مربوط به ادغام 40 و 45 نمونه خون کامل از گاوهای ماده هلشتاین (Bos taurus) و کلیستانی (Bos indicus) استفاده شد. الگوی ترجیح کدونی بر اساس شاخص‌هایی ازجمله ENC، GC3S، CAI و GC برای ژن­های متفاوت بیان شده بین این دو جمعیت گاو محاسبه شد. آنالیز ترجیح کدونی برای نواحی ORF ژن­های متفاوت بیان شده بین دو جمعیت هلشتاین و کلیستانی نشان داد که همبستگی بالایی بین مقادیر شاخص GC کل و GC3S وجود دارد. این موضوع حاکی از تأثیر مقدار GC و جهش به‌عنوان عامل مهم در ایجاد کدون­های مختلف ­می­باشد. هم‌چنین، همبستگی بین شاخص ENC و GC3S نشان داد که جهش مهم­ترین عامل در شکل­گیری کدون­ها بوده است. همبستگی بین شاخص CAI، که عمدتاً برای پیش­بینی سطوح بیان ژن به کار می­رود، با شاخص ENC نشان‌دهنده ارتباط بین الگوی ترجیح کدونی و بیان ژن بود. این مطالعه مقایسه­ای بین نمونه­هایی از دو زیرگونه گاو، به درک بهتر ساز و کارهای تکاملی شکل­گیری الگوی ترجیح کدونی و نیز بررسی ارتباط آن با بیان ژن کمک می‌نماید.

متن کامل [PDF 522 kb]   (711 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشی کامل | موضوع مقاله: ژنتیک جانوری
دریافت: 1398/7/11 | پذیرش: 1398/7/8 | انتشار: 1398/7/8

ارسال نظر درباره این مقاله : نام کاربری یا پست الکترونیک شما:
CAPTCHA

ارسال پیام به نویسنده مسئول


بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.

کلیه حقوق این وب سایت متعلق به فصلنامه علمی ژنتیک نوین می باشد.

طراحی و برنامه نویسی : یکتاوب افزار شرق

© 2021 CC BY-NC 4.0 | فصلنامه علمی ژنتیک نوین

Designed & Developed by : Yektaweb